Facteurs physiologiques modulant la production de thaxtomine chez streptomyces scabies

• Main Author: Lauzier, Annie
• Other Authors: Beaulieu, Carole
• Language: French
• Published: Université de Sherbrooke 2007
• Online Access: http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4943

La thaxtomine est un facteur de virulence important dans le cadre de la gale commune de la pomme de terre, maladie végétale causée par Streptomyces scabies (Streptomyces scabiei ). Dans les travaux de mon doctorat, nous avons démontré que la synthèse in vivo de la toxine était inhibée par trois acides aminés aromatiques, la tyrosine, le tryptophane et la phénylalanine. Nous avons démontré que l'inhibition par le tryptophane était un phénomène retrouvé chez cinq souches de S. scabies et qu'elle était dépendante de la dose de l'acide aminé. Par des tests d'incorporation de radioactivité, nous avons pu établir que le tryptophane et la phénylalanine étaient des précurseurs de synthèse de la thaxtomine A mais pas la tyrosine. Nous savions que la thaxtomine n'était pas synthétisée dans un milieu minimal et que la bactérie avait besoin de la présence d'un composé végétal pour initier la synthèse de la toxine. La subérine est un polymère complexe retrouvé dans la paroi cellulaire végétale qui, lorsque ajouté au milieu de culture de S. scabies, permet la production de thaxtomine A. L'effet de la subérine sur la physiologie bactérienne n'est pas connu. Nous avons utilisé deux approches, la protéomique et la transcriptomique, pour analyser l'effet de ce composé végétal sur le métabolisme microbien de S. scabies. L'électrophorèse en 2 dimensions suivie de l'analyse des protéines par séquençage N-terminal ou par spectre de masse (MS/MS), nous a permis d'identifier 20 protéines de S. scabies induites par la subérine. Parallèlement, plus de 50 gènes exprimés par le S. scabies en présence de subérine ont été identifiés par la construction d'une banque d'ADNc provenant des ARNm exprimés après 12H de croissance en présence du polymère. Nous avons confirmé que 10 de ces gènes étaient induits par la subérine à l'aide de la technique du PCR en temps réel. Les deux approches ont permis d'identifier des protéines et des gènes de S. scabies régulés positivement par la présence de la subérine. Ces gènes et ces protéines sont impliqués dans le métabolisme énergétique, la synthèse ou la régulation des acides aminés et des acides nucléiques, les mécanismes de transport, l'hydrolyse de composés chimiques, les mécanismes de résistance au stress et le métabolisme secondaire.