Enrichissement de paires de gènes dont les interactions causent la schizophrénie à l’aide de bases de données génomiques et application à une étude d'association cas-témoins de l’Est du Québec

• Main Author: Noël, Simon
• Other Authors: Bureau, Alexandre
• Format: Dissertation
• Language: French
• Published: Université Laval 2014
• Subjects: Schizophrénie > Aspect génétique; Gènes
• Online Access: http://hdl.handle.net/20.500.11794/25582

Nous essayons de trouver de nouvelles interactions géniques pouvant donner une résistance ou une susceptibilité pour développer la schizophrénie. Nous avons donc fait l’enrichissement de voies en utilisant GSEA et Biofilter. Nous avons ensuite cherché de nouvelles interactions avec la méthode JE et la régression logistique parmi les paires de gènes identifiées. De plus, nous avons obtenu plus de résultats statistiquement significatifs qu’une sélection se basant sur les valeurs d’association marginale. Par ailleurs, les résultats pointent certains candidats intéressants comme le gène NRXN1 qui code pour une protéine d’adhésion cellulaire du système nerveux et qui aurait une interaction causant une susceptibilité avec le gène ROBO1, un gène impliqué dans la guidance des axones, et une autre avec le gène CDH13, un gène jouant le rôle de régulateur négatif dans la croissance des axones. Ces trois gènes sont déjà liés à la schizophrénie dans la littérature et pourraient servir de biomarqueurs.