A Spatio-temporal SEIRD Model of Covid-19 in Sweden

The Covid-19 pandemic has affected many countries all over the world, and more than three million people have died from the virus. To understand the development of a pandemic it is common to use a simulation. This report investigates if it is possible to create a potential simulation of a spread of...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Schwieler, Mathilda, Fredin Haslum, Eric
Format: Others
Language:English
Published: KTH, Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS) 2021
Subjects:
Online Access:http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-304661
id ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-kth-304661
record_format oai_dc
spelling ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-kth-3046612021-11-16T05:50:54ZA Spatio-temporal SEIRD Model of Covid-19 in SwedenengEn Spatio-temporal SEIRD-model av Covid-19 i SverigeSchwieler, MathildaFredin Haslum, EricKTH, Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS)2021Computer SciencesDatavetenskap (datalogi)The Covid-19 pandemic has affected many countries all over the world, and more than three million people have died from the virus. To understand the development of a pandemic it is common to use a simulation. This report investigates if it is possible to create a potential simulation of a spread of Covid-19 in Sweden, as well as in Stockholm, Gothenburg and Malmo, and how well it corresponds to the first 150 days of the pandemic. The report uses a compartmental model, SEIRD model which divides the population into: susceptible, exposed, infectious, recovered and deceased. This model is composed of a system of partial differential equations which are dependent on time and space, and these are solved with the finite element method. The simulation shows a possible spread of Covid-19 and the simulated number of deceased is compared to data from the Public Health Agency of Sweden. Comparisons shows that the model is not credible but agrees best with Sweden with a ranged- normalized RMSE value of 0.66 and worst with Malmö with a value of 2.53. For future studies the model could for instance use a population density based mesh that better corresponds to reality or initiate the virus in more places in Sweden.  Covid-19-pandemin har påverkat många länder över hela världen och mer än tre miljoner människor har avlidit till följd av viruset. För att förstå utvecklingen av en pandemi är det vanligt att använda sig av en simulering. Denna rapport undersöker om det är möjligt att skapa en potentiell simulering av spridningen av Covid-19 i Sverige, och i Stockholm, Göteborg och Malmö, samt se hur bra den stämmer överens med de första 150 dagarna av pandemin. Rapporten använder sig av en fackmodell, SEIRD modell som delar upp befolkningen i de olika grupperna: susceptible, exposed, infectious, recovered och deceased. Denna modell består av ett system av partiella differentialekvationer vilka är beroende på tid och rum, och dessa löses med finita elementmetoden. Simuleringen visar en potentiell spridning av Covid-19 i Sverige och det simulerade antalet avlidna jämförs med data från Folkhälsomyndigheten. Jämförelserna visar att modellen inte är verklighetstrogen, men att den passar bäst för Sverige med ett normaliserat RMSE värde på 0.66 och sämst för Malmö med ett värde på 2.53. Framtida utvecklingar av modellen kan bland annat vara att använda en mesh baserad på befolkningstätheten så den stämmer bättre överens med verkligheten, eller att initiera viruset på er platser i Sverige.   Student thesisinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesistexthttp://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-304661TRITA-EECS-EX ; 2021:662application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccess
collection NDLTD
language English
format Others
sources NDLTD
topic Computer Sciences
Datavetenskap (datalogi)
spellingShingle Computer Sciences
Datavetenskap (datalogi)
Schwieler, Mathilda
Fredin Haslum, Eric
A Spatio-temporal SEIRD Model of Covid-19 in Sweden
description The Covid-19 pandemic has affected many countries all over the world, and more than three million people have died from the virus. To understand the development of a pandemic it is common to use a simulation. This report investigates if it is possible to create a potential simulation of a spread of Covid-19 in Sweden, as well as in Stockholm, Gothenburg and Malmo, and how well it corresponds to the first 150 days of the pandemic. The report uses a compartmental model, SEIRD model which divides the population into: susceptible, exposed, infectious, recovered and deceased. This model is composed of a system of partial differential equations which are dependent on time and space, and these are solved with the finite element method. The simulation shows a possible spread of Covid-19 and the simulated number of deceased is compared to data from the Public Health Agency of Sweden. Comparisons shows that the model is not credible but agrees best with Sweden with a ranged- normalized RMSE value of 0.66 and worst with Malmö with a value of 2.53. For future studies the model could for instance use a population density based mesh that better corresponds to reality or initiate the virus in more places in Sweden.  === Covid-19-pandemin har påverkat många länder över hela världen och mer än tre miljoner människor har avlidit till följd av viruset. För att förstå utvecklingen av en pandemi är det vanligt att använda sig av en simulering. Denna rapport undersöker om det är möjligt att skapa en potentiell simulering av spridningen av Covid-19 i Sverige, och i Stockholm, Göteborg och Malmö, samt se hur bra den stämmer överens med de första 150 dagarna av pandemin. Rapporten använder sig av en fackmodell, SEIRD modell som delar upp befolkningen i de olika grupperna: susceptible, exposed, infectious, recovered och deceased. Denna modell består av ett system av partiella differentialekvationer vilka är beroende på tid och rum, och dessa löses med finita elementmetoden. Simuleringen visar en potentiell spridning av Covid-19 i Sverige och det simulerade antalet avlidna jämförs med data från Folkhälsomyndigheten. Jämförelserna visar att modellen inte är verklighetstrogen, men att den passar bäst för Sverige med ett normaliserat RMSE värde på 0.66 och sämst för Malmö med ett värde på 2.53. Framtida utvecklingar av modellen kan bland annat vara att använda en mesh baserad på befolkningstätheten så den stämmer bättre överens med verkligheten, eller att initiera viruset på er platser i Sverige.  
author Schwieler, Mathilda
Fredin Haslum, Eric
author_facet Schwieler, Mathilda
Fredin Haslum, Eric
author_sort Schwieler, Mathilda
title A Spatio-temporal SEIRD Model of Covid-19 in Sweden
title_short A Spatio-temporal SEIRD Model of Covid-19 in Sweden
title_full A Spatio-temporal SEIRD Model of Covid-19 in Sweden
title_fullStr A Spatio-temporal SEIRD Model of Covid-19 in Sweden
title_full_unstemmed A Spatio-temporal SEIRD Model of Covid-19 in Sweden
title_sort spatio-temporal seird model of covid-19 in sweden
publisher KTH, Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS)
publishDate 2021
url http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-304661
work_keys_str_mv AT schwielermathilda aspatiotemporalseirdmodelofcovid19insweden
AT fredinhaslumeric aspatiotemporalseirdmodelofcovid19insweden
AT schwielermathilda enspatiotemporalseirdmodelavcovid19isverige
AT fredinhaslumeric enspatiotemporalseirdmodelavcovid19isverige
AT schwielermathilda spatiotemporalseirdmodelofcovid19insweden
AT fredinhaslumeric spatiotemporalseirdmodelofcovid19insweden
_version_ 1719493959649067008