Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser
Under senare år har en särskilt hög resistensutveckling observerats hos gramnegativa bakterier inom familjen Enterobacteriaceae. Den främsta resistensmekanismen utgör produktion av så kallade "extended-spectrum β-lactamases" (ESBL) och särskilt oroväckande är karbapenemaser (ESBLCARBA) som...
Main Author: | |
---|---|
Format: | Others |
Language: | Swedish |
Published: |
Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper
2020
|
Subjects: | |
Online Access: | http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-84598 |
id |
ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-oru-84598 |
---|---|
record_format |
oai_dc |
spelling |
ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-oru-845982020-07-16T05:19:37ZMatrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemasersweMatrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry as a tool for detecting degradation of Ceftolozane/Tazobactam caused by carbapenemasesSaad, BessemÖrebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper2020MALDI-TOF MSCeftolozane/TazobactamcarbapenemaseshydrolysisdecarboxylationMALDI-TOF MSCeftolozan/TazobaktamkarbapenemaserhydrolysdekarboxyleringBiomedical Laboratory Science/TechnologyBiomedicinsk laboratorievetenskap/teknologiUnder senare år har en särskilt hög resistensutveckling observerats hos gramnegativa bakterier inom familjen Enterobacteriaceae. Den främsta resistensmekanismen utgör produktion av så kallade "extended-spectrum β-lactamases" (ESBL) och särskilt oroväckande är karbapenemaser (ESBLCARBA) som har förmåga att bryta ner ett flertal olika grupper av β-laktamantibiotika. Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) har utforskats som metod för snabb detektion av karbapenemasaktivitet genom analys av nedbrytning av antibiotika. Syftet med denna studie var att utvärdera om MALDI-TOF MS kan användas som metod för att detektera enzymatisk nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam samt att undersöka vilka enzymer som uppvisar nedbrytning av antibiotikan. Sju karbapenemasproducerande isolat och en β-laktamasnegativ kontrollstam användes i studien. Isolaten inkuberades 120 min respektive 270 min med antibiotika (1mg/ml) i en buffertlösning (0,08% ammoniumbikarbonat, pH 8). Efter centrifugering analyserades supernatanten med MALDI-TOF MS. Nedbrytning av Ceftolozan detekterades hos samtliga karbapenemasproducerande stammar, utom hos E. coli med NDM-1 produktion. Nedbrytningstoppar av Tazobaktam detekterades emellertid enbart hos stammar med OXA-48 och NDM-7 produktion. Tydligast nedbrytning sågs efter 120 min. För tydligare visualisering av nedbrytningstoppar bör metoden dock optimeras med avseende på matrix, buffert och antibiotikakoncentration. In recent years, an alarming increase of antibiotic resistance has been observed in Gram-negative bacteria, classified in the family Enterobacteriaceae. The main resistance mechanism is the production of extended-spectrum β-lactamases (ESBL). Particularly worrisome is the production of carbapenemases (ESBLCARBA) due to their ability to hydrolyze a broad range of β-lactams. Recently, Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) has been investigated as a method for rapid detection of carbapenemase activity through observation of antibiotic degradation. The aim of this study was to investigate whether MALDI-TOF MS can be used as a method to detect degradation of Ceftolozane/Tazobactam as well as to examine which enzymes that possess the ability to hydrolyze the antibiotic. A total of seven carbapenemase-producing strains were used in the study. The experiment also included a β-lactamase-negative isolate as a negative control. The strains were incubated with antibiotic (1mg/ml) in a buffered solution (0,08% ammonium bicarbonate, pH 8) for 120 min and 270 min. The supernatant, after centrifugation, was analyzed by MALDI-TOF MS. All the carbapenemase-producing strains demonstrated hydrolysis of Ceftolozane, except for NDM-1 producing E. coli. However, mass peaks corresponding to the degradation of Tazobactam were only detected in strains producing OXA-48 and NDM-7. The degradation of Ceftolozane/Tazobactam was most apparent after 120 minutes. However, to better enable detection of mass peaks, further optimization is needed in regard to appropriate matrix, buffer and antibiotic concentration. Student thesisinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesistexthttp://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-84598application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccess |
collection |
NDLTD |
language |
Swedish |
format |
Others
|
sources |
NDLTD |
topic |
MALDI-TOF MS Ceftolozane/Tazobactam carbapenemases hydrolysis decarboxylation MALDI-TOF MS Ceftolozan/Tazobaktam karbapenemaser hydrolys dekarboxylering Biomedical Laboratory Science/Technology Biomedicinsk laboratorievetenskap/teknologi |
spellingShingle |
MALDI-TOF MS Ceftolozane/Tazobactam carbapenemases hydrolysis decarboxylation MALDI-TOF MS Ceftolozan/Tazobaktam karbapenemaser hydrolys dekarboxylering Biomedical Laboratory Science/Technology Biomedicinsk laboratorievetenskap/teknologi Saad, Bessem Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser |
description |
Under senare år har en särskilt hög resistensutveckling observerats hos gramnegativa bakterier inom familjen Enterobacteriaceae. Den främsta resistensmekanismen utgör produktion av så kallade "extended-spectrum β-lactamases" (ESBL) och särskilt oroväckande är karbapenemaser (ESBLCARBA) som har förmåga att bryta ner ett flertal olika grupper av β-laktamantibiotika. Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) har utforskats som metod för snabb detektion av karbapenemasaktivitet genom analys av nedbrytning av antibiotika. Syftet med denna studie var att utvärdera om MALDI-TOF MS kan användas som metod för att detektera enzymatisk nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam samt att undersöka vilka enzymer som uppvisar nedbrytning av antibiotikan. Sju karbapenemasproducerande isolat och en β-laktamasnegativ kontrollstam användes i studien. Isolaten inkuberades 120 min respektive 270 min med antibiotika (1mg/ml) i en buffertlösning (0,08% ammoniumbikarbonat, pH 8). Efter centrifugering analyserades supernatanten med MALDI-TOF MS. Nedbrytning av Ceftolozan detekterades hos samtliga karbapenemasproducerande stammar, utom hos E. coli med NDM-1 produktion. Nedbrytningstoppar av Tazobaktam detekterades emellertid enbart hos stammar med OXA-48 och NDM-7 produktion. Tydligast nedbrytning sågs efter 120 min. För tydligare visualisering av nedbrytningstoppar bör metoden dock optimeras med avseende på matrix, buffert och antibiotikakoncentration. === In recent years, an alarming increase of antibiotic resistance has been observed in Gram-negative bacteria, classified in the family Enterobacteriaceae. The main resistance mechanism is the production of extended-spectrum β-lactamases (ESBL). Particularly worrisome is the production of carbapenemases (ESBLCARBA) due to their ability to hydrolyze a broad range of β-lactams. Recently, Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) has been investigated as a method for rapid detection of carbapenemase activity through observation of antibiotic degradation. The aim of this study was to investigate whether MALDI-TOF MS can be used as a method to detect degradation of Ceftolozane/Tazobactam as well as to examine which enzymes that possess the ability to hydrolyze the antibiotic. A total of seven carbapenemase-producing strains were used in the study. The experiment also included a β-lactamase-negative isolate as a negative control. The strains were incubated with antibiotic (1mg/ml) in a buffered solution (0,08% ammonium bicarbonate, pH 8) for 120 min and 270 min. The supernatant, after centrifugation, was analyzed by MALDI-TOF MS. All the carbapenemase-producing strains demonstrated hydrolysis of Ceftolozane, except for NDM-1 producing E. coli. However, mass peaks corresponding to the degradation of Tazobactam were only detected in strains producing OXA-48 and NDM-7. The degradation of Ceftolozane/Tazobactam was most apparent after 120 minutes. However, to better enable detection of mass peaks, further optimization is needed in regard to appropriate matrix, buffer and antibiotic concentration. |
author |
Saad, Bessem |
author_facet |
Saad, Bessem |
author_sort |
Saad, Bessem |
title |
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser |
title_short |
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser |
title_full |
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser |
title_fullStr |
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser |
title_full_unstemmed |
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av Ceftolozan/Tazobaktam orsakad av karbapenemaser |
title_sort |
matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry som verktyg för att detektera nedbrytning av ceftolozan/tazobaktam orsakad av karbapenemaser |
publisher |
Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper |
publishDate |
2020 |
url |
http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-84598 |
work_keys_str_mv |
AT saadbessem matrixassistedlaserdesorptionionizationtimeofflightmassspectrometrysomverktygforattdetekteranedbrytningavceftolozantazobaktamorsakadavkarbapenemaser AT saadbessem matrixassistedlaserdesorptionionizationtimeofflightmassspectrometryasatoolfordetectingdegradationofceftolozanetazobactamcausedbycarbapenemases |
_version_ |
1719329619207782400 |