Oxydation des protéines par les espèces réactives de l'oxygène : l'importance de l'environnement protéique

• Main Author: Sjöberg, Béatrice
• Language: fra
• Published: Université de Franche-Comté 2013
• Subjects: [CHIM:ORGA] Chemical Sciences/Organic chemistry; [CHIM:ORGA] Chimie/Chimie organique; Spectroscopie Raman; Oxydation; Peroxyde d'hydrogène; Oxygène singulet; Spectroscopies de phosphorescence résolue en temps; Constante de vitesse de réaction; Proteine
• Online Access: http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01024104; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/01/02/41/04/PDF/these_A_SJOBERG_Beatrice_2013.pdf

Les espèces réactives de l'oxygène sont générées dans l'environnement biologique dans le cadre du métabolisme, mais elles peuvent aussi être produites en excès dans le cas de stress oxydatif provoqué par exemple par une exposition aux rayons UV. Dans le travail présenté ici, nous sommes intéressés par l'oxydation des protéines par deux de ces espèces réactives de l'oxygène : le peroxyde d'hydrogène, oxydant plutôt faible avec un temps de vie long, et l'oxygène singulet, oxydant fort avec un temps de vie court. L'action de ce dernier sur les protéines est étudiée en utilisant la spectroscopie de phosphorescence résolue en temps et l'oxydation des protéines par le peroxyde d'hydrogène est suivie par spectroscopie Raman. Dans ce cas, un travail préliminaire a été nécessaire afin d'attribuer de manière précise les bandes Raman des chaînes latérales des résidus d'acides aminés. Pour les deux types d'oxydations, les constantes de vitesse des réactions ont été déterminées pour trois protéines modèles. La stratégie suivie est d'utiliser de petits fragments de protéines tels que des acides aminés libres et des tripeptides pour comprendre ce qui se passe à l'échelle de la protéine. Cela nous aide à souligner l'importance de l'environnement protéique. Dans le cas de l'étude par spectroscopie Raman, l'influence du nombre de liaisons peptidiques sur les spectres obtenus depuis l'acide aminé libre, au tripeptide, jusqu'à la protéine est aussi mis en évidence.