Anàlisi de la variació genètica de les regions CFTR i GBA en poblacions humanes de tot el món

Aquest treball és una contribució als estudis de diversitat del genoma humà i pretén estudiar la variació genètica existent a nivell mundial en dos gens, causants de malaltia, el gen CFTR i el gen GBA, en cromosomes d'individus sans. Mutacions en aquests gens produeixen la fibrosi quística i la...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Mateu Morante, Eva
Other Authors: Bertranpetit, Jaume, 1952-
Format: Doctoral Thesis
Language:Catalan
Published: Universitat Pompeu Fabra 2001
Subjects:
GBA
575
Online Access:http://hdl.handle.net/10803/7063
http://nbn-resolving.de/urn:isbn:8469987356
id ndltd-TDX_UPF-oai-www.tdx.cat-10803-7063
record_format oai_dc
spelling ndltd-TDX_UPF-oai-www.tdx.cat-10803-70632013-07-11T03:41:52ZAnàlisi de la variació genètica de les regions CFTR i GBA en poblacions humanes de tot el mónMateu Morante, EvaPolimorfismeMicrosatèl·litDiversitat humanaSubstitució nucleotídicaMalaltia de GaucherGBASeleccióGBASTRPsNucleotide substitutionMutationGaucher diseaseSelectionLinkage disequilibriumPKLRCFTRHaplotypeHuman diversityPKLRCystic fibrosisPolymorphismSNPsMicrosatelliteDesequilibri de lligamentFibrosi quísticaFreqüència al·lèlicaSNPsSTRPsMutacióHaplotipCFTRAllele frequency575Aquest treball és una contribució als estudis de diversitat del genoma humà i pretén estudiar la variació genètica existent a nivell mundial en dos gens, causants de malaltia, el gen CFTR i el gen GBA, en cromosomes d'individus sans. Mutacions en aquests gens produeixen la fibrosi quística i la malaltia de Gaucher respectivament. La fibrosi quística és la malaltia autosòmica recessiva més comuna en poblacions europees. La malaltia de Gaucher és la malaltia lisosòmica d'acumulació lipídica més freqüent. L'estudi analitza la variació genètica en diferents polimorfismes d'ambdós gens; reconstrueix els haplotips i analitza la seva distribució geogràfica; i analitza l'extensió i distribució geogràfica del desequilibri de lligament entre loci. Pel gen GBA, hem ampliat la regió, abastant fins al gen PKLR (que codifica per a la piruvat quinasa). A més a més, pel cas de CFTR, pot ajudar a entendre l'origen de les mutacions més freqüents causants de fibrosi quística.This work is a contribution to human genome diversity studies and it aims to study the world-wide genetic variation that exists in two disease genes, CFTR and GBA gene, in healthy chromosomes. Mutations in these genes are known to cause cystic fibrosis and Gaucher disease respectively. Cystic fibrosis is the most common severe autosomal recessive disease in patients of European descent. Gaucher disease is the most frequent lysosomal storage disorder. The study analyzes the genetic variation in CFTR and GBA polymorphisms; estimates haplotype frequencies and describes their geographic distribution; and measures linkage disequilibrium between loci. For GBA gene, we have extended the analysis covering PKLR gene (that encodes for a pyruvate kinase). Moreover, for CFTR gene, we have tried to understand the origin of the most common cystic fibrosis causing mutations.Universitat Pompeu FabraBertranpetit, Jaume, 1952-Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut2001-07-06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/7063urn:isbn:8469987356TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)catADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.info:eu-repo/semantics/openAccess
collection NDLTD
language Catalan
format Doctoral Thesis
sources NDLTD
topic Polimorfisme
Microsatèl·lit
Diversitat humana
Substitució nucleotídica
Malaltia de Gaucher
GBA
Selecció
GBA
STRPs
Nucleotide substitution
Mutation
Gaucher disease
Selection
Linkage disequilibrium
PKLR
CFTR
Haplotype
Human diversity
PKLR
Cystic fibrosis
Polymorphism
SNPs
Microsatellite
Desequilibri de lligament
Fibrosi quística
Freqüència al·lèlica
SNPs
STRPs
Mutació
Haplotip
CFTR
Allele frequency
575
spellingShingle Polimorfisme
Microsatèl·lit
Diversitat humana
Substitució nucleotídica
Malaltia de Gaucher
GBA
Selecció
GBA
STRPs
Nucleotide substitution
Mutation
Gaucher disease
Selection
Linkage disequilibrium
PKLR
CFTR
Haplotype
Human diversity
PKLR
Cystic fibrosis
Polymorphism
SNPs
Microsatellite
Desequilibri de lligament
Fibrosi quística
Freqüència al·lèlica
SNPs
STRPs
Mutació
Haplotip
CFTR
Allele frequency
575
Mateu Morante, Eva
Anàlisi de la variació genètica de les regions CFTR i GBA en poblacions humanes de tot el món
description Aquest treball és una contribució als estudis de diversitat del genoma humà i pretén estudiar la variació genètica existent a nivell mundial en dos gens, causants de malaltia, el gen CFTR i el gen GBA, en cromosomes d'individus sans. Mutacions en aquests gens produeixen la fibrosi quística i la malaltia de Gaucher respectivament. La fibrosi quística és la malaltia autosòmica recessiva més comuna en poblacions europees. La malaltia de Gaucher és la malaltia lisosòmica d'acumulació lipídica més freqüent. L'estudi analitza la variació genètica en diferents polimorfismes d'ambdós gens; reconstrueix els haplotips i analitza la seva distribució geogràfica; i analitza l'extensió i distribució geogràfica del desequilibri de lligament entre loci. Pel gen GBA, hem ampliat la regió, abastant fins al gen PKLR (que codifica per a la piruvat quinasa). A més a més, pel cas de CFTR, pot ajudar a entendre l'origen de les mutacions més freqüents causants de fibrosi quística. === This work is a contribution to human genome diversity studies and it aims to study the world-wide genetic variation that exists in two disease genes, CFTR and GBA gene, in healthy chromosomes. Mutations in these genes are known to cause cystic fibrosis and Gaucher disease respectively. Cystic fibrosis is the most common severe autosomal recessive disease in patients of European descent. Gaucher disease is the most frequent lysosomal storage disorder. The study analyzes the genetic variation in CFTR and GBA polymorphisms; estimates haplotype frequencies and describes their geographic distribution; and measures linkage disequilibrium between loci. For GBA gene, we have extended the analysis covering PKLR gene (that encodes for a pyruvate kinase). Moreover, for CFTR gene, we have tried to understand the origin of the most common cystic fibrosis causing mutations.
author2 Bertranpetit, Jaume, 1952-
author_facet Bertranpetit, Jaume, 1952-
Mateu Morante, Eva
author Mateu Morante, Eva
author_sort Mateu Morante, Eva
title Anàlisi de la variació genètica de les regions CFTR i GBA en poblacions humanes de tot el món
title_short Anàlisi de la variació genètica de les regions CFTR i GBA en poblacions humanes de tot el món
title_full Anàlisi de la variació genètica de les regions CFTR i GBA en poblacions humanes de tot el món
title_fullStr Anàlisi de la variació genètica de les regions CFTR i GBA en poblacions humanes de tot el món
title_full_unstemmed Anàlisi de la variació genètica de les regions CFTR i GBA en poblacions humanes de tot el món
title_sort anàlisi de la variació genètica de les regions cftr i gba en poblacions humanes de tot el món
publisher Universitat Pompeu Fabra
publishDate 2001
url http://hdl.handle.net/10803/7063
http://nbn-resolving.de/urn:isbn:8469987356
work_keys_str_mv AT mateumoranteeva analisidelavariaciogeneticadelesregionscftrigbaenpoblacionshumanesdetotelmon
_version_ 1716592659680722944