Full Bayesian boolean network inference based on Markov chain Monte Carlo algorithms.

在生物信息學中, 基因調控網絡推斷不斷受到人們的重視。各種不同的網絡模型被用來描述基因之間的調控關係, 其中包括布爾網絡, 概率布爾網絡, 貝葉斯網絡等。本文主要是討論基於數據的布爾網絡推斷。現在已經有很多方法來推斷節點是離散變量的網絡結構。比如REVEAL算法,Best Fit Extension 算法是兩種比較受歡迎的推斷網絡結構方法。並且他們在網絡的節點數目不是很多的情況下有很好的表現。然而, 現今很多方法對噪音和模型的不確定性沒有足夠的考慮。這也使得這些方法在實際應用中的表現不是很令人滿意。本文中, 我們用完全貝葉斯的方法去研究概率布爾網絡空間。在給定樣本的情況下, 我們提出了一種新的...

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Bibliographic Details
Other Authors: Han, Shengtong.
Format: Others
Language:English
Chinese
Published: 2012
Subjects:
Online Access:http://library.cuhk.edu.hk/record=b5549487
http://repository.lib.cuhk.edu.hk/en/item/cuhk-328449