Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser

Under senare år har en särskilt hög resistensutveckling observerats hos gramnegativa bakterier inom familjen Enterobacteriaceae. Den främsta resistensmekanismen utgör produktion av så kallade "extended-spectrum β-lactamases" (ESBL) och särskilt oroväckande är karbapenemaser (ESBLCARBA) som...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Saad, Bessem
Format: Others
Language:Swedish
Published: Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper 2020
Subjects:
Online Access:http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-84598
id ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-oru-84598
record_format oai_dc
spelling ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-oru-845982020-07-16T05:19:37ZMatrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemasersweMatrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry as a tool for detecting degradation of Ceftolozane/Tazobactam caused by carbapenemasesSaad, BessemÖrebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper2020MALDI-TOF MSCeftolozane/TazobactamcarbapenemaseshydrolysisdecarboxylationMALDI-TOF MSCeftolozan/TazobaktamkarbapenemaserhydrolysdekarboxyleringBiomedical Laboratory Science/TechnologyBiomedicinsk laboratorievetenskap/teknologiUnder senare år har en särskilt hög resistensutveckling observerats hos gramnegativa bakterier inom familjen Enterobacteriaceae. Den främsta resistensmekanismen utgör produktion av så kallade "extended-spectrum β-lactamases" (ESBL) och särskilt oroväckande är karbapenemaser (ESBLCARBA) som har förmåga att bryta ner ett flertal olika grupper av β-laktamantibiotika. Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) har utforskats som metod för snabb detektion av karbapenemasaktivitet genom analys av nedbrytning av antibiotika. Syftet med denna studie var att utvärdera om MALDI-TOF MS kan användas som metod för att detektera enzymatisk nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam samt att undersöka vilka enzymer som uppvisar nedbrytning av antibiotikan. Sju karbapenemasproducerande isolat och en β-laktamasnegativ kontrollstam användes i studien. Isolaten inkuberades 120 min respektive 270 min med antibiotika (1mg/ml) i en buffertlösning (0,08% ammoniumbikarbonat, pH 8). Efter centrifugering analyserades supernatanten med MALDI-TOF MS. Nedbrytning av Ceftolozan detekterades hos samtliga karbapenemasproducerande stammar, utom hos E. coli med NDM-1 produktion. Nedbrytningstoppar av Tazobaktam detekterades emellertid enbart hos stammar med OXA-48 och NDM-7 produktion. Tydligast nedbrytning sågs efter 120 min. För tydligare visualisering av nedbrytningstoppar bör metoden dock optimeras med avseende på matrix, buffert och antibiotikakoncentration. In recent years, an alarming increase of antibiotic resistance has been observed in Gram-negative bacteria, classified in the family Enterobacteriaceae. The main resistance mechanism is the production of extended-spectrum β-lactamases (ESBL). Particularly worrisome is the production of carbapenemases (ESBLCARBA) due to their ability to hydrolyze a broad range of β-lactams. Recently, Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) has been investigated as a method for rapid detection of carbapenemase activity through observation of antibiotic degradation. The aim of this study was to investigate whether MALDI-TOF MS can be used as a method to detect degradation of Ceftolozane/Tazobactam as well as to examine which enzymes that possess the ability to hydrolyze the antibiotic. A total of seven carbapenemase-producing strains were used in the study. The experiment also included a β-lactamase-negative isolate as a negative control. The strains were incubated with antibiotic (1mg/ml) in a buffered solution (0,08% ammonium bicarbonate, pH 8) for 120 min and 270 min. The supernatant, after centrifugation, was analyzed by MALDI-TOF MS. All the carbapenemase-producing strains demonstrated hydrolysis of Ceftolozane, except for NDM-1 producing E. coli. However, mass peaks corresponding to the degradation of Tazobactam were only detected in strains producing OXA-48 and NDM-7. The degradation of Ceftolozane/Tazobactam was most apparent after 120 minutes. However, to better enable detection of mass peaks, further optimization is needed in regard to appropriate matrix, buffer and antibiotic concentration. Student thesisinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesistexthttp://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-84598application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccess
collection NDLTD
language Swedish
format Others
sources NDLTD
topic MALDI-TOF MS
Ceftolozane/Tazobactam
carbapenemases
hydrolysis
decarboxylation
MALDI-TOF MS
Ceftolozan/Tazobaktam
karbapenemaser
hydrolys
dekarboxylering
Biomedical Laboratory Science/Technology
Biomedicinsk laboratorievetenskap/teknologi
spellingShingle MALDI-TOF MS
Ceftolozane/Tazobactam
carbapenemases
hydrolysis
decarboxylation
MALDI-TOF MS
Ceftolozan/Tazobaktam
karbapenemaser
hydrolys
dekarboxylering
Biomedical Laboratory Science/Technology
Biomedicinsk laboratorievetenskap/teknologi
Saad, Bessem
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser
description Under senare år har en särskilt hög resistensutveckling observerats hos gramnegativa bakterier inom familjen Enterobacteriaceae. Den främsta resistensmekanismen utgör produktion av så kallade "extended-spectrum β-lactamases" (ESBL) och särskilt oroväckande är karbapenemaser (ESBLCARBA) som har förmåga att bryta ner ett flertal olika grupper av β-laktamantibiotika. Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) har utforskats som metod för snabb detektion av karbapenemasaktivitet genom analys av nedbrytning av antibiotika. Syftet med denna studie var att utvärdera om MALDI-TOF MS kan användas som metod för att detektera enzymatisk nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam samt att undersöka vilka enzymer som uppvisar nedbrytning av antibiotikan. Sju karbapenemasproducerande isolat och en β-laktamasnegativ kontrollstam användes i studien. Isolaten inkuberades 120 min respektive 270 min med antibiotika (1mg/ml) i en buffertlösning (0,08% ammoniumbikarbonat, pH 8). Efter centrifugering analyserades supernatanten med MALDI-TOF MS. Nedbrytning av Ceftolozan detekterades hos samtliga karbapenemasproducerande stammar, utom hos E. coli med NDM-1 produktion. Nedbrytningstoppar av Tazobaktam detekterades emellertid enbart hos stammar med OXA-48 och NDM-7 produktion. Tydligast nedbrytning sågs efter 120 min. För tydligare visualisering av nedbrytningstoppar bör metoden dock optimeras med avseende på matrix, buffert och antibiotikakoncentration. === In recent years, an alarming increase of antibiotic resistance has been observed in Gram-negative bacteria, classified in the family Enterobacteriaceae. The main resistance mechanism is the production of extended-spectrum β-lactamases (ESBL). Particularly worrisome is the production of carbapenemases (ESBLCARBA) due to their ability to hydrolyze a broad range of β-lactams. Recently, Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) has been investigated as a method for rapid detection of carbapenemase activity through observation of antibiotic degradation. The aim of this study was to investigate whether MALDI-TOF MS can be used as a method to detect degradation of Ceftolozane/Tazobactam as well as to examine which enzymes that possess the ability to hydrolyze the antibiotic. A total of seven carbapenemase-producing strains were used in the study. The experiment also included a β-lactamase-negative isolate as a negative control. The strains were incubated with antibiotic (1mg/ml) in a buffered solution (0,08% ammonium bicarbonate, pH 8) for 120 min and 270 min. The supernatant, after centrifugation, was analyzed by MALDI-TOF MS. All the carbapenemase-producing strains demonstrated hydrolysis of Ceftolozane, except for NDM-1 producing E. coli. However, mass peaks corresponding to the degradation of Tazobactam were only detected in strains producing OXA-48 and NDM-7. The degradation of Ceftolozane/Tazobactam was most apparent after 120 minutes. However, to better enable detection of mass peaks, further optimization is needed in regard to appropriate matrix, buffer and antibiotic concentration.
author Saad, Bessem
author_facet Saad, Bessem
author_sort Saad, Bessem
title Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser
title_short Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser
title_full Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser
title_fullStr Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser
title_full_unstemmed Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser
title_sort matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av ceftolozan/tazobaktam orsakad av karbapenemaser
publisher Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper
publishDate 2020
url http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-84598
work_keys_str_mv AT saadbessem matrixassistedlaserdesorptionionizationtimeofflightmassspectrometrysomverktygforattdetekteranedbrytningavceftolozantazobaktamorsakadavkarbapenemaser
AT saadbessem matrixassistedlaserdesorptionionizationtimeofflightmassspectrometryasatoolfordetectingdegradationofceftolozanetazobactamcausedbycarbapenemases
_version_ 1719329619207782400