Perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com AMBER99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular

Os compostos perfluorados possuem potencial para terapias de ventilação líquida e como substituintes sintéticos de sangue. No presente trabalho, propõe-se um campo de força consistente com a metodologia AMBER para perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas. As densidades e entalpias de evaporaçã...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Nitschke, William Kelbert
Other Authors: Stassen, Hubert Karl
Format: Others
Language:Portuguese
Published: 2011
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10183/28304
id ndltd-IBICT-oai-www.lume.ufrgs.br-10183-28304
record_format oai_dc
spelling ndltd-IBICT-oai-www.lume.ufrgs.br-10183-283042019-01-22T01:38:54Z Perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com AMBER99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular Nitschke, William Kelbert Stassen, Hubert Karl Dinâmica molecular Flúor Oxigênio Solvatação Os compostos perfluorados possuem potencial para terapias de ventilação líquida e como substituintes sintéticos de sangue. No presente trabalho, propõe-se um campo de força consistente com a metodologia AMBER para perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas. As densidades e entalpias de evaporação calculadas discordam dos valores experimentais por no máximo 6%. O cálculo da energia livre de Gibbs de solvatação de O2 por criação da molécula de O2 em C6F14 resultou em valores com três ordens de grandeza diferentes dos valores experimentais, enquanto o cálculo da diferença da energia livre de solvatação de O2 em C6H14 e C6F14 resultou em 50 kJ.mol-1, comparado com o valor experimental de 29 kJ.mol-1. A análise de estrutura local da interação gás-líquido a partir de funções de distribuição radial não mostrou variação na estrutura local do líquido, mostrando que a facilidade da solvatação é devida a pouca ou inexistente reorganização do líquido. Apesar disso, as funções de distribuição radiais dependentes do tempo dos átomos de flúor ou hidrogênio com referência nos átomos de oxigênio indicaram solvatação efetiva de O2 no perfluorohexano, enquanto que em hexano, octano e perfluoroctano mostrou crescimento lento e desordenado, resultado que pode ser interpretado como solvatação ineficaz ou inexistente em tais líquidos. Perfluorinated compounds possess potencial to liquid ventilation therapy and as synthetic blood substituints. In the present work, we propose a AMBER-consistent force field designed for linear perfluoroalkanes and perfluorodecalin. The calculated densities and vaporization enthalpies diverge from the experimental values by at most 6%. The Gibbs’ free energy of solvation of O2 calculated from creation of the O2 molecule inside bulk C6F14 diverged by three orders of magnitude from the experimental value, while the difference of Gibbs’ free energy of salvation of O2 in C6H14 and C6F14 was computed to be 50 kJ.mol-1, while the experimental value is 29 kJ.mol-1. The analysis of local structuration of the liquid-gas interaction, based on radial distribution functions, did not show changes in the local structure of the liquid perfluoroalkanes, implying that the easy solvation is due to little or none liquid reorganization. Nevertheless, the time-dependent radial distribution functions of fluorine or hydrogen atoms, taking the oxygen atoms as reference, indicated effective solvation of O2 in perfluorohexano, while in octane, hexane and perfluorooctane it showed slow and chaothic growth, a result that could be interpreted as an ineffective or inexistent solvation in such liquids. 2011-03-30T05:59:40Z 2011 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis http://hdl.handle.net/10183/28304 000768219 por info:eu-repo/semantics/openAccess application/pdf reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul instacron:UFRGS
collection NDLTD
language Portuguese
format Others
sources NDLTD
topic Dinâmica molecular
Flúor
Oxigênio
Solvatação
spellingShingle Dinâmica molecular
Flúor
Oxigênio
Solvatação
Nitschke, William Kelbert
Perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com AMBER99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular
description Os compostos perfluorados possuem potencial para terapias de ventilação líquida e como substituintes sintéticos de sangue. No presente trabalho, propõe-se um campo de força consistente com a metodologia AMBER para perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas. As densidades e entalpias de evaporação calculadas discordam dos valores experimentais por no máximo 6%. O cálculo da energia livre de Gibbs de solvatação de O2 por criação da molécula de O2 em C6F14 resultou em valores com três ordens de grandeza diferentes dos valores experimentais, enquanto o cálculo da diferença da energia livre de solvatação de O2 em C6H14 e C6F14 resultou em 50 kJ.mol-1, comparado com o valor experimental de 29 kJ.mol-1. A análise de estrutura local da interação gás-líquido a partir de funções de distribuição radial não mostrou variação na estrutura local do líquido, mostrando que a facilidade da solvatação é devida a pouca ou inexistente reorganização do líquido. Apesar disso, as funções de distribuição radiais dependentes do tempo dos átomos de flúor ou hidrogênio com referência nos átomos de oxigênio indicaram solvatação efetiva de O2 no perfluorohexano, enquanto que em hexano, octano e perfluoroctano mostrou crescimento lento e desordenado, resultado que pode ser interpretado como solvatação ineficaz ou inexistente em tais líquidos. === Perfluorinated compounds possess potencial to liquid ventilation therapy and as synthetic blood substituints. In the present work, we propose a AMBER-consistent force field designed for linear perfluoroalkanes and perfluorodecalin. The calculated densities and vaporization enthalpies diverge from the experimental values by at most 6%. The Gibbs’ free energy of solvation of O2 calculated from creation of the O2 molecule inside bulk C6F14 diverged by three orders of magnitude from the experimental value, while the difference of Gibbs’ free energy of salvation of O2 in C6H14 and C6F14 was computed to be 50 kJ.mol-1, while the experimental value is 29 kJ.mol-1. The analysis of local structuration of the liquid-gas interaction, based on radial distribution functions, did not show changes in the local structure of the liquid perfluoroalkanes, implying that the easy solvation is due to little or none liquid reorganization. Nevertheless, the time-dependent radial distribution functions of fluorine or hydrogen atoms, taking the oxygen atoms as reference, indicated effective solvation of O2 in perfluorohexano, while in octane, hexane and perfluorooctane it showed slow and chaothic growth, a result that could be interpreted as an ineffective or inexistent solvation in such liquids.
author2 Stassen, Hubert Karl
author_facet Stassen, Hubert Karl
Nitschke, William Kelbert
author Nitschke, William Kelbert
author_sort Nitschke, William Kelbert
title Perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com AMBER99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular
title_short Perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com AMBER99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular
title_full Perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com AMBER99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular
title_fullStr Perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com AMBER99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular
title_full_unstemmed Perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com AMBER99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular
title_sort perfluoroalcanos lineares e perfluorodecalinas: parametrização de campo de força consistente com amber99 e estudo da solvatação do oxigênio molecular
publishDate 2011
url http://hdl.handle.net/10183/28304
work_keys_str_mv AT nitschkewilliamkelbert perfluoroalcanoslineareseperfluorodecalinasparametrizacaodecampodeforcaconsistentecomamber99eestudodasolvatacaodooxigeniomolecular
_version_ 1718939637690400768