An assessment of the shared allelic architecture between type 2 diabetes and prostate cancer
Objective: To determine whether the alleles that influence type 2 diabetes risk and glycemic traits also influence prostate cancer risk. Methods: We used a multiple single nucleotide polymorphisms (SNP) genotypic risk score to assess the average effect of alleles that increase type 2 diabetes risk o...
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McGill University
2013
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Health Sciences - Epidemiology Yu, Hoi Yun Oriana An assessment of the shared allelic architecture between type 2 diabetes and prostate cancer |
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Objective: To determine whether the alleles that influence type 2 diabetes risk and glycemic traits also influence prostate cancer risk. Methods: We used a multiple single nucleotide polymorphisms (SNP) genotypic risk score to assess the average effect of alleles that increase type 2 diabetes risk or worsen glycemic traits on risk of prostate cancer in 19,662 prostate cancer cases and 19,715 controls from the PRACTICAL consortium and 5,504 prostate cancer cases and 5,834 controls from the CRUK prostate cancer study. We then determined if the calculated effect of these alleles was consistent with the effect predicted from observational studies assessing the relationship between type 2 diabetes and prostate cancer. Results: Calculating the average additive effect of type 2 diabetes or glycemic trait risk alleles on prostate cancer risk using a logistic model revealed no evidence of a shared allelic architecture between type 2 diabetes, or worsened glycemic status, with prostate cancer risk (odds ratio for type 2 diabetes alleles: 1.00 (95% CI: 0.99-1.02), fasting glycemia alleles: 1.00 (95% CI: 0.99-1.02), HbA1c alleles: 1.00 (95% CI: 0.97-1.04), 2 hour OGTT alleles: 1.01 (95% CI: 1.00-1.03) and HOMA-B alleles: 0.99 (95% CI: 0.94-1.04)). The predicted effect of type 2 diabetes alleles using estimated effects from observational studies did not overlap with the genetically estimated effects. Conclusions: Using genetic data from large consortia we found no evidence for a shared genetic etiology of type 2 diabetes, or glycemic risk, with prostate cancer. This suggests that the association between type 2 diabetes and prostate cancer observed in observational studies may be due to residual or unexplained confounding. === Objectif: Déterminer si les allèles qui influencent le risque de diabète de type 2 et les facteurs modifiant la glycémie influencent aussi le risque du cancer de la prostate. Méthodes: Nous avons utilisé un score de risque génotypique utilisant de multiple polymorphismes nucléotidiques simples (SNPs) pour évaluer l'effet moyen des allèles qui augmentent le risque de diabète de type 2 ou aggravent les facteurs modifiant la glycémie sur le risque de cancer de la prostate chez 19 662 cas de cancer de la prostate et 19 715 cas contrôles du consortium pratique, et chez 5504 cas de cancer de la prostate et 5834 cas contrôles de l'étude sur le cancer de la prostate CRUK. Nous avons ensuite déterminé si l'effet calculé de ces allèles était compatible avec l'effet prévu décrit dans les études observationnelles évaluant la relation entre le diabète de type 2 et le cancer de la prostate. Résultats: Les calculs de l'effet additif moyen des allèles du diabète de type 2 ou des facteurs modifiant la glycémie sur le risque de cancer de la prostate à l'aide d'un modèle logistique n'ont révélé aucun signe d'architecture allélique partagé entre le diabète de type 2 ou l'aggravation du statut glycémique, et le risque de cancer de la prostate (rapport des risques pour les allèles du diabète de type 2: 1,00 (95% intervalle de confiance: 0.99-1.02), les allèles de la glycémie à jeun: 1,00 (95% intervalle de confiance: 0.99-1.02), les allèles de l'HbA1c: 1,00 (95% intervalle de confiance : 0.97-1.04), les allèles de l'HGOP à 2 heures: 1,01 (95% intervalle de confiance : 1.00-1.04) et les allèles de HOMA-B: 0,99 (95% intervalle de confiance : 0.94-1.04)). L'effet prédit des allèles du diabète de type 2 sur le risque de cancer de la prostate utilisant les effets estimés à partir d'études observationnelles ne se chevauche pas avec les effets estimés génétiquement. Conclusions: En utilisant des données génétiques de grands consortiums, nous n'avons trouvé aucune preuve d'une étiologie génétique commune entre le diabète de type 2 ou les facteurs modifiant la glycémie et le cancer de la prostate. Ceci suggère que l'association entre le diabète de type 2 et le cancer de la prostate, tel qu'observée dans les études d'observation, peut être due à des facteurs de confusion résiduels ou inexpliqués. |
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ndltd-LACETR-oai-collectionscanada.gc.ca-QMM.1193332014-02-13T04:12:04ZAn assessment of the shared allelic architecture between type 2 diabetes and prostate cancerYu, Hoi Yun OrianaHealth Sciences - EpidemiologyObjective: To determine whether the alleles that influence type 2 diabetes risk and glycemic traits also influence prostate cancer risk. Methods: We used a multiple single nucleotide polymorphisms (SNP) genotypic risk score to assess the average effect of alleles that increase type 2 diabetes risk or worsen glycemic traits on risk of prostate cancer in 19,662 prostate cancer cases and 19,715 controls from the PRACTICAL consortium and 5,504 prostate cancer cases and 5,834 controls from the CRUK prostate cancer study. We then determined if the calculated effect of these alleles was consistent with the effect predicted from observational studies assessing the relationship between type 2 diabetes and prostate cancer. Results: Calculating the average additive effect of type 2 diabetes or glycemic trait risk alleles on prostate cancer risk using a logistic model revealed no evidence of a shared allelic architecture between type 2 diabetes, or worsened glycemic status, with prostate cancer risk (odds ratio for type 2 diabetes alleles: 1.00 (95% CI: 0.99-1.02), fasting glycemia alleles: 1.00 (95% CI: 0.99-1.02), HbA1c alleles: 1.00 (95% CI: 0.97-1.04), 2 hour OGTT alleles: 1.01 (95% CI: 1.00-1.03) and HOMA-B alleles: 0.99 (95% CI: 0.94-1.04)). The predicted effect of type 2 diabetes alleles using estimated effects from observational studies did not overlap with the genetically estimated effects. Conclusions: Using genetic data from large consortia we found no evidence for a shared genetic etiology of type 2 diabetes, or glycemic risk, with prostate cancer. This suggests that the association between type 2 diabetes and prostate cancer observed in observational studies may be due to residual or unexplained confounding.Objectif: Déterminer si les allèles qui influencent le risque de diabète de type 2 et les facteurs modifiant la glycémie influencent aussi le risque du cancer de la prostate. Méthodes: Nous avons utilisé un score de risque génotypique utilisant de multiple polymorphismes nucléotidiques simples (SNPs) pour évaluer l'effet moyen des allèles qui augmentent le risque de diabète de type 2 ou aggravent les facteurs modifiant la glycémie sur le risque de cancer de la prostate chez 19 662 cas de cancer de la prostate et 19 715 cas contrôles du consortium pratique, et chez 5504 cas de cancer de la prostate et 5834 cas contrôles de l'étude sur le cancer de la prostate CRUK. Nous avons ensuite déterminé si l'effet calculé de ces allèles était compatible avec l'effet prévu décrit dans les études observationnelles évaluant la relation entre le diabète de type 2 et le cancer de la prostate. Résultats: Les calculs de l'effet additif moyen des allèles du diabète de type 2 ou des facteurs modifiant la glycémie sur le risque de cancer de la prostate à l'aide d'un modèle logistique n'ont révélé aucun signe d'architecture allélique partagé entre le diabète de type 2 ou l'aggravation du statut glycémique, et le risque de cancer de la prostate (rapport des risques pour les allèles du diabète de type 2: 1,00 (95% intervalle de confiance: 0.99-1.02), les allèles de la glycémie à jeun: 1,00 (95% intervalle de confiance: 0.99-1.02), les allèles de l'HbA1c: 1,00 (95% intervalle de confiance : 0.97-1.04), les allèles de l'HGOP à 2 heures: 1,01 (95% intervalle de confiance : 1.00-1.04) et les allèles de HOMA-B: 0,99 (95% intervalle de confiance : 0.94-1.04)). L'effet prédit des allèles du diabète de type 2 sur le risque de cancer de la prostate utilisant les effets estimés à partir d'études observationnelles ne se chevauche pas avec les effets estimés génétiquement. Conclusions: En utilisant des données génétiques de grands consortiums, nous n'avons trouvé aucune preuve d'une étiologie génétique commune entre le diabète de type 2 ou les facteurs modifiant la glycémie et le cancer de la prostate. Ceci suggère que l'association entre le diabète de type 2 et le cancer de la prostate, tel qu'observée dans les études d'observation, peut être due à des facteurs de confusion résiduels ou inexpliqués. McGill UniversityJohn Brent Richards (Internal/Supervisor)Laurent Azoulay (Internal/Cosupervisor2)2013Electronic Thesis or Dissertationapplication/pdfenElectronically-submitted theses.All items in eScholarship@McGill are protected by copyright with all rights reserved unless otherwise indicated.Master of Science (Department of Epidemiology and Biostatistics) http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=119333 |