AnÃlise de comunidades microbianas de solo de manguezal por T-RFLP e microarranjos de DNA

• Main Author: Fernanda Araujo Paes
• Other Authors: VÃnia Maria Maciel Melo
• Format: Others
• Language: Portuguese
• Published: Universidade Federal do Cearà 2008
• Subjects: MICROBIOLOGIA APLICADA
• Online Access: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2712

FundaÃÃo de Amparo à Pesquisa do Estado do Cearà === The mangroves are essistemas important and productive, found along the coastline of tropical and subtropical regions. Important processes such as nutrient cycling, are directly connected to the activity of soil microbial communities. Given its strategic position the mangroves are very impacted the world. In Brazil, important areas such as the Bay of All Saints (BA) are severely affected by the presence of oil. Understanding the adaptation of the microbiota and its local dynamics, before the environmental change is essential to be able to maintain or restore these ecosystems. This thesis investigated the structure and function of microbial communities in a mangrove area of the Bay of All Saints polluted by the oil industry. Two sites were sampled - one located in the refinement of the industry and another, distant location and used as the control. Besides the measured abiotic data, two independent methods of cultivation were used: T-RFLP and DNA microarranjos. The results of both sites in the experiments of T-RFLP showed that the two bacterial communities differ in their structure. For the site sampled in the refinery, a greater number of Otus suggests an environmental stimulus, the bacterial community, a fact associÃvel the high organic matter content of the site. For microarranjos DNA, similar categories of genes were detected in both places, but the specificity of their sequences were distinct. The genes that encode for the remediation organic, were more representative, more than 40% in total in the two sites. Even detecting similar categories, only 4% of the gene sequences were common to the sites. These data show that different bodies are responsible for similar functions at each point. The difference between the sites observed in the experiments can be related with the fact that Site 1 is located in a region heavily affected by oil. Using the ecological data rates of T-RFLP indicated the site 1 as the most diverse, while the results with the DNA microarranjos show the opposite. In conclusion, the structure and function of the local microbiota are affected by the presence of the oil industry. Additional studies may help understand the dynamics of microbial communities, facing the future exposure to the oil and / or derivatives. === Os manguezais sÃo essistemas importantes e produtivos, encontrados ao longo da linha da costa de regiÃes tropicias e subtropicais. Processos importantes como a ciclagem de nutrientes, estÃo diretamente conectados à atividade das comunidades microbianas desses solos. Dada sua posiÃÃo estratÃgica os manguezais sÃo bastante impactados no mundo todo. No Brasil, Ãreas importantes como a da BaÃa de todos os Santos (BA) sÃo severamente afetadas pela presenÃa do petrÃleo. Compreender as adaptaÃÃes da microbiota local e sua dinÃmica, frente Ãs alteraÃÃes ambientais, à essencial para que se consiga manter ou restaurar esses ecossistemas. A presente dissertaÃÃo investigou a estrutura e a funÃÃo de comunidades microbianas em uma Ãrea de manguezal da baÃa de Todos os Santos poluÃda pela indÃstria do petrÃleo. Dois locais foram amostrados - um, situado na Ãrea de refinamento dessa indÃstria e o outro, distante desse local e usado como controle. AlÃm dos dados abiÃticos medidos, dois mÃtodos independentes de cultivo foram utilizados: T-RFLP e microarranjos de DNA. Os resultados de ambos os sÃtios nos experimentos de T-RFLP mostraram que as duas comunidades bacterianas diferem quanto à sua estrutura. Para o sÃtio amostrado na refinaria, um nÃmero maior de OTUs sugere um estÃmulo ambiental, na comunidade bacteriana, fato associÃvel ao alto teor de matÃria orgÃnica desse local. Para os microarranjos de DNA, categorias similares de genes foram detectados, em ambos os locais, mas a especificidade de suas sequÃncias foi distinta. Os genes que codificam para a remediaÃÃo orgÃnica, foram os mais representativos, mais de 40% no total nos dois sÃtios. Mesmo detectando categorias semelhantes, apenas 4% das sequÃncias genÃticas foram comuns aos sÃtios. Estes dados mostram que organismos diferentes sÃo responsÃveis por funÃÃes similares em cada ponto. A diferenÃa entre os locais observadas nos experimentos pode ser relacionada, com o fato do sÃtio 1 situar-se numa regiÃo fortemente afetada por hidrocarbonetos. Utilizando-se Ãndices ecolÃgicos os dados de T-RFLP indicaram o sÃtio 1 como o mais diverso, enquantoo os resultados com os microarranjos de DNA mostram o oposto. Concluindo, a estrutura e funÃÃo da microbiota local sÃo afetadas pela presenÃa da indÃstria do petrÃleo. Estudos adicionais poderÃo ajudar a compreender a dinÃmica dessas comunidades microbianas, frente Ãs futuras exposiÃÃes ao Ãleo e/ou derivados.