The impact of SARS-CoV-2 viral load on the mortality of hospitalized patients. A retrospective analysis

Introdução: A COVID-19 é a doença provocada pelo vírus síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2). O método de diagnóstico de eleição é a reação de polimerase em cadeia por transcriptase reversa em tempo real (RT-PCR) em amostras respiratórias. Pretende-se avaliar o impacto da carga vírica de...

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Main Author: António Pedro Marques da Silva Machado
Other Authors: Faculdade de Medicina
Format: Others
Language:English
Published: 2021
Subjects:
Online Access:https://hdl.handle.net/10216/134409
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topic Medicina clínica
Clinical medicine
Ciências médicas e da saúde::Medicina clínica
Medical and Health sciences::Clinical medicine
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Ciências médicas e da saúde::Medicina clínica
Medical and Health sciences::Clinical medicine
António Pedro Marques da Silva Machado
The impact of SARS-CoV-2 viral load on the mortality of hospitalized patients. A retrospective analysis
description Introdução: A COVID-19 é a doença provocada pelo vírus síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2). O método de diagnóstico de eleição é a reação de polimerase em cadeia por transcriptase reversa em tempo real (RT-PCR) em amostras respiratórias. Pretende-se avaliar o impacto da carga vírica de SARS-CoV-2 em amostras da nasofarínge no prognóstico de doentes com COVID-19. Materiais e Métodos: Estudo retrospetivo de coorte em doentes com COVID-19 internados entre 17 de Março de 2020 e 1 de Junho de 2020. A carga vírica do SARS-CoV-2 foi avaliada pelos valores do Cycle Threshold (Ct) dos testes de RT-PCR obtidos de zaragatoas nasofaríngeas realizadas à admissão. Avaliaram-se as características clínicas e comparam-se os sobreviventes aos não sobreviventes. Através de análise multivariada, avaliou-se se o impacto de várias características em simultâneo na mortalidade intra-hospitalar aos 30 dias. Resultados: 197 pacientes foram incluídos. Verificou-se uma mortalidade intra-hospitalar a 30 dias em 71 (36%) pacientes. O Ct para o gene E (OR .873; IC 95% .769-.992; p .037), assim como a idade, o número de dias de sintomas até à admissão, a LDH, e o rácio SatO2/FiO2 correlacionaram-se de forma independente com a mortalidade intra-hospitalar a 30 dias. Discussão: Os nossos resultados estão de acordo com dados publicados previamente. Uma limitação do nosso estudo poderá ser a maior gravidade dos casos dado tratarem-se apenas de doentes internados. Conclusão: A carga vírica à admissão pode ser um preditor da mortalidade intra-hospitalar a 30 dias em doentes com COVID-19 hospitalizados. Este tipo de informação pode potencialmente auxiliar profissionais de saúde na estratificação do risco. === Introduction: COVID-19 has emerged worldwide since December 2019. The standard method for diagnosis is via Nucleic acid amplification testing, usually with a reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Hospitalized infected individuals may require ventilation and may have higher mortality rates. We aim to evaluate the clinical impact of nasopharyngeal viral load on these outcomes. Materials and Methods: We conducted a retrospective cohort study of patients hospitalized with COVID-19 from 17 March 2020 to 1 June 2020 at tertiary care hospital. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) viral load was assessed using cycle threshold (Ct) values from a RT-PCR assay applied to nasopharyngeal swab samples. We compared the clinical characteristics of survivors vs. non-survivors and assessed whether viral load was independently associated with in-hospital 30-day mortality. Results: We evaluated 197 patients. 30-day mortality was verified in 71 (36%) subjects. In the adjusted effects model, only the E-gene Ct value (OR .873; IC 95% .769-.992; p .037), age, the number of days of symptoms before admission, LDH, and the SatO2-to-FiO2 ratio remained significantly associated with 30-day mortality. There was no identified association between the viral loads and disease severity, the need for ventilation or length of stay. Discussion: Our results are, in part, concordant with previous papers. One possible limitation to our study is the fact that possibly included disproportionately more patients with poorer outcomes, since hospitalization was required. Therefore, further research is required. Conclusion: SARS-CoV-2 viral load on admission may be an independent predictor of 30-day mortality among hospitalized patients with COVID-19. Providing this information to clinicians could potentially be used to guide risk stratification.
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