Validação de marcadores moleculares em soja ligados a genes de resistência à podridão radicular de fitóftora
O patógeno Phytophthora sojae, causador da doença conhecida como podridão radicular de fitóftora, constitui um dos principais fatores bióticos que limitam a produtividade da soja, principalmente em anos de chuvas intensas e temperaturas amenas, chegando a ocasionar prejuízos de até 100% na produção...
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Universidade Estadual de Londrina, Instituto Agronômico do Paraná, EMBRAPA. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular.
2013
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O patógeno Phytophthora sojae, causador da doença conhecida como podridão radicular de fitóftora, constitui um dos principais fatores bióticos que limitam a produtividade da soja, principalmente em anos de chuvas intensas e temperaturas amenas, chegando a ocasionar prejuízos de até 100% na produção de grãos. Este trabalho objetivou a validação de marcadores moleculares microssatélites e SNPs ligados aos genes Rps1k e Rps8, que conferem resistência a P. sojae, para serem utilizados no programa de seleção assistida ao melhoramento para fitóftora. Para a confirmação e saturação da região cromossômica de ambos os genes, foram utilizadas duas populações segregantes F2, BW1 e CP8, consistindo de 138 e 93 individuos, respectivamente, derivados dos cruzamentos entre Williams 82 (portadora do alelo Rps1k) e BRS 133 (suscetível) e PI 399073 (portadora do alelo Rps8) e MG/BR 46 (suscetível). Para a validação dos marcadores moleculares foram utilizadas plantas derivadas do programa de retrocruzamentos oriundas do programa de melhoramento para a fitóftora da Embrapa Soja, especificamente para os genes Rps1k e Rps8. Oito marcadores moleculares foram validados na progênie F2 da população BW1, enquanto que apenas dois marcadores foram validados na progênie F2 da população CP8. Dos marcadores mapeados próximos aos genes Rps1k e Rps8 nas populações BW1 e CP8, foram selecionados três marcadores ligados a cada gene, e testados nas populações provenientes dos retrocruzamentos. Nas populações resultantes dos retrocruzamentos, dois marcadores moleculares foram validados para doze cruzamentos do programa de melhoramento para o gene Rps1k, enquanto que três marcadores foram validados para cinco cruzamentos do programa de melhoramento para o gene Rps8. Os marcadores microssatélites e SNPs validados neste trabalho podem auxiliar o desenvolvimento de futuros trabalhos de melhoramento através da seleção assistida por marcadores moleculares. === The pathogen Phytophthora sojae, causes root rot Phytophthora disease, is major limiting biotic factors soybean productivity. In years of heavy rainfall and mild temperatures, resulting in 100% losses in grain yield rates. This study aimed to validate molecular markers microsatellites and SNPs linked to Rps1k and Rps8 genes, which confer resistance to P. sojae, for use in assisted selection program from Phytophthora breeding. For confirmation and saturation of the chromosomal region from both genes, we used two F2 segregating population, BW1 and CP8 consisting of 138 and 93 individuals, respectively. These populations were derived from crosses between Williams 82 (allele carrier Rps1k) and BRS 133 (susceptible) and PI 399073 (allele carrier Rps8) and MG/BR 46 (susceptible). Plants derived from the backcrosses program, (specifically for the genes Rps1k and Rps8), originated from Embrapa Soja- Phytophthora breeding program were used for molecular markers validation. Eight molecular markers were validated in the F2 population BW1, while only two markers were validated in the F2 population CP8. From the markers mapped close to Rps1k and Rps8 genes in populations BW1 and CP8, we had selected three markers linked to each gene, and tested in backcrosses population. In populations resulting from backcrosses, two molecular markers were validated for the twelve crosses in the breeding program for Rps1k gene, whereas three markers were validated for about five crossings of the breeding program for gene Rps8. Microsatellite markers and SNPs validated on this study may help other breeding studies can aid the development of future breeding through marker-assisted selection. |
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Ricardo Vilela Abdelnoor . Michelle Pires Rincão |
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ndltd-IBICT-oai-uel.br-vtls0001935682019-01-21T16:48:10Z Validação de marcadores moleculares em soja ligados a genes de resistência à podridão radicular de fitóftora Validation of molecular markers in soybean linked to resistance genes to phytophthora root rot Michelle Pires Rincão Ricardo Vilela Abdelnoor . Carlos Alberto Arrabal Arias Ney Sussumu Sakiyama O patógeno Phytophthora sojae, causador da doença conhecida como podridão radicular de fitóftora, constitui um dos principais fatores bióticos que limitam a produtividade da soja, principalmente em anos de chuvas intensas e temperaturas amenas, chegando a ocasionar prejuízos de até 100% na produção de grãos. Este trabalho objetivou a validação de marcadores moleculares microssatélites e SNPs ligados aos genes Rps1k e Rps8, que conferem resistência a P. sojae, para serem utilizados no programa de seleção assistida ao melhoramento para fitóftora. Para a confirmação e saturação da região cromossômica de ambos os genes, foram utilizadas duas populações segregantes F2, BW1 e CP8, consistindo de 138 e 93 individuos, respectivamente, derivados dos cruzamentos entre Williams 82 (portadora do alelo Rps1k) e BRS 133 (suscetível) e PI 399073 (portadora do alelo Rps8) e MG/BR 46 (suscetível). Para a validação dos marcadores moleculares foram utilizadas plantas derivadas do programa de retrocruzamentos oriundas do programa de melhoramento para a fitóftora da Embrapa Soja, especificamente para os genes Rps1k e Rps8. Oito marcadores moleculares foram validados na progênie F2 da população BW1, enquanto que apenas dois marcadores foram validados na progênie F2 da população CP8. Dos marcadores mapeados próximos aos genes Rps1k e Rps8 nas populações BW1 e CP8, foram selecionados três marcadores ligados a cada gene, e testados nas populações provenientes dos retrocruzamentos. Nas populações resultantes dos retrocruzamentos, dois marcadores moleculares foram validados para doze cruzamentos do programa de melhoramento para o gene Rps1k, enquanto que três marcadores foram validados para cinco cruzamentos do programa de melhoramento para o gene Rps8. Os marcadores microssatélites e SNPs validados neste trabalho podem auxiliar o desenvolvimento de futuros trabalhos de melhoramento através da seleção assistida por marcadores moleculares. The pathogen Phytophthora sojae, causes root rot Phytophthora disease, is major limiting biotic factors soybean productivity. In years of heavy rainfall and mild temperatures, resulting in 100% losses in grain yield rates. This study aimed to validate molecular markers microsatellites and SNPs linked to Rps1k and Rps8 genes, which confer resistance to P. sojae, for use in assisted selection program from Phytophthora breeding. For confirmation and saturation of the chromosomal region from both genes, we used two F2 segregating population, BW1 and CP8 consisting of 138 and 93 individuals, respectively. These populations were derived from crosses between Williams 82 (allele carrier Rps1k) and BRS 133 (susceptible) and PI 399073 (allele carrier Rps8) and MG/BR 46 (susceptible). Plants derived from the backcrosses program, (specifically for the genes Rps1k and Rps8), originated from Embrapa Soja- Phytophthora breeding program were used for molecular markers validation. Eight molecular markers were validated in the F2 population BW1, while only two markers were validated in the F2 population CP8. From the markers mapped close to Rps1k and Rps8 genes in populations BW1 and CP8, we had selected three markers linked to each gene, and tested in backcrosses population. In populations resulting from backcrosses, two molecular markers were validated for the twelve crosses in the breeding program for Rps1k gene, whereas three markers were validated for about five crossings of the breeding program for gene Rps8. Microsatellite markers and SNPs validated on this study may help other breeding studies can aid the development of future breeding through marker-assisted selection. 2013-02-27 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis http://www.bibliotecadigital.uel.br/document/?code=vtls000193568 por info:eu-repo/semantics/openAccess Universidade Estadual de Londrina, Instituto Agronômico do Paraná, EMBRAPA. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. URL BR reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UEL instname:Universidade Estadual de Londrina instacron:UEL |