Utveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för DNA polymeraser

En publicerad metod för undersökning av noggrannhet hos DNA polymeraser har undersökts. Metoden bygger på in vitro replikation av lacZα genen i pUC18 och identifiering av mutationer genom blå vit selektion efter transformation av reaktionsprodukten. I arbetet visas att framställning av templatet til...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Bjurheden, Eva
Format: Others
Language:Swedish
Published: Karlstads universitet, Fakulteten för teknik- och naturvetenskap 2011
Online Access:http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kau:diva-7178
id ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-kau-7178
record_format oai_dc
spelling ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-kau-71782013-01-08T13:29:43ZUtveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för DNA polymerasersweDevelopment and evaluation of a fidelity assay system for DNA polymerasesBjurheden, EvaKarlstads universitet, Fakulteten för teknik- och naturvetenskap2011En publicerad metod för undersökning av noggrannhet hos DNA polymeraser har undersökts. Metoden bygger på in vitro replikation av lacZα genen i pUC18 och identifiering av mutationer genom blå vit selektion efter transformation av reaktionsprodukten. I arbetet visas att framställning av templatet till polymerasreaktionen kan göras enligt beskrivning, men att utbytet blev lågt. Polymerasreaktionen med det framställda templatet fungerade även det enligt beskrivning men mängden erhållen produkt var för liten för att ge kolonier efter transformationssteget. Innan metoden kan användas behövs tillgång till större mängder templat för polymerasreaktionen. En möjlighet att förbättra utbytet är en bättre procedur för extraktion av det önskade fragmentet ur agarosgel.   A published method for testing the accuracy of DNA polymerases has been evaluated. The method is based on in vitro replication of the lacZα gene in pUC18 and identification of mutations by blue white selection for transformation of the reaction product. It was shown that the production of the template for the polymerase reaction can be done by the protocol, but the yield was low. The polymerase reaction with the prepared template worked as described, but the amount of product obtained was too small to give colonies after the transformation. Before the method can be used, larger amounts of template for the polymerase reaction are needed. One possibility to improve the yield is a better procedure for the extraction of the desired fragment from the agarose gel.   Student thesisinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesistexthttp://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kau:diva-7178application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccess
collection NDLTD
language Swedish
format Others
sources NDLTD
description En publicerad metod för undersökning av noggrannhet hos DNA polymeraser har undersökts. Metoden bygger på in vitro replikation av lacZα genen i pUC18 och identifiering av mutationer genom blå vit selektion efter transformation av reaktionsprodukten. I arbetet visas att framställning av templatet till polymerasreaktionen kan göras enligt beskrivning, men att utbytet blev lågt. Polymerasreaktionen med det framställda templatet fungerade även det enligt beskrivning men mängden erhållen produkt var för liten för att ge kolonier efter transformationssteget. Innan metoden kan användas behövs tillgång till större mängder templat för polymerasreaktionen. En möjlighet att förbättra utbytet är en bättre procedur för extraktion av det önskade fragmentet ur agarosgel.   === A published method for testing the accuracy of DNA polymerases has been evaluated. The method is based on in vitro replication of the lacZα gene in pUC18 and identification of mutations by blue white selection for transformation of the reaction product. It was shown that the production of the template for the polymerase reaction can be done by the protocol, but the yield was low. The polymerase reaction with the prepared template worked as described, but the amount of product obtained was too small to give colonies after the transformation. Before the method can be used, larger amounts of template for the polymerase reaction are needed. One possibility to improve the yield is a better procedure for the extraction of the desired fragment from the agarose gel.  
author Bjurheden, Eva
spellingShingle Bjurheden, Eva
Utveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för DNA polymeraser
author_facet Bjurheden, Eva
author_sort Bjurheden, Eva
title Utveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för DNA polymeraser
title_short Utveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för DNA polymeraser
title_full Utveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för DNA polymeraser
title_fullStr Utveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för DNA polymeraser
title_full_unstemmed Utveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för DNA polymeraser
title_sort utveckling och utvärdering av ett fidelitetssystem för dna polymeraser
publisher Karlstads universitet, Fakulteten för teknik- och naturvetenskap
publishDate 2011
url http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kau:diva-7178
work_keys_str_mv AT bjurhedeneva utvecklingochutvarderingavettfidelitetssystemfordnapolymeraser
AT bjurhedeneva developmentandevaluationofafidelityassaysystemfordnapolymerases
_version_ 1716521674594058240