Mapeando a superfície do nucleossomo com finalidade terapêutica

• Main Author: Teles, Kaian Amorim
• Other Authors: Santos, Guilherme Martins
• Language: Portuguese
• Published: 2017
• Subjects: Nucleossomo; Fisiologia celular; Cromatina
• Online Access: http://repositorio.unb.br/handle/10482/24332

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2017. === Submitted by Albânia Cézar de Melo ([e-mail]) on 2017-07-13T16:07:40Z No. of bitstreams: 1 2017_KaianAmorimTeles.pdf: 9165310 bytes, checksum: 0f2627fbc50890dca9c01374109f19e7 (MD5) === Approved for entry into archive by Raquel Viana ([e-mail]) on 2017-08-28T20:52:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_KaianAmorimTeles.pdf: 9165310 bytes, checksum: 0f2627fbc50890dca9c01374109f19e7 (MD5) === Made available in DSpace on 2017-08-28T20:52:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_KaianAmorimTeles.pdf: 9165310 bytes, checksum: 0f2627fbc50890dca9c01374109f19e7 (MD5) Previous issue date: 2017-08-28 === A cromatina é uma estrutura fundamental para a fisiologia celular e pode ser regulada através de uma variedade de pequenas moléculas e proteínas que, em sua maioria, atuam em nível nucleossomal. A competição entre diferentes Proteínas Ligantes de Nucleossomo (NBPs) ajudam a definir o estado final da cromatina. Embora toda a superfície do nucleossomo seja alvo de diferentes NBPs, uma região conhecida como patch acídico é o alvo preferêncial dessas moléculas. A fim de compreender como o impacto que NBPs tem sob o nucleossomo o ensaio de thermal shift foi feito para desvendar como diferentes NBPs afetam a estabilidade desse complexo. Foram utilizadas peptídeos baseados nas NBPs identificadas que se ligam aos nucleossomos conhecidos como Nucleosome Biding Molecules (NBMs). Foi observado que diferentes sítios de ligação que NBMs fazem com o patch acídico induzem diferentes desfechos na desnaturação do nucleossomo. Assim, foi possível criar um mapa das regiões vitais da superfície do nucleossomo responsável pela estabilidade do complexo utilizando os dados estruturais (PDB) do nucleossomo:NBPs, que futuramente pode será utilizado para o desenho racional de fármacos. === The chromatin is a fundamental structure for the cell physiology. It can be regulated trough a variety of small molecules and proteins, most of which acting at a nucleosomal level. The competition among Nucleosome Binding Proteins (NBPs) binding help to define the final chromatin architecture. Although the entire nucleosome surface has been explored by several NBPs, a region known as the acidic patch is at the preferable target. In order to understand how the NBPs impact the nucleosome, thermal shift assay was conducted to understand how different NBPs influence over the stability fo the complex. We used peptides based on the structure of NBPs known as Nucleosome Biding Molecules (NBMs). We were able to identify biding sites that NBMs interact with the acidic patch and induce several denaturation outcomes of the nucleosome. Herein it was possible to create a map of the vital regions of the surface of the nucleosome responsable for the stability of the complex, using structural data (PDB) of the nucleosome:NBPs, that in the future can be used in rational drug design.