Desenvolvimento de uma estratégia de clonagem customizada de regiões promotoras do genoma da cana-de-açúcar.

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia para identificação de regiões promotoras funcionais a partir de segmentos de um genoma qualquer. O genoma da cana-de-açúcar foi escolhido para o desenvolvimento desta estratégia na qual envolve a obtenção de fragmentos de DNA os quais for...

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Bibliographic Details
Main Author: Mayra Akemi Kuroki
Other Authors: Marie Anne van Sluys
Language:Portuguese
Published: Universidade de São Paulo 2012
Subjects:
Online Access:http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-05022013-082130/
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spelling ndltd-IBICT-oai-teses.usp.br-tde-05022013-0821302019-01-21T21:52:14Z Desenvolvimento de uma estratégia de clonagem customizada de regiões promotoras do genoma da cana-de-açúcar. Customized promoter cloning strategy. Mayra Akemi Kuroki Marie Anne van Sluys Carlos Takeshi Hotta Gabriel Padilla Maldonado Cana-de-açúcar Clonagem Genomas Monocotiledôneas Protoplastos Cloning Genomes Monocotyledonous Protoplasts Sugarcane O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia para identificação de regiões promotoras funcionais a partir de segmentos de um genoma qualquer. O genoma da cana-de-açúcar foi escolhido para o desenvolvimento desta estratégia na qual envolve a obtenção de fragmentos de DNA os quais foram clonados em vetores de expressão. A triagem destes fragmentos foi realizada através de biobalística e resultou no isolamento de quatro clones. Um ensaio de transformação permanente em arroz com três clones gerou 12 plantas. Foi detectada expressão do marcador GUS em calos, folhas e raízes, comprovando sua funcionalidade. Desta maneira, o presente trabalho permitiu estabelecer uma metodologia de recuperação de sequências regulatórias funcionais com ampla possibilidade de serem explorados biotecnologicamente. The aim of this work is develop a strategy to identify functional promoter regions from any genome. The modern sugarcane genome was chosen as a model for the development of this strategy that involves the generation of fragments of DNA and cloning them into expression vectors. These fragments were then screened by a transient expression assay using biolistic particle delivery resulting in the isolation of four clones. Three clones were permanently transformed in rice, and 12 plants were obtained. GUS expression was detected in the callus, leaves and roots of the rice plants thus confirming the functionality of sequences in these clones. The present work has established a strategy to identify and extract functional regulatory sequences containing functional regulatory regions which show great potential of being useful in both the biotechnology field and in the field of basic science. 2012-11-27 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-05022013-082130/ por info:eu-repo/semantics/openAccess Universidade de São Paulo Biotecnologia USP BR reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo instacron:USP
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Mayra Akemi Kuroki
Desenvolvimento de uma estratégia de clonagem customizada de regiões promotoras do genoma da cana-de-açúcar.
description O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia para identificação de regiões promotoras funcionais a partir de segmentos de um genoma qualquer. O genoma da cana-de-açúcar foi escolhido para o desenvolvimento desta estratégia na qual envolve a obtenção de fragmentos de DNA os quais foram clonados em vetores de expressão. A triagem destes fragmentos foi realizada através de biobalística e resultou no isolamento de quatro clones. Um ensaio de transformação permanente em arroz com três clones gerou 12 plantas. Foi detectada expressão do marcador GUS em calos, folhas e raízes, comprovando sua funcionalidade. Desta maneira, o presente trabalho permitiu estabelecer uma metodologia de recuperação de sequências regulatórias funcionais com ampla possibilidade de serem explorados biotecnologicamente. === The aim of this work is develop a strategy to identify functional promoter regions from any genome. The modern sugarcane genome was chosen as a model for the development of this strategy that involves the generation of fragments of DNA and cloning them into expression vectors. These fragments were then screened by a transient expression assay using biolistic particle delivery resulting in the isolation of four clones. Three clones were permanently transformed in rice, and 12 plants were obtained. GUS expression was detected in the callus, leaves and roots of the rice plants thus confirming the functionality of sequences in these clones. The present work has established a strategy to identify and extract functional regulatory sequences containing functional regulatory regions which show great potential of being useful in both the biotechnology field and in the field of basic science.
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