Molecular studies of drosophila GATA factors

碩士 === 國立陽明大學 === 遺傳學研究所 === 80 === GATA因子為具有組織特異性的 DNA binding protein,其DNA binding 部份為含有 Cys-Cys ,類似 Zn figer 的結構,近來由低等生物如 C.elegans (Elt-1) 、As- pergillus (areA)也發現此一finger protein。而果蠅中則尚未有類似GATA-1的轉 錄因子被報導,而果蠅為研究組織特異性發展的最...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: LIN, WEIN-SHING, 林文星
Other Authors: TSAI, SHIN-FENG
Format: Others
Language:zh-TW
Published: 1992
Online Access:http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/20914217136654581842
Description
Summary:碩士 === 國立陽明大學 === 遺傳學研究所 === 80 === GATA因子為具有組織特異性的 DNA binding protein,其DNA binding 部份為含有 Cys-Cys ,類似 Zn figer 的結構,近來由低等生物如 C.elegans (Elt-1) 、As- pergillus (areA)也發現此一finger protein。而果蠅中則尚未有類似GATA-1的轉 錄因子被報導,而果蠅為研究組織特異性發展的最佳生物系統,故希望能找出果蠅 的GATA因子並研究GATA因子在果蠅發展中所扮演的角色。 我們利用PCR 的方法,由果蠅基因組中合成一段GATA因子上的DNA 序列,D1片段 ( 94nt)。以此片段為探針,由果蠅的基因庫中,選殖出6個殖體(g1.1,g3.1,g4.2 ,g5.1,g13.1,g15.2,再以g15.2為探針,從ICRF (Imperial Cancer Research Fund) 提供的cosmid lihrary filters 中,篩選出4個殖體 (3G8,5G8,58C9, 88F8) ,由這些殖體核酸序列的分析中,我們確認了果蠅GATA因子之存在。且在 58C9.4殖體中發現了一個只含C端figer 的序列。 我們利用figer 區域的核酸序列,合成一些引子 (primer)NF,CF,與 CF, 分別從果蠅不同發育成長階段的cDNA基因庫做PCR 反應,找出有GATA1 因子mRNA表 現之基因庫 (embryo O-3hr、3-12hr、Ⅰ&Ⅱ instar) ,由這些 cDNA 基因庫中, 我們進一步篩選出8個殖體,其分別屬於 dGATA-1 (cDNA2, cDNA10, cDNA9.1) 與 dGATA-2 (cDNA4, cDNA11, cDNA14, cDNA13.1, cDNA13.3) ,經由比對核酸序列 的結果。dGATA-1 含有1800個核酸(cDNA序列並未完全),dGATA-2 含有3130個 核酸。 以13.3 (593)為探針,由cosmid lib22rary中選殖出4個殖體(41A3, 76D2, 78A9, 81G8) ,從限制圖譜,與 exon 定位中,可知dGATA-2 約有17kb長,且含有8個 exons 。 由polytene chromosome mapping 中,可知dGATA-1,dGATA-2分別位於果蠅染色體 的89B 區域與90D 區域。 經由初步的RNase protection assay與reverse transcriptase PCR 反應之研究, 可知不同的發育成長階段均具有二者mRNA之表現,然而表現量似乎有明顯的差異。 從二者cDNA的核酸序列中,我們構築了二個融合蛋白質,以製備抗體,其一pGEX -13.3(3') ,從gel shift assay 的實驗中証實具有與DNA 結合之能力。其在大腸 桿菌中表現穩定且產量多,希望可由此更進一步,研究dGATA 蛋白質的結構,從而 了解dGATA 因子與DNA 結合的實驗狀態,並且找出dGATA 因子調控的下游基因。