Salmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reaction

Salmonella är en gramnegativ bakterie som tillhör gruppen Enterobacteriacea. Bakterien delas in i två arter S. enterica och S. bongori och totalt har mer än 2600 serotyper upptäckts. Dessa serotyper skiljs från varandra utifrån sina flagellära H-antigener och somatiska O-antigener. Salmonellos är et...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Sadeqi, Atefa
Format: Others
Language:Swedish
Published: 2021
Subjects:
Online Access:http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:mau:diva-43070
id ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-mau-43070
record_format oai_dc
spelling ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-mau-430702021-06-11T05:25:17ZSalmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reactionsweSadeqi, Atefa2021Salmonellaenterobacteriaceaepolymerase chain reactionvaliderakycklingprovenkonfirmering.Medical BiotechnologyMedicinsk bioteknologiSalmonella är en gramnegativ bakterie som tillhör gruppen Enterobacteriacea. Bakterien delas in i två arter S. enterica och S. bongori och totalt har mer än 2600 serotyper upptäckts. Dessa serotyper skiljs från varandra utifrån sina flagellära H-antigener och somatiska O-antigener. Salmonellos är ett exempel på ett sjukdomstillstånd som orsakas av olika salmonella typer. De flesta salmonellainfektioner hos människor sker genom konsumering av kontaminerade livsmedel med bakterien. Polymerase chain reaction, PCR, är en snabb metod som kan detektera bakterier i till exempel livsmedel. I metoden används omväxlande upphettning och nedkylning av PCR-proven. Reaktionen i PCR sker i ett antal steg som möjliggör bildning av många kopior av DNA efter bara 40 cykler. Syftet med denna studie var att validera PCR metoden genom att hitta olika koncentrationer av salmonella i 25 gram värmebehandlad kycklingprov. Metoden börjades med att inokulera kycklingproven med salmonella och de bestämda halterna var 100, 10 och 1 cfu/prov. Huvudfokus var att hitta 1 cfu/kycklingprov och för att uppnå målet gjordes därför totalt fyra försök för att kunna dra pålitliga resultat och slutsatser. Vid varje försök gjordes två metoder parallellt där den ena var PCR metoden medan den andra var referens till PCR och genomfördes bara genom odling på agarplattor. Positiva prover bekräftades genom konfirmering i ett antal steg och vid varje försök gjordes negativ kontroll för att undvika falsk positiva resultat. Resultatet visade att 100 cfu/prov och 10 cfu/prov i kycklingprov kunde detekteras med PCR. Det närmaste värdet till 1 cfu/prov som var målet, blev 0,8 cfu/prov och med denna bakteriehalt lyckades PCR detektera två positiva prover av totalt tre prover. Den låga bakteriehalten behöver därför upprepas flera gånger för att metoden ska kunna valideras. Student thesisinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesistexthttp://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:mau:diva-43070application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccess
collection NDLTD
language Swedish
format Others
sources NDLTD
topic Salmonella
enterobacteriaceae
polymerase chain reaction
validera
kycklingproven
konfirmering.
Medical Biotechnology
Medicinsk bioteknologi
spellingShingle Salmonella
enterobacteriaceae
polymerase chain reaction
validera
kycklingproven
konfirmering.
Medical Biotechnology
Medicinsk bioteknologi
Sadeqi, Atefa
Salmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reaction
description Salmonella är en gramnegativ bakterie som tillhör gruppen Enterobacteriacea. Bakterien delas in i två arter S. enterica och S. bongori och totalt har mer än 2600 serotyper upptäckts. Dessa serotyper skiljs från varandra utifrån sina flagellära H-antigener och somatiska O-antigener. Salmonellos är ett exempel på ett sjukdomstillstånd som orsakas av olika salmonella typer. De flesta salmonellainfektioner hos människor sker genom konsumering av kontaminerade livsmedel med bakterien. Polymerase chain reaction, PCR, är en snabb metod som kan detektera bakterier i till exempel livsmedel. I metoden används omväxlande upphettning och nedkylning av PCR-proven. Reaktionen i PCR sker i ett antal steg som möjliggör bildning av många kopior av DNA efter bara 40 cykler. Syftet med denna studie var att validera PCR metoden genom att hitta olika koncentrationer av salmonella i 25 gram värmebehandlad kycklingprov. Metoden börjades med att inokulera kycklingproven med salmonella och de bestämda halterna var 100, 10 och 1 cfu/prov. Huvudfokus var att hitta 1 cfu/kycklingprov och för att uppnå målet gjordes därför totalt fyra försök för att kunna dra pålitliga resultat och slutsatser. Vid varje försök gjordes två metoder parallellt där den ena var PCR metoden medan den andra var referens till PCR och genomfördes bara genom odling på agarplattor. Positiva prover bekräftades genom konfirmering i ett antal steg och vid varje försök gjordes negativ kontroll för att undvika falsk positiva resultat. Resultatet visade att 100 cfu/prov och 10 cfu/prov i kycklingprov kunde detekteras med PCR. Det närmaste värdet till 1 cfu/prov som var målet, blev 0,8 cfu/prov och med denna bakteriehalt lyckades PCR detektera två positiva prover av totalt tre prover. Den låga bakteriehalten behöver därför upprepas flera gånger för att metoden ska kunna valideras.
author Sadeqi, Atefa
author_facet Sadeqi, Atefa
author_sort Sadeqi, Atefa
title Salmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reaction
title_short Salmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reaction
title_full Salmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reaction
title_fullStr Salmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reaction
title_full_unstemmed Salmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reaction
title_sort salmonellapåvisning i kyckling med hjälp av polymerase chain reaction
publishDate 2021
url http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:mau:diva-43070
work_keys_str_mv AT sadeqiatefa salmonellapavisningikycklingmedhjalpavpolymerasechainreaction
_version_ 1719409753956810752