Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico

Neste trabalho de tese, estudamos o modelo de crescimento logístico de populações biológicas utilizando a abordagem de espaço de estados. Os estados não observados são as biomassas anuais, a equação de observação é linear e a equação de estado é não linear. As distribuições de probabilidade util...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Carlos Patricio Montenegro Silva
Other Authors: Marcia D Elia Branco
Language:Portuguese
Published: Universidade de São Paulo 2016
Subjects:
Online Access:http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45133/tde-15052016-104959/
id ndltd-IBICT-oai-teses.usp.br-tde-15052016-104959
record_format oai_dc
spelling ndltd-IBICT-oai-teses.usp.br-tde-15052016-1049592019-01-21T23:25:04Z Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico Bayesian inference in biological population dynamic models with skewed and heavy tailed perturbation terms Carlos Patricio Montenegro Silva Marcia D Elia Branco Heleno Bolfarine Helio dos Santos Migon Manuel Jesus Galea Rojas Reinaldo Boris Arellano Valle Camarão chileno MCMC Modelo de crescimento logístico Modelos dinâmicos não-lineares Chilean shrimp logistic growth model MCMC Nonlinear dynamic models Neste trabalho de tese, estudamos o modelo de crescimento logístico de populações biológicas utilizando a abordagem de espaço de estados. Os estados não observados são as biomassas anuais, a equação de observação é linear e a equação de estado é não linear. As distribuições de probabilidade utilizadas para os termos de erro de observação aditivos são: Normal, t-student, Skew-normal e Skew-t. As distribuições Log-normal, Log-t, Log-skew-normal e Log-skew-t são consideradas para os erros de observação multiplicativos. A inferência nos modelos é realizada considerando-se métodos Bayesianos e as distribuições a posterior de interesse são aproximadas utilizando-se algoritmos MCMC e a aproximação de Laplace. Apresentamos duas aplicações, a primeira referente a pesca de camarão marinho na costa do Chile, na qual a variável observável é o rendimento médio anual de pesca (captura por unidade de esforço média). Na segunda é considerada a pesca de lagostim vermelho na costa de Chile, na qual além do rendimento médio anual da pesca, observa-se as estimativas anuais de biomassa vulnerável, obtidas através de estudos de área varrida. Para o primeiro conjunto de dados, os modelos com erros de observação multiplicativos têm melhor performance, particularmente os modelos Log-skew-normal e Log-skew-t. Considerando estes resultados, no segundo caso utilizamos somente erros multiplicativos e a distribuição a posteriori preditiva mostra que cada variável observável parece ter sua própria família de distribuição de probabilidades. Além disso, os resultados também revelam uma crescente complexidade do modelo ao incorporar a classe mais geral de distribuições assimétricas. We study the logistic population growth model using a state-space approach. The non observable states are the annual biomass of the population with a linear observation equation and a non-linear state equation. The probability distribution used for the additives observation error terms are Normal, Student-t, Skew-normal and Skew-t, and Log-normal, Log-t, Log-skew-normal and Log-skew-t for multiplicative observation errors terms. The inference about the parameters of the models is performed using Bayesian methods, with MCMC algorithms and Laplace approximations. We present two applications to real data sets. The first in marine shrimp population off the coast of Chile, where observable variable is the average annual fishing yield. The second application is for the population of the red squat lobster off Chile, where in addition to the average annual fishing yield, a second observable variable was included. In the first case, the multiplicative observational errors models presented the best results. Particularly the Log-skew-normal and Log-skew-t models has the better performances. Considering these results, in the second application we use only multiplicative observation errors models. 2016-01-20 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/doctoralThesis http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45133/tde-15052016-104959/ por info:eu-repo/semantics/openAccess Universidade de São Paulo Estatística USP BR reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo instacron:USP
collection NDLTD
language Portuguese
sources NDLTD
topic Camarão chileno
MCMC
Modelo de crescimento logístico
Modelos dinâmicos não-lineares
Chilean shrimp
logistic growth model
MCMC
Nonlinear dynamic models
spellingShingle Camarão chileno
MCMC
Modelo de crescimento logístico
Modelos dinâmicos não-lineares
Chilean shrimp
logistic growth model
MCMC
Nonlinear dynamic models
Carlos Patricio Montenegro Silva
Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico
description Neste trabalho de tese, estudamos o modelo de crescimento logístico de populações biológicas utilizando a abordagem de espaço de estados. Os estados não observados são as biomassas anuais, a equação de observação é linear e a equação de estado é não linear. As distribuições de probabilidade utilizadas para os termos de erro de observação aditivos são: Normal, t-student, Skew-normal e Skew-t. As distribuições Log-normal, Log-t, Log-skew-normal e Log-skew-t são consideradas para os erros de observação multiplicativos. A inferência nos modelos é realizada considerando-se métodos Bayesianos e as distribuições a posterior de interesse são aproximadas utilizando-se algoritmos MCMC e a aproximação de Laplace. Apresentamos duas aplicações, a primeira referente a pesca de camarão marinho na costa do Chile, na qual a variável observável é o rendimento médio anual de pesca (captura por unidade de esforço média). Na segunda é considerada a pesca de lagostim vermelho na costa de Chile, na qual além do rendimento médio anual da pesca, observa-se as estimativas anuais de biomassa vulnerável, obtidas através de estudos de área varrida. Para o primeiro conjunto de dados, os modelos com erros de observação multiplicativos têm melhor performance, particularmente os modelos Log-skew-normal e Log-skew-t. Considerando estes resultados, no segundo caso utilizamos somente erros multiplicativos e a distribuição a posteriori preditiva mostra que cada variável observável parece ter sua própria família de distribuição de probabilidades. Além disso, os resultados também revelam uma crescente complexidade do modelo ao incorporar a classe mais geral de distribuições assimétricas. === We study the logistic population growth model using a state-space approach. The non observable states are the annual biomass of the population with a linear observation equation and a non-linear state equation. The probability distribution used for the additives observation error terms are Normal, Student-t, Skew-normal and Skew-t, and Log-normal, Log-t, Log-skew-normal and Log-skew-t for multiplicative observation errors terms. The inference about the parameters of the models is performed using Bayesian methods, with MCMC algorithms and Laplace approximations. We present two applications to real data sets. The first in marine shrimp population off the coast of Chile, where observable variable is the average annual fishing yield. The second application is for the population of the red squat lobster off Chile, where in addition to the average annual fishing yield, a second observable variable was included. In the first case, the multiplicative observational errors models presented the best results. Particularly the Log-skew-normal and Log-skew-t models has the better performances. Considering these results, in the second application we use only multiplicative observation errors models.
author2 Marcia D Elia Branco
author_facet Marcia D Elia Branco
Carlos Patricio Montenegro Silva
author Carlos Patricio Montenegro Silva
author_sort Carlos Patricio Montenegro Silva
title Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico
title_short Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico
title_full Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico
title_fullStr Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico
title_full_unstemmed Inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico
title_sort inferência bayesiana em modelos de dinâmica de populações biológicas com termo de perturbação assimétrico
publisher Universidade de São Paulo
publishDate 2016
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45133/tde-15052016-104959/
work_keys_str_mv AT carlospatriciomontenegrosilva inferenciabayesianaemmodelosdedinamicadepopulacoesbiologicascomtermodeperturbacaoassimetrico
AT carlospatriciomontenegrosilva bayesianinferenceinbiologicalpopulationdynamicmodelswithskewedandheavytailedperturbationterms
_version_ 1718906500434362368