Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling

Mechanisms underlying congenital malformations are largely unknown despite its high incidence, affecting 2-3% of liveborn infants. A broader knowledge about the causes of birth defects would provide valuable information regarding the outcome and prognosis of the anomaly, the development and establis...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Serra Juhé, Clara, 1984-
Other Authors: Pérez Jurado, Luis Alberto
Format: Doctoral Thesis
Language:English
Published: Universitat Pompeu Fabra 2012
Subjects:
575
Online Access:http://hdl.handle.net/10803/96194
id ndltd-TDX_UPF-oai-www.tdx.cat-10803-96194
record_format oai_dc
collection NDLTD
language English
format Doctoral Thesis
sources NDLTD
topic Malformacions congènites
Malformacions cardíaques congènites
Epigenètica
Variacions en número de còpia (CNV)
Mutacions puntuals
Assessorament genètic
Análisis cromosòmica en micromatrius
Seqüenciació d’exoma
Metilació del DNA
Congenital malformations
Congenital heart defects
Epigenetics
Copy number variation (CNV)
Point mutations
Genetic counseling
Chromosomal microarray analysis
Exome sequencing
DNA methylation
575
spellingShingle Malformacions congènites
Malformacions cardíaques congènites
Epigenètica
Variacions en número de còpia (CNV)
Mutacions puntuals
Assessorament genètic
Análisis cromosòmica en micromatrius
Seqüenciació d’exoma
Metilació del DNA
Congenital malformations
Congenital heart defects
Epigenetics
Copy number variation (CNV)
Point mutations
Genetic counseling
Chromosomal microarray analysis
Exome sequencing
DNA methylation
575
Serra Juhé, Clara, 1984-
Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling
description Mechanisms underlying congenital malformations are largely unknown despite its high incidence, affecting 2-3% of liveborn infants. A broader knowledge about the causes of birth defects would provide valuable information regarding the outcome and prognosis of the anomaly, the development and establishment of diagnostic protocols, the design of therapeutic strategies and genetic counseling to the family. Different approaches have been used in the present thesis regarding technologies and model diseases to elucidate the contribution of genetic and epigenetic alterations in the etiopathogenesis of congenital malformations. Copy number variations, methylation patterns, as well as point mutations have been explored. Moreover, a study to analyze genetic counseling in relation to one of the new molecular techniques used has been performed. Obtained data reveal a relevant role of genetic and epigenetic alterations in congenital malformations, in some cases as a unique cause to explain the disease and in others as part of an oligogenic or multifactorial model. === Els mecanismes causants de les malformacions congènites són poc coneguts malgrat l’elevada incidència d’aquestes patologies, que afecten el 2-3% de recent nascuts. Un coneixement més ampli de les causes de les anomalies congènites proporcionaria informació rellevant pel que fa al pronòstic de l’anomalia, el desenvolupament i establiment de protocols diagnòstics, el disseny d’estratègies terapèutiques, així com l’assessorament genètic a la família. En la tesi que es presenta s’han utilitzat diferents estratègies, pel que fa a tecnologies i models de malalties, amb l’objectiu d’esbrinar la contribució d’alteracions genètiques i epigenètiques en l’etiopatogènia de les malformacions congènites. S’han analitzat variacions en número de còpia, patrons de metilació, així com mutacions puntuals. D’altra banda, també s’ha realitzat un estudi per aprofundir en l’assessorament genètic en relació a una de les noves tècniques moleculars utilitzades. Els resultats obtinguts indiquen que les altercacions genètiques i epigenètiques tenen una contribució molt rellevant en l’etiologia de les malformacions congènites, en alguns casos com a causa única de la malaltia i en altres com a component d’un model oligogènic o multifactorial.
author2 Pérez Jurado, Luis Alberto
author_facet Pérez Jurado, Luis Alberto
Serra Juhé, Clara, 1984-
author Serra Juhé, Clara, 1984-
author_sort Serra Juhé, Clara, 1984-
title Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling
title_short Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling
title_full Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling
title_fullStr Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling
title_full_unstemmed Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling
title_sort genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling
publisher Universitat Pompeu Fabra
publishDate 2012
url http://hdl.handle.net/10803/96194
work_keys_str_mv AT serrajuheclara1984 geneticgenomicandepigeneticalterationsincongenitalmalformationsimplicationsingeneticcounseling
_version_ 1716592909450477568
spelling ndltd-TDX_UPF-oai-www.tdx.cat-10803-961942013-07-11T03:42:42ZGenetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counselingSerra Juhé, Clara, 1984-Malformacions congènitesMalformacions cardíaques congènitesEpigenèticaVariacions en número de còpia (CNV)Mutacions puntualsAssessorament genèticAnálisis cromosòmica en micromatriusSeqüenciació d’exomaMetilació del DNACongenital malformationsCongenital heart defectsEpigeneticsCopy number variation (CNV)Point mutationsGenetic counselingChromosomal microarray analysisExome sequencingDNA methylation575Mechanisms underlying congenital malformations are largely unknown despite its high incidence, affecting 2-3% of liveborn infants. A broader knowledge about the causes of birth defects would provide valuable information regarding the outcome and prognosis of the anomaly, the development and establishment of diagnostic protocols, the design of therapeutic strategies and genetic counseling to the family. Different approaches have been used in the present thesis regarding technologies and model diseases to elucidate the contribution of genetic and epigenetic alterations in the etiopathogenesis of congenital malformations. Copy number variations, methylation patterns, as well as point mutations have been explored. Moreover, a study to analyze genetic counseling in relation to one of the new molecular techniques used has been performed. Obtained data reveal a relevant role of genetic and epigenetic alterations in congenital malformations, in some cases as a unique cause to explain the disease and in others as part of an oligogenic or multifactorial model.Els mecanismes causants de les malformacions congènites són poc coneguts malgrat l’elevada incidència d’aquestes patologies, que afecten el 2-3% de recent nascuts. Un coneixement més ampli de les causes de les anomalies congènites proporcionaria informació rellevant pel que fa al pronòstic de l’anomalia, el desenvolupament i establiment de protocols diagnòstics, el disseny d’estratègies terapèutiques, així com l’assessorament genètic a la família. En la tesi que es presenta s’han utilitzat diferents estratègies, pel que fa a tecnologies i models de malalties, amb l’objectiu d’esbrinar la contribució d’alteracions genètiques i epigenètiques en l’etiopatogènia de les malformacions congènites. S’han analitzat variacions en número de còpia, patrons de metilació, així com mutacions puntuals. D’altra banda, també s’ha realitzat un estudi per aprofundir en l’assessorament genètic en relació a una de les noves tècniques moleculars utilitzades. Els resultats obtinguts indiquen que les altercacions genètiques i epigenètiques tenen una contribució molt rellevant en l’etiologia de les malformacions congènites, en alguns casos com a causa única de la malaltia i en altres com a component d’un model oligogènic o multifactorial.Universitat Pompeu FabraPérez Jurado, Luis AlbertoUniversitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut2012-10-20info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion206 p.application/pdfhttp://hdl.handle.net/10803/96194TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)enginfo:eu-repo/semantics/openAccessADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.