Identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à microRNAs.

Splicing é o processo de remoção de introns e ligação de exons em eucariotos. É realizado pelo spliceossomo, um complexo macromolecular composto por RNAs e mais de cem proteínas. Alguns introns possuem microRNAs, os quais devem ser processados para gerar moléculas maduras. O cluster intrônico miR-17...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Paiva, Marcelo Machado
Other Authors: Coltri, Patricia Pereira
Format: Others
Language:pt
Published: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP 2016
Subjects:
RNA
Online Access:http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42134/tde-10112016-101050/
id ndltd-usp.br-oai-teses.usp.br-tde-10112016-101050
record_format oai_dc
spelling ndltd-usp.br-oai-teses.usp.br-tde-10112016-1010502019-05-09T19:00:04Z Identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à microRNAs. Identification of splicing regulatory proteins associated to microRNAs. Paiva, Marcelo Machado Splicing Células cultivadas de tumor MicroRNA MicroRNA miR-17-92 miR-17-92 RNA RNA Splicing Tumour cultivated cells Splicing é o processo de remoção de introns e ligação de exons em eucariotos. É realizado pelo spliceossomo, um complexo macromolecular composto por RNAs e mais de cem proteínas. Alguns introns possuem microRNAs, os quais devem ser processados para gerar moléculas maduras. O cluster intrônico miR-17-92 é composto por sete miRNAs que têm sido associados ao desenvolvimento de diferentes tumores em vários tecidos. Neste trabalho o splicing de dois miRNAs deste cluster foi analisado em células HeLa, BCPAP e TPC-I. Os resultados mostraram que introns com miR19a tem o splicing mais eficiente do que aqueles com miR18a em todas as três células analisadas. Além disso, a composição dos spliceossomos foi analisada por espectrometria de massas. Entre as principais proteínas encontradas, destaca-se a presença das hnRNPs, como hnRNP_A1 e hnRNP_A2/B1. Estes resultados são importantes para entender como esses miRNAs são processados, e quais são os principais componentes recrutados em diferentes tipos celulares. Pre-mRNA splicing is the process of intron removal and exon ligation in eukaryotes. It is performed by the spliceosome, a multi-megadalton machinery composed of RNAs and more than a hundred proteins. Intronic miRNAs must be processed from the host gene to generate mature molecules. miR-17-92 is an intronic cluster composed of seven miRNAs which have been associated to the development of different tumors, in several different cells. In this work, we analyzed the splicing of two miRNAs belonging to this cluster in HeLa, BCPAP and TPC-I cells. Interestingly, we observed miR19a is more efficiently spliced than miR18a in all three cells. We also searched for specific proteins that can be involved in their respective splicing process. We observed hnRNP proteins are especially concentrated in spliceosomes assembled in introns containing these miRNAs, based on mass spectrometry data. These results are important to understand how these miRNAs are spliced and matured and also can explain their different expression levels in different cells. Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Coltri, Patricia Pereira 2016-08-31 Dissertação de Mestrado application/pdf http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42134/tde-10112016-101050/ pt Liberar o conteúdo para acesso público.
collection NDLTD
language pt
format Others
sources NDLTD
topic Splicing
Células cultivadas de tumor
MicroRNA
MicroRNA
miR-17-92
miR-17-92
RNA
RNA
Splicing
Tumour cultivated cells
spellingShingle Splicing
Células cultivadas de tumor
MicroRNA
MicroRNA
miR-17-92
miR-17-92
RNA
RNA
Splicing
Tumour cultivated cells
Paiva, Marcelo Machado
Identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à microRNAs.
description Splicing é o processo de remoção de introns e ligação de exons em eucariotos. É realizado pelo spliceossomo, um complexo macromolecular composto por RNAs e mais de cem proteínas. Alguns introns possuem microRNAs, os quais devem ser processados para gerar moléculas maduras. O cluster intrônico miR-17-92 é composto por sete miRNAs que têm sido associados ao desenvolvimento de diferentes tumores em vários tecidos. Neste trabalho o splicing de dois miRNAs deste cluster foi analisado em células HeLa, BCPAP e TPC-I. Os resultados mostraram que introns com miR19a tem o splicing mais eficiente do que aqueles com miR18a em todas as três células analisadas. Além disso, a composição dos spliceossomos foi analisada por espectrometria de massas. Entre as principais proteínas encontradas, destaca-se a presença das hnRNPs, como hnRNP_A1 e hnRNP_A2/B1. Estes resultados são importantes para entender como esses miRNAs são processados, e quais são os principais componentes recrutados em diferentes tipos celulares. === Pre-mRNA splicing is the process of intron removal and exon ligation in eukaryotes. It is performed by the spliceosome, a multi-megadalton machinery composed of RNAs and more than a hundred proteins. Intronic miRNAs must be processed from the host gene to generate mature molecules. miR-17-92 is an intronic cluster composed of seven miRNAs which have been associated to the development of different tumors, in several different cells. In this work, we analyzed the splicing of two miRNAs belonging to this cluster in HeLa, BCPAP and TPC-I cells. Interestingly, we observed miR19a is more efficiently spliced than miR18a in all three cells. We also searched for specific proteins that can be involved in their respective splicing process. We observed hnRNP proteins are especially concentrated in spliceosomes assembled in introns containing these miRNAs, based on mass spectrometry data. These results are important to understand how these miRNAs are spliced and matured and also can explain their different expression levels in different cells.
author2 Coltri, Patricia Pereira
author_facet Coltri, Patricia Pereira
Paiva, Marcelo Machado
author Paiva, Marcelo Machado
author_sort Paiva, Marcelo Machado
title Identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à microRNAs.
title_short Identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à microRNAs.
title_full Identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à microRNAs.
title_fullStr Identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à microRNAs.
title_full_unstemmed Identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à microRNAs.
title_sort identificação de proteínas reguladoras do splicing associadas à micrornas.
publisher Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publishDate 2016
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42134/tde-10112016-101050/
work_keys_str_mv AT paivamarcelomachado identificacaodeproteinasreguladorasdosplicingassociadasamicrornas
AT paivamarcelomachado identificationofsplicingregulatoryproteinsassociatedtomicrornas
_version_ 1719058277020467200