Analyse fonctionnelle de promoteurs dans un contexte de stress chez le peuplier

• Main Author: Ayotte, Jocelyne
• Other Authors: Beaudoin, Nathalie
• Language: French
• Published: Université de Sherbrooke 2010
• Online Access: http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4873

Le peuplier demeure un système de choix pour l'étude des végétaux, entre autres à cause de son génome relativement petit et entièrement séquencé. Sous nos latitudes, il est l'une des espèces à croissance rapide les plus utilisées dans les plantations d'arbres. La monoculture - comme chez tous les végétaux d'ailleurs - le rend plus sujet aux maladies. Les facteurs de transcription WRKY, présents chez une majorité d'eucaryotes (excepté les mammifères et les levures), sont souvent impliqués dans les mécanismes de défense des végétaux. Plus particulièrement, le facteur WRKY23 du peuplier semble avoir une fonction dans la lutte contre la maladie de la rouille. Les WRKY se lient aux boîtes W situées dans les séquences promotrices des gènes qu'ils régulent. Il semble que les séquences promotrices des gènes reliés à la défense ont un enrichissement de boîtes W, comparativement à un ensemble de séquences promotrices choisies au hasard. Un groupe de séquences promotrices dont les gènes sont dérégulés dans des plants de peuplier surexprimant PtWRKY23 a été sélectionné pour cette étude; ces séquences ont été choisies car leurs gènes sont potentiellement régulés par PtWRKY23. Ici, les séquences promotrices de gènes dérégulés dans des peupliers surexpresseurs de PtWRKY23 ne contiennent pas plus de boîtes W qu'un groupe de promoteurs sur lequel la surexpression de PtWRKY23 ne semble pas avoir d'effet. De plus, l'emplacement des boîtes W ne semble pas conservé entre les séquences promotrices du peuplier et celles de la plante modèle Arabidopsis. Un système de transformation transitoire sur cellules de peuplier en suspension a été mis au point pour permettre l'étude d'interactions directes et indirectes entre PtWRKY23 et des séquences promotrices de gènes impliqués dans la défense. D'ailleurs, l'ajout de l'exogène PtWRKY23 sous la gouverne d'un promoteur constitutif augmente la production du produit du gène rapporteur GUS sous le contrôle de la séquence promotrice d'une chalcone synthase, CHS3. Voilà une première interaction potentielle avec PtWRKY23, qui pourrait éclaircir le rôle de PtWRKY23 dans les réactions de défense.