Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down
Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario === El objetivo de este trabajo fue realizar un estudio poblacional, utilizando los marcadores intergénicos tipo SNP (polimorfismos de un solo nucleótido) DQA2/DQB1, DQB2/DQA2 y BTNL2-C6orf10, ubicados en la subregión IIa del Complejo...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | |
Language: | es |
Published: |
Universidad de Chile
2015
|
Subjects: | |
Online Access: | http://repositorio.uchile.cl/handle/2250/134842 |
id |
ndltd-UCHILE-oai-repositorio.uchile.cl-2250-134842 |
---|---|
record_format |
oai_dc |
spelling |
ndltd-UCHILE-oai-repositorio.uchile.cl-2250-1348422017-02-07T05:04:17Z Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down Hernández Zúñiga, Eric Andrés Martínez Moncada, Víctor Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias Departamento de Fomento de la Producción Animal Kessi Campos, Eduardo Pérez Melendez, Patricio Ovinos--Genética Complejo mayor de histocompatibilidad Razas de ovejas Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario El objetivo de este trabajo fue realizar un estudio poblacional, utilizando los marcadores intergénicos tipo SNP (polimorfismos de un solo nucleótido) DQA2/DQB1, DQB2/DQA2 y BTNL2-C6orf10, ubicados en la subregión IIa del Complejo Principal de Histocompatibilidad ovino (Ovar-MHC), en las poblaciones ovinas presentes en el archipiélago de Chiloé, en particular la Criollo Chilota (OCH) y Suffolk Down (SD). El genotipado fue realizado por medio de PCR alelo específico en tiempo real (ASqPCR) y análisis de curvas de fusión en alta resolución con cambio de Tm de los partidores (HRM Tm-shift primers). No se observó diferencias significativas al comparar las frecuencias alélicas entre las poblaciones. En la población OCH sólo DQA2/DQB1 se desvió del Equilibrio de Hardy-Weinberg (EHW) por deficiencia de heterocigotos (valor de P < 0,05), mientras que en SD todos estuvieron bajo EHW (valor de P > 0,05). En ambas poblaciones hubo LD entre DQA2/DQB1 y DQB2/DQA2 (r2= 0,3778 , r2= 0,5589, valor de P = 0,000 y 0,0008; respectivamente), observándose diferentes patrones haplotípicos entre las poblaciones. Los resultados sugieren, en conjunto con la literatura, una asociación no aleatoria entre los loci DQA2/DQB1 y DQB2/DQA2 relacionados con los genes de la cadena alfa y beta de la glicoproteína DQ presentadora de antígenos a los linfocitos T cooperadoras (CD4+). Lo cual sienta las bases para realizar estudios evolutivos a mayor escala acerca de los patrones haplotípicos que se han establecido en las distintas razas de ovinos 2015-11-04T19:08:06Z 2015-11-04T19:08:06Z 2015 Tesis http://repositorio.uchile.cl/handle/2250/134842 es Atribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 Chile http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/ Universidad de Chile |
collection |
NDLTD |
language |
es |
sources |
NDLTD |
topic |
Ovinos--Genética Complejo mayor de histocompatibilidad Razas de ovejas |
spellingShingle |
Ovinos--Genética Complejo mayor de histocompatibilidad Razas de ovejas Hernández Zúñiga, Eric Andrés Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down |
description |
Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario === El objetivo de este trabajo fue realizar un estudio poblacional, utilizando los marcadores
intergénicos tipo SNP (polimorfismos de un solo nucleótido) DQA2/DQB1, DQB2/DQA2 y
BTNL2-C6orf10, ubicados en la subregión IIa del Complejo Principal de
Histocompatibilidad ovino (Ovar-MHC), en las poblaciones ovinas presentes en el
archipiélago de Chiloé, en particular la Criollo Chilota (OCH) y Suffolk Down (SD). El
genotipado fue realizado por medio de PCR alelo específico en tiempo real (ASqPCR) y
análisis de curvas de fusión en alta resolución con cambio de Tm de los partidores (HRM
Tm-shift primers). No se observó diferencias significativas al comparar las frecuencias
alélicas entre las poblaciones. En la población OCH sólo DQA2/DQB1 se desvió del
Equilibrio de Hardy-Weinberg (EHW) por deficiencia de heterocigotos (valor de P < 0,05),
mientras que en SD todos estuvieron bajo EHW (valor de P > 0,05). En ambas
poblaciones hubo LD entre DQA2/DQB1 y DQB2/DQA2 (r2= 0,3778 , r2= 0,5589, valor de
P = 0,000 y 0,0008; respectivamente), observándose diferentes patrones haplotípicos
entre las poblaciones. Los resultados sugieren, en conjunto con la literatura, una
asociación no aleatoria entre los loci DQA2/DQB1 y DQB2/DQA2 relacionados con los
genes de la cadena alfa y beta de la glicoproteína DQ presentadora de antígenos a los
linfocitos T cooperadoras (CD4+). Lo cual sienta las bases para realizar estudios
evolutivos a mayor escala acerca de los patrones haplotípicos que se han establecido en
las distintas razas de ovinos |
author2 |
Martínez Moncada, Víctor |
author_facet |
Martínez Moncada, Víctor Hernández Zúñiga, Eric Andrés |
author |
Hernández Zúñiga, Eric Andrés |
author_sort |
Hernández Zúñiga, Eric Andrés |
title |
Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down |
title_short |
Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down |
title_full |
Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down |
title_fullStr |
Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down |
title_full_unstemmed |
Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down |
title_sort |
determinación de variabilidad genética en la subregión iia del complejo principal de histocompatibilidad ovino (ovar mhc,) en las razas criollo chilote y suffolk down |
publisher |
Universidad de Chile |
publishDate |
2015 |
url |
http://repositorio.uchile.cl/handle/2250/134842 |
work_keys_str_mv |
AT hernandezzunigaericandres determinaciondevariabilidadgeneticaenlasubregioniiadelcomplejoprincipaldehistocompatibilidadovinoovarmhcenlasrazascriollochiloteysuffolkdown |
_version_ |
1718412637497196544 |