Phytophthora genties patogenų, pažeidžiančių VDU Kauno botanikos sode augančius juodalksnius (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), nustatymas ir identifikavimas

Vieni iš pastaruoju metu sparčiai plintančių augalų patogenų – Phytophthora genties patogenai. Šios genties patogenai pažeidžia vertingus vietinius ir iš svetimų kraštų kilusius augalus, augančius natūraliose augavietėse, miestų želdynuose ir medelynuose. Labai svarbu Phytophthora genties įvairių rū...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Navikienė, Ilona
Other Authors: Snieškienė, Vilija
Format: Dissertation
Language:Lithuanian
Published: Lithuanian Academic Libraries Network (LABT) 2014
Subjects:
Online Access:http://vddb.library.lt/fedora/get/LT-eLABa-0001:E.02~2014~D_20140611_141612-47958/DS.005.0.01.ETD
id ndltd-LABT_ETD-oai-elaba.lt-LT-eLABa-0001-E.02~2014~D_20140611_141612-47958
record_format oai_dc
spelling ndltd-LABT_ETD-oai-elaba.lt-LT-eLABa-0001-E.02~2014~D_20140611_141612-479582014-06-13T03:51:05Z2014-06-11litBiologyNavikienė, IlonaPhytophthora genties patogenų, pažeidžiančių VDU Kauno botanikos sode augančius juodalksnius (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), nustatymas ir identifikavimasDetection and identification of Phytophthora genus pathogens that affect growing alder (Alnus glutinosa (L.) Gaertn.) in VDU Kaunas botanical gardenLithuanian Academic Libraries Network (LABT)Vieni iš pastaruoju metu sparčiai plintančių augalų patogenų – Phytophthora genties patogenai. Šios genties patogenai pažeidžia vertingus vietinius ir iš svetimų kraštų kilusius augalus, augančius natūraliose augavietėse, miestų želdynuose ir medelynuose. Labai svarbu Phytophthora genties įvairių rūšių patogenų sukeliamas ligas kuo greičiau diagnozuoti, nustatyti šių grybų sąveiką su kitų rūšių patogeniniais organizmais bei pažeidžiamomis augalų rūšimis. Šio darbo tikslas – įvertinti juodalksnių (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), augančių VDU Kauno botanikos sode, pažeistumą Phytophthora genties organizmais: iš infekuotų audinių išauginti ir morfologiškai apibūdinti grynas patogenų kultūras, identifikuoti patogenus naudojant ekspres testą ALERTTM bei išskirti DNR iš infekuotos medienos, lapų ir dirvožemio. Patogenais infekuoti ėminiai buvo auginami 12-oje Petri lėkštelių su morkų gabalėlių terpe ir 11-oje Petri lėkštelių su salyklo ekstrakto su chloramfenikoliu mitybine terpe. Greituoju testu buvo tikrinami 6 dirvožemio pavyzdžiai. Patogenų DNR buvo išskiriama iš infekuotos medienos, lapų ir dirvožemio. Phytophthora genties kolonijų augimo nepastebėta. Ištyrus dirvožemio ėminius buvo gauti teigiami testų rezultatai. Genominės DNR, išskirtos iš medienos bei lapų, koncentracija svyravo nuo 0,64 iki 22,66 ng/ml, o DNR, išskirtos iš dirvožemio, koncentracija svyravo nuo 5,78 iki 10,2 ng/ml.Pathogens of Phytophthora genus, are very rapidly spreading plant pathogens, recently. Pathogens of this genus negatively effect valuable local plants and those, which are brought from foreign lands ang grow in natural habitats, urban green plantations and arboretums. It is very important to identify diseases, which are caused by this species or other Phytophthora‘s genus pathogens and to identify interaction of these fungi and other pathogenic organisms species, negatively effected plant species. The aim of the study is to assess the damage done by Phytophthora genus organisms to black alders (Alnus glutinosa), growing in VMU Kaunas botanical garden: to morphologically characterize pure culturs of pathogens and grow them from infected tussues, identify pathogens using Express ALERTTM test and extract DNA from infected wood, leaves and soil. Pathogen-infected samples were grown in 12 Petri dishes with carrot medium and in 11 Petri dishes with malt extract and chloramphenicol medium. High-speed test was used for 6 samples of the soil. Pathogen‘s DNA was extracted from infected wood, leaves and soil.Growth of Phytophthora genus polony was not observed. After the analysis of soil-positive test result was obtained. Concentration of genomic DNA from the wood and leaves was 0,64-22,66 ng/ml from leaves and 5,78-10,2 ng/ml from soil.OomicetaiPhytophthoraJuodalksnisSelektyvios terpėsOomycetesPhytophthoraBlack alderSelektive mediaMaster thesisSnieškienė, VilijaČepurnienė, KarolinaVytautas Magnus UniversityVytautas Magnus Universityhttp://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2014~D_20140611_141612-47958LT-eLABa-0001:E.02~2014~D_20140611_141612-47958VDU-omhaogxpsdq-20140523-223513http://vddb.library.lt/fedora/get/LT-eLABa-0001:E.02~2014~D_20140611_141612-47958/DS.005.0.01.ETDUnrestrictedapplication/pdf
collection NDLTD
language Lithuanian
format Dissertation
sources NDLTD
topic Biology
Oomicetai
Phytophthora
Juodalksnis
Selektyvios terpės
Oomycetes
Phytophthora
Black alder
Selektive media
spellingShingle Biology
Oomicetai
Phytophthora
Juodalksnis
Selektyvios terpės
Oomycetes
Phytophthora
Black alder
Selektive media
Navikienė, Ilona
Phytophthora genties patogenų, pažeidžiančių VDU Kauno botanikos sode augančius juodalksnius (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), nustatymas ir identifikavimas
description Vieni iš pastaruoju metu sparčiai plintančių augalų patogenų – Phytophthora genties patogenai. Šios genties patogenai pažeidžia vertingus vietinius ir iš svetimų kraštų kilusius augalus, augančius natūraliose augavietėse, miestų želdynuose ir medelynuose. Labai svarbu Phytophthora genties įvairių rūšių patogenų sukeliamas ligas kuo greičiau diagnozuoti, nustatyti šių grybų sąveiką su kitų rūšių patogeniniais organizmais bei pažeidžiamomis augalų rūšimis. Šio darbo tikslas – įvertinti juodalksnių (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), augančių VDU Kauno botanikos sode, pažeistumą Phytophthora genties organizmais: iš infekuotų audinių išauginti ir morfologiškai apibūdinti grynas patogenų kultūras, identifikuoti patogenus naudojant ekspres testą ALERTTM bei išskirti DNR iš infekuotos medienos, lapų ir dirvožemio. Patogenais infekuoti ėminiai buvo auginami 12-oje Petri lėkštelių su morkų gabalėlių terpe ir 11-oje Petri lėkštelių su salyklo ekstrakto su chloramfenikoliu mitybine terpe. Greituoju testu buvo tikrinami 6 dirvožemio pavyzdžiai. Patogenų DNR buvo išskiriama iš infekuotos medienos, lapų ir dirvožemio. Phytophthora genties kolonijų augimo nepastebėta. Ištyrus dirvožemio ėminius buvo gauti teigiami testų rezultatai. Genominės DNR, išskirtos iš medienos bei lapų, koncentracija svyravo nuo 0,64 iki 22,66 ng/ml, o DNR, išskirtos iš dirvožemio, koncentracija svyravo nuo 5,78 iki 10,2 ng/ml. === Pathogens of Phytophthora genus, are very rapidly spreading plant pathogens, recently. Pathogens of this genus negatively effect valuable local plants and those, which are brought from foreign lands ang grow in natural habitats, urban green plantations and arboretums. It is very important to identify diseases, which are caused by this species or other Phytophthora‘s genus pathogens and to identify interaction of these fungi and other pathogenic organisms species, negatively effected plant species. The aim of the study is to assess the damage done by Phytophthora genus organisms to black alders (Alnus glutinosa), growing in VMU Kaunas botanical garden: to morphologically characterize pure culturs of pathogens and grow them from infected tussues, identify pathogens using Express ALERTTM test and extract DNA from infected wood, leaves and soil. Pathogen-infected samples were grown in 12 Petri dishes with carrot medium and in 11 Petri dishes with malt extract and chloramphenicol medium. High-speed test was used for 6 samples of the soil. Pathogen‘s DNA was extracted from infected wood, leaves and soil.Growth of Phytophthora genus polony was not observed. After the analysis of soil-positive test result was obtained. Concentration of genomic DNA from the wood and leaves was 0,64-22,66 ng/ml from leaves and 5,78-10,2 ng/ml from soil.
author2 Snieškienė, Vilija
author_facet Snieškienė, Vilija
Navikienė, Ilona
author Navikienė, Ilona
author_sort Navikienė, Ilona
title Phytophthora genties patogenų, pažeidžiančių VDU Kauno botanikos sode augančius juodalksnius (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), nustatymas ir identifikavimas
title_short Phytophthora genties patogenų, pažeidžiančių VDU Kauno botanikos sode augančius juodalksnius (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), nustatymas ir identifikavimas
title_full Phytophthora genties patogenų, pažeidžiančių VDU Kauno botanikos sode augančius juodalksnius (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), nustatymas ir identifikavimas
title_fullStr Phytophthora genties patogenų, pažeidžiančių VDU Kauno botanikos sode augančius juodalksnius (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), nustatymas ir identifikavimas
title_full_unstemmed Phytophthora genties patogenų, pažeidžiančių VDU Kauno botanikos sode augančius juodalksnius (Alnus glutinosa (L.) Gaetrn.), nustatymas ir identifikavimas
title_sort phytophthora genties patogenų, pažeidžiančių vdu kauno botanikos sode augančius juodalksnius (alnus glutinosa (l.) gaetrn.), nustatymas ir identifikavimas
publisher Lithuanian Academic Libraries Network (LABT)
publishDate 2014
url http://vddb.library.lt/fedora/get/LT-eLABa-0001:E.02~2014~D_20140611_141612-47958/DS.005.0.01.ETD
work_keys_str_mv AT navikieneilona phytophthoragentiespatogenupazeidzianciuvdukaunobotanikossodeauganciusjuodalksniusalnusglutinosalgaetrnnustatymasiridentifikavimas
AT navikieneilona detectionandidentificationofphytophthoragenuspathogensthataffectgrowingalderalnusglutinosalgaertninvdukaunasbotanicalgarden
_version_ 1716669190763446272