Rôle des gènes homologues à terD dans le cycle vital de Streptomyces coelicolor
Les streptomycètes, des bactéries au développement morphologique complexe, sont étudiés depuis des décennies en raison de leurs caractéristiques particulières incluant leur capacité à produire une grande diversité d'enzymes hydrolytiques et de molécules complexes telle que des centaines d'...
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Université de Sherbrooke
2010
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ndltd-usherbrooke.ca-oai-savoirs.usherbrooke.ca-11143-58362016-04-07T05:24:59Z Rôle des gènes homologues à terD dans le cycle vital de Streptomyces coelicolor Sanssouci, Édith Beaulieu, Carole Méthylation Protéomique Tellurite Stress Sporulation Morphologie Différenciation Streptomycète Les streptomycètes, des bactéries au développement morphologique complexe, sont étudiés depuis des décennies en raison de leurs caractéristiques particulières incluant leur capacité à produire une grande diversité d'enzymes hydrolytiques et de molécules complexes telle que des centaines d'antibiotiques. Streptomyces coelicolor est l'organisme modèle pour l'étude des streptomycètes et le séquençage de son génome a ouvert la voie à l'étude de centaines de gènes dont la fonction est jusqu'à présent inconnue. La protéine TerD du Serratia marcescens joue un rôle dans la résistance au tellurite chez cet organisme. Plusieurs orthologues de cette protéine ont été identifiés chez le S. coelicolor. Sur la base de la similarité de leurs séquences avec la protéine TerD, ces protéines du S. coelicolor ont été désignées comme des protéines de résistance au tellurite. Ces mêmes protéines ont été identifiées comme étant induites ou réprimées dans de nombreuses conditions exemptes de tellurite, laissant croire qu'elles participent à d'autres voies métaboliques. Au cours de ce travail de doctorat, des souches mutantes du S. coelicolor ont été produites pour les gènes SCO2367, SCO2368 et SC04277, trois gènes homologues à ter D, afin d'évaluer les répercussions de la perte de ces gènes chez la bactérie.Les souches ont été caractérisées morphologiquement et nous avons démontré que la délétion de ces gènes nuit sérieusement au développement de la bactérie, à la production de spores et à la vitesse de croissance. Parallèlement, une approche protéomique a été utilisée afin de caractériser les effets de la délétion ou de la surexpression du gène SCO2368 sur la biosynthèse des protéines intracellulaires et extracellulaires de la bactérie. Ceci a permis de démontrer qu'une grande quantité de protéines reliées au stress sont induites chez les deux souches mutantes, laissant présumer qu'un déséquilibre dans le taux de cette protéine induit un stress physiologique important. Par ailleurs, différentes isoformes de la protéine SCO2368 ont été identifiées tant au niveau intracellulaire que dans le milieu extracellulaire. Par l'analyse des modifications post-traductionnelles de ces isoformes, nous avons prouvé que celles-ci étaient méthylées sur plusieurs acides aminés. De plus, nous avons démontré que la transcription du gène SCO2368 n'est pas induite par la présence de tellurite. Ces résultats démontrent que les gènes homologues à ter D ont une autre fonction que la résistance au tellurite et qu'ils jouent vraisemblablement un rôle dans la morphogénèse. 2010 Thèse 9780494706183 http://hdl.handle.net/11143/5836 fre © Édith Sanssouci Université de Sherbrooke |
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Méthylation Protéomique Tellurite Stress Sporulation Morphologie Différenciation Streptomycète Sanssouci, Édith Rôle des gènes homologues à terD dans le cycle vital de Streptomyces coelicolor |
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Les streptomycètes, des bactéries au développement morphologique complexe, sont étudiés depuis des décennies en raison de leurs caractéristiques particulières incluant leur capacité à produire une grande diversité d'enzymes hydrolytiques et de molécules complexes telle que des centaines d'antibiotiques. Streptomyces coelicolor est l'organisme modèle pour l'étude des streptomycètes et le séquençage de son génome a ouvert la voie à l'étude de centaines de gènes dont la fonction est jusqu'à présent inconnue. La protéine TerD du Serratia marcescens joue un rôle dans la résistance au tellurite chez cet organisme. Plusieurs orthologues de cette protéine ont été identifiés chez le S. coelicolor. Sur la base de la similarité de leurs séquences avec la protéine TerD, ces protéines du S. coelicolor ont été désignées comme des protéines de résistance au tellurite. Ces mêmes protéines ont été identifiées comme étant induites ou réprimées dans de nombreuses conditions exemptes de tellurite, laissant croire qu'elles participent à d'autres voies métaboliques. Au cours de ce travail de doctorat, des souches mutantes du S. coelicolor ont été produites pour les gènes SCO2367, SCO2368 et SC04277, trois gènes homologues à ter D, afin d'évaluer les répercussions de la perte de ces gènes chez la bactérie.Les souches ont été caractérisées morphologiquement et nous avons démontré que la délétion de ces gènes nuit sérieusement au développement de la bactérie, à la production de spores et à la vitesse de croissance. Parallèlement, une approche protéomique a été utilisée afin de caractériser les effets de la délétion ou de la surexpression du gène SCO2368 sur la biosynthèse des protéines intracellulaires et extracellulaires de la bactérie. Ceci a permis de démontrer qu'une grande quantité de protéines reliées au stress sont induites chez les deux souches mutantes, laissant présumer qu'un déséquilibre dans le taux de cette protéine induit un stress physiologique important. Par ailleurs, différentes isoformes de la protéine SCO2368 ont été identifiées tant au niveau intracellulaire que dans le milieu extracellulaire. Par l'analyse des modifications post-traductionnelles de ces isoformes, nous avons prouvé que celles-ci étaient méthylées sur plusieurs acides aminés. De plus, nous avons démontré que la transcription du gène SCO2368 n'est pas induite par la présence de tellurite. Ces résultats démontrent que les gènes homologues à ter D ont une autre fonction que la résistance au tellurite et qu'ils jouent vraisemblablement un rôle dans la morphogénèse. |
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