Avaliação da prevalência de resistência transmitida aos antirretrovirais em indivíduos infectados pelo HIV-1 em Salvador- Bahia

• Main Author: Silva, Marcio de Oliveira
• Other Authors: Cunha, Joana Paixão Monteiro
• Language: Portuguese
• Published: Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz 2014
• Subjects: HIV-1; Resistência Transmitida; Calibração da População com Resistência; Filogenética; Stanford; Transmitted resistance; Calibration of Population Resistance; Phylogenetics
• Online Access: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/8395

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([e-mail]) on 2014-09-18T13:33:05Z No. of bitstreams: 1 Márcio de Oliveira Silva. Avaliação da prevalência... 2014.pdf: 5895290 bytes, checksum: 23d36b43222147ccb7ea4d91986a1c34 (MD5) === Made available in DSpace on 2014-09-18T13:33:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Márcio de Oliveira Silva. Avaliação da prevalência... 2014.pdf: 5895290 bytes, checksum: 23d36b43222147ccb7ea4d91986a1c34 (MD5) Previous issue date: 2014 === Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil === Avaliar a prevalência de resistência transmitida aos antirretrovirais em indivíduos infectados pelo HIV-1 em acompanhamento clínico e laboratorial na cidade de Salvador-Bahia. Estudo descritivo de corte transversal com amostragem de conveniência composto por 121 pacientes infectados pelo HIV-1, com 18 anos de idade ou mais, virgens de tratamento antirretrovial e que fazem coletas de exame para quantificação das Subpopulações Linfocitárias e da carga viral sérica do HIV-1 no Laboratório de Retrovírus do Hospital Universitário Professor Edgard Santos ou no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa (CEDAP). Os pacientes foram entrevistados para preenchimento de um questionário epidémiologico e consentiram na utilização do excedente de sangue para realização do sequenciamento do gene pol do HIV-1 contendo parte da Transcriptase e da Protease para análise das mutações de resistência aos antirretrovirais e a caracterização genotípica, análise de recombinações e estudo da história evolutiva viral. Entre os 103 pacientes 66% são do sexo masculino, a mediana de idade e do tempo estimado do diagnóstico do HIV-1 são respectivamente de 35 anos e 29 meses. A principal categoria de exposição relatada foi a sexual com 88,3%, seguida por 3% com acidentes com perfurocortantes e 1% uso de drogas intravenosas. A mediana da contagem dos Linfócitos TCD4+ foi de 438 cel/mm3 e de 4,4 log10. Na análise de Mutação de Resistência à Fármacos (DRM) atráves da ferramenta de Calibração da População com Resistência (CPR) observamos uma prevalência global de 6,8%, 3 (2,9%) amostras com DRM aos Inibidores da Transcriptase nãoanálogos aos nucleos(t)ídeos (ITRNN), 2 (1,9%) aos Inibidores da Transcriptase análogos aos nucleos(t)ídeos (ITRN) e 2 (1,9%) aos IP. Entre as 104 sequências, cinco foram excluídas da análise de filogenética devido a problemas na qualidade. A prevalência dos subtipos seguiram as seguintes distribuições: 71,8% subtipo B, 15,1% F, 9,1% formas recombinantes e 4% C. Entre as amostras classificadas como recombinantes uma não foi possível classificar e todas as demais apresentaram padrões de recombinação do tipo BF sendo 5 semelhantes à CRF28/29_BF, 2 à CRF12_BF e 1 à CRF39_BF. O presente estudo evidencia valores intermédiarios de DRM na cidade de Salvador segundo a metodologia CPR. Os achados filogenéticos assemelham-se aos previamentes descritos na literatura em Salvador === To evaluate the prevalence of transmitted resistance to antiretroviral drugs in patients infected with HIV- 1 assisted in the city of Salvador, Bahia. A descriptive crosssectional study with 121 patients with 18 years of age or older, chronic or recent diagnosis of HIV -1, antirretrovial naïve and make collections for examination and quantification of lymphocyte subpopulations serum viral load of HIV -1 in the Retrovirus Laboratory, Hospital Universitário Professor Edgard Santos or in Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa (CEDAP). Patients were interviewed to fill an epidemiological questionnaire and consented to the use of drawed blood to be sequenced of the transcriptase and protease region of the pol gene of HIV - 1 for analysis of antiretroviral resistance mutations and subtype viral. Of the 121 patients, 104 sequences for phylogenetic analysis and transmitted resistance were obtained, 18 individuals were excluded due quality or amplification problems. Among 103 patients 66% were male, the median age and the estimated time of diagnosis of HIV -1 were respectively 35 and 29 months. The main category of reported exposure was sexual with 88.3%, followed by 3% with Occupational Exposure and 1% use of Intravenous Drugs. The median CD4 + lymphocyte count was 438 cells/mm3 and 4.4 log10. The analysis of Drug Resistance Mutation (DRM) by Calibrating Population Resistance tool (CPR) has a global prevalence of 6.8%, distributed: 2.9% for Non-nucleoside reverse-transcriptase inhibitors (NNRTIs), 1.9% Nucleoside analog reverse-transcriptase inhibitors (NRTIs) and 1.9% to Protease Inhibitors. Among the 104 sequences, five were excluded from the phylogenetic analysis due to quality problems. The prevalence of subtypes followed these distributions: 71.8% subtype B, 15.1% F, 9.1% recombinant forms and 4% C. Among the samples classified as recombinant, one was not possible to classify and all others showed the BF patterns of recombination, 5 CRF28/29_BF likes, 2 CRF12_BF likes and 1 CRF39_BF likes. The prevalence of subtypes was very similar from previously described in Salvador.