ParKVFinder: A thread-level parallel approach in biomolecular cavity detection

by João Victor da Silva Guerra, Helder Veras Ribeiro Filho, Leandro Oliveira Bortot, Rodrigo Vargas Honorato, José Geraldo de Carvalho Pereira, Paulo Sérgio Lopes-de-Oliveira
Published 2020-07-01

Kinase Inhibitor Profile for Human Nek1, Nek6, and Nek7 and Analysis of the Structural Basis for Inhibitor Specificity

by Eduardo Cruz Moraes, Gabriela Vaz Meirelles, Rodrigo Vargas Honorato, Tatiana de Arruda Campos Brasil de Souza, Edmarcia Elisa de Souza, Mario Tyago Murakami, Paulo Sergio Lopes de Oliveira, Jörg Kobarg
Published 2015-01-01

Genes Controlled by DNA Methylation Are Involved in Wilms Tumor Progression

by João Victor da Silva Guerra, Bruna Maria de Sá Pereira, Jéssica Gonçalves Vieira da Cruz, Nicole de Miranda Scherer, Carolina Furtado, Rafaela Montalvão de Azevedo, Paulo Sergio Lopes de Oliveira, Paulo Faria, Mariana Boroni, Beatriz de Camargo, Mariana Maschietto
Published 2019-08-01

Structural analysis of intermolecular interactions in the kinesin adaptor complex fasciculation and elongation protein zeta 1/ short coiled-coil protein (FEZ1/SCOCO).

by Marcos Rodrigo Alborghetti, Ariane da Silva Furlan, Júlio César da Silva, Maurício Luís Sforça, Rodrigo Vargas Honorato, Daniela Campos Granato, Deivid Lucas dos Santos Migueleti, Jorge L Neves, Paulo Sergio Lopes de Oliveira, Adriana Franco Paes-Leme, Ana Carolina de Mattos Zeri, Iris Concepcion Linares de Torriani, Jörg Kobarg
Published 2013-01-01

Cryo-EM structure of the mature and infective Mayaro virus at 4.4 Å resolution reveals features of arthritogenic alphaviruses

by Helder V. Ribeiro-Filho, Lais D. Coimbra, Alexandre Cassago, Rebeca P. F. Rocha, João Victor da Silva Guerra, Rafael de Felicio, Carolina Moretto Carnieli, Luiza Leme, Antonio Cláudio Padilha, Adriana F. Paes Leme, Daniela B. B. Trivella, Rodrigo Villares Portugal, Paulo Sérgio Lopes-de-Oliveira, Rafael Elias Marques
Published 2021-05-01

Screening for PPAR Non-Agonist Ligands Followed by Characterization of a Hit, AM-879, with Additional No-Adipogenic and cdk5-Mediated Phosphorylation Inhibition Properties

by Helder Veras Ribeiro Filho, Helder Veras Ribeiro Filho, Natália Bernardi Videira, Natália Bernardi Videira, Aline Villanova Bridi, Thais Helena Tittanegro, Thais Helena Tittanegro, Fernanda Aparecida Helena Batista, José Geraldo de Carvalho Pereira, Paulo Sérgio Lopes de Oliveira, Marcio Chaim Bajgelman, Albane Le Maire, Albane Le Maire, Ana Carolina Migliorini Figueira, Ana Carolina Migliorini Figueira
Published 2018-02-01

The mechanism by which a distinguishing arabinofuranosidase can cope with internal di-substitutions in arabinoxylans

by Camila Ramos dos Santos, Priscila Oliveira de Giuseppe, Flávio Henrique Moreira de Souza, Letícia Maria Zanphorlin, Mariane Noronha Domingues, Renan Augusto Siqueira Pirolla, Rodrigo Vargas Honorato, Celisa Caldana Costa Tonoli, Mariana Abrahão Bueno de Morais, Vanesa Peixoto de Matos Martins, Lucas Miranda Fonseca, Fernanda Büchli, Paulo Sergio Lopes de Oliveira, Fábio Cesar Gozzo, Mário Tyago Murakami
Published 2018-08-01

Molecular and cellular basis of hyperassembly and protein aggregation driven by a rare pathogenic mutation in DDX3X

by Matheus de Castro Fonseca, Juliana Ferreira de Oliveira, Bruno Henrique Silva Araujo, Camila Canateli, Paula Favoretti Vital do Prado, Dionísio Pedro Amorim Neto, Beatriz Pelegrini Bosque, Paulla Vieira Rodrigues, João Vitor Pereira de Godoy, Katiane Tostes, Helder Veras Ribeiro Filho, Andrey Fabricio Ziem Nascimento, Angela Saito, Celisa Caldana Costa Tonoli, Fernanda Aparecida Heleno Batista, Paulo Sergio Lopes de Oliveira, Ana Carolina Figueira, Silvia Souza da Costa, Ana Cristina Victorino Krepischi, Carla Rosenberg, Harry Westfahl, Jr., Antônio José Roque da Silva, Kleber Gomes Franchini
Published 2021-08-01

Hydrocephalus and arthrogryposis in an immunocompetent mouse model of ZIKA teratogeny: A developmental study.

by Jose Xavier-Neto, Murilo Carvalho, Bruno Dos Santos Pascoalino, Alisson Campos Cardoso, Ângela Maria Sousa Costa, Ana Helena Macedo Pereira, Luana Nunes Santos, Ângela Saito, Rafael Elias Marques, Juliana Helena Costa Smetana, Silvio Roberto Consonni, Carla Bandeira, Vivian Vasconcelos Costa, Marcio Chaim Bajgelman, Paulo Sérgio Lopes de Oliveira, Marli Tenorio Cordeiro, Laura Helena Vega Gonzales Gil, Bianca Alves Pauletti, Daniela Campos Granato, Adriana Franco Paes Leme, Lucio Freitas-Junior, Carolina Borsoi Moraes Holanda de Freitas, Mauro Martins Teixeira, Estela Bevilacqua, Kleber Franchini
Published 2017-02-01

Caracterização de sítios conformacionais de fosforilação em proteínas

by Felipe Augusto Nunes Ferraz
Published 2016

Redes neurais residuais profundas e autômatos celulares como modelos para predição que fornecem informação sobre a formação de estruturas secundárias proteicas

by José Geraldo de Carvalho Pereira
Published 2018

Implementação de uma abordagem híbrida utilizando modelagem comparativa e ab initio para predição de estruturas tridimensionais de proteínas contendo múltiplos domínios com conecto...

by Rodrigo Vargas Honorato
Published 2015

Implicações funcionais de eventos de splicing alternativo no proteoma humano

by Fabio Passetti
Published 2007

Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica

by Marcio Augusto Afonso de Almeida
Published 2010

Desenvolvimento de um algoritmo para identificação e caracterização de cavidades em regiões específicas de estruturas tridimensionais de proteínas

by Saulo Henrique Pires de Oliveira
Published 2011

Análise da via de regulação gênica por ácido retinóico: uma abordagem por bioinformática e biologia estrutural

by Tiago José Paschoal Sobreira
Published 2008

Utilização de informações termodinâmicas e estruturais na predição de sítios de ligação de receptores nucleares ao DNA: uma abordagem computacional

by Ana Claudia Mancusi Valeije
Published 2015