A network-based biomarker approach for molecular investigation and diagnosis of lung cancer

• Main Authors: Wang, Yu-Chao, 王禹超
• Other Authors: Chen, Bor-Sen
• Format: Others
• Language: en_US
• Published: 2010
• Online Access: http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/32614531718953834930

博士 === 國立清華大學 === 電機工程學系 === 98 === 癌症是一種細胞不正常的增生而造成腫瘤的一種複雜的疾病，而肺癌又是眾多癌症中致死率最高、全世界造成死亡數最多的一種癌症。有許多的論文致力於研究致癌的過程以及尋找可以分類特徵的生物標記，這樣的癌症生物標記通常被用來當作診斷評估的工具或是預後情況的指標。然而，就我們所知，目前並沒有令人滿意的以網路為基礎的方法，從系統的觀點來研究致癌的機制及診斷。因此，在這篇論文中，我們提出了一個結合微陣列基因表現以及蛋白質交互作用資訊的系統生物學方法，用來發展生物網路標記以進行肺癌分子研究及診斷。我們利用這樣的資料，結合一個簡單的線性迴歸模型以及系統鑑別與統計方法來建構蛋白質關聯性網路，而從癌症樣本以及非癌症樣本所建構出來的兩個蛋白質關聯性網路就組成了生物網路標記。根據這個生物網路標記，配合致癌關聯數值的計算，我們總共找出了四十個重要的蛋白質，並藉此來瞭解形成肺癌的網路機制。此外，這個生物網路標記也可以用來當作肺癌診斷的工具，可以有效的診斷出具有肺癌的吸煙者。以上這些結果顯示出這個包含蛋白質關聯性網路的生物網路標記可以讓我們對於形成肺癌的過程以及機制更加瞭解，更重要的是，我們找出的那些重要的蛋白質提供了可能的分子目標來治療癌症。