De novo algorithms to identify patterns associated with biological events in de Bruijn graphs built from NGS data

De novo algorithms to identify patterns associated with biological events in de Bruijn graphs built from NGS data

L'objectif principal de cette thèse est le développement, l'amélioration et l'évaluation de méthodes de traitement de données massives de séquençage, principalement des lectures de séquençage d'ARN courtes et longues, pour éventuellement aider la communauté à répondre à certaines...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Ishi Soares de Lima, Leandro
Other Authors: Lyon
Language:en
Published: 2019
Subjects:
ARN-seq
Lectures courtes
Lectures longues
Épissage alternatif
Graphes de De Bruijn
Bulles
Études d'association à l'échelle des génomes
Correction d'erreurs
RNA-seq
Short reads
Long reads
Alternative splicing
De Bruijn graphs
Bubbles
Genome-wide association studies
Error-correction
570.15
Online Access:http://www.theses.fr/2019LYSE1055/document

Internet

http://www.theses.fr/2019LYSE1055/document

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