Estudos citogenéticos em espécies da família Paradontidae (Actinopterygii: Characiformes), com enfoque no papel dos DNAs repetitivos na evolução cariotípica do grupo
Submitted by Aelson Maciera (aelsoncm@terra.com.br) on 2017-04-07T19:01:49Z No. of bitstreams: 1 TeseKZ.pdf: 6268573 bytes, checksum: 3d50abb73f159705b9efa45eb5cc20cf (MD5) === Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-04-19T17:57:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 T...
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Universidade Federal de São Carlos
2017
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Cromossomos sexuais Hibridação in situ fluorescente Evolução cariotípica DNAs repetitivos Sex chromosomes Fluorescence in situ hybridization Karyotype evolution Repetitive DNAs CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
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Cromossomos sexuais Hibridação in situ fluorescente Evolução cariotípica DNAs repetitivos Sex chromosomes Fluorescence in situ hybridization Karyotype evolution Repetitive DNAs CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA Ziemniczak, Kaline Estudos citogenéticos em espécies da família Paradontidae (Actinopterygii: Characiformes), com enfoque no papel dos DNAs repetitivos na evolução cariotípica do grupo |
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Previous issue date: 2016-07-01 === Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) === Parodontidae is organized in three genera according to their morphological
characteristics: Parodon, Saccodon and Apareiodon. The diploid number is conserved
in this group with 2n=54 chromosomes, with species without heteromorphic sex
chromosomes systems and other with sex chromosomes system, with female
heterogamety, ZZ/ZW or ZZ/ZW1W2. Studies of chromosome localization using
repetitive DNAs chromosomes of species show possible origin, differentiation and
evolution of sex chromosomes in Parodontidae. However, further studies using repeats
DNAs are fundamental for a better comprehension of its pathway genomic structural or
functional. In this study were described the chromosome location of the (GATA)n and
(TTAGGG)n sequences in eight species of Parodontidae, with aim to evaluate the
probable mechanisms of chromosomal diversification, especially those related to
molecular differentiation of W chromosome. Also were mapped 16 microsatellites
sequences in five species of the family to check the accumulation of the repetitive
DNAs in the chromosomes and verify its performance in the karyotype and sex
chromosomes differentiation. Yet, partial sequences of the histone H1, H3 and H4 were
determined and had chromosomal localization in six species of Parodontidae. The data
show two H1 sequences in Parodontidae genomes, herein called H1 partial and H1+
ERV, in addition to partial sequences for the genes H3 and H4. The chromosomal
localization of histone genes show H1, H3 and H4 in main cluster and the presence of
the orphans genes for H1 + ERV. Hence, this study provide some advances in the
understanding of the repetitive DNA mechanism in the karyotypic differentiation and
evolution in the family Parodontidae. === Parodontidae é organizada em três gêneros agrupados de acordo com suas
características morfológicas: Parodon, Saccodon e Apareiodon. O número diploide é
conservado nesse grupo com 2n=54 cromossomos, com espécies sem sistemas de
cromossomos sexuais heteromórficos e outras com sistemas de cromossomos sexuais do
tipo ZZ/ZW ou ZZ/ZW1W2. Estudos com mapeamento de DNAs repetitivos por
hibridação in situ fluorescente nos cromossomos de algumas espécies demonstraram
possível origem, diferenciação e evolução dos sistemas de cromossomos sexuais desta
família. No entanto, estudos mais aprofundados são fundamentais para um maior
esclarecimento do papel genômico das sequências repetitivas. Neste estudo foram
descritas a localização das sequências (GATA)n e (TTAGGG)n em oito espécies de
Parodontidae, com o objetivo de avaliar os prováveis mecanismos de diversificação
cromossômica, especialmente aqueles relacionados à diferenciação molecular do
cromossomo W. Também foram mapeadas 16 sequências de microssatélites em cinco
espécies da família, com objetivo de verificar o acúmulo de DNA repetitivo nos
cromossomos e sua atuação na diferenciação cariotípica dos cromossomos sexuais
heteromórficos. Por fim, sequências parciais das histonas H1, H3 e H4 e também dos
DNAr 5S e 18S foram determinadas e tiveram sua localização cromossômica em seis
espécies desta família. Com os resultados, foi possível determinar duas sequências de
H1 para Parodontidae, H1 parcial e H1+ERV, além das sequências parciais para os
genes H3 e H4. Todas essas análises propiciam uma melhor compreensão dos processos
de diferenciação e evolução cariotípica na família Parodontidae. |
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Moreira Filho, Orlando |
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Moreira Filho, Orlando Ziemniczak, Kaline |
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ndltd-IBICT-oai-repositorio.ufscar.br-ufscar-86362018-05-23T20:12:41Z Estudos citogenéticos em espécies da família Paradontidae (Actinopterygii: Characiformes), com enfoque no papel dos DNAs repetitivos na evolução cariotípica do grupo Ziemniczak, Kaline Moreira Filho, Orlando Vicari, Marcelo Ricardo Cromossomos sexuais Hibridação in situ fluorescente Evolução cariotípica DNAs repetitivos Sex chromosomes Fluorescence in situ hybridization Karyotype evolution Repetitive DNAs CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA Submitted by Aelson Maciera (aelsoncm@terra.com.br) on 2017-04-07T19:01:49Z No. of bitstreams: 1 TeseKZ.pdf: 6268573 bytes, checksum: 3d50abb73f159705b9efa45eb5cc20cf (MD5) Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-04-19T17:57:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseKZ.pdf: 6268573 bytes, checksum: 3d50abb73f159705b9efa45eb5cc20cf (MD5) Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-04-19T17:57:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseKZ.pdf: 6268573 bytes, checksum: 3d50abb73f159705b9efa45eb5cc20cf (MD5) Made available in DSpace on 2017-04-19T18:05:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseKZ.pdf: 6268573 bytes, checksum: 3d50abb73f159705b9efa45eb5cc20cf (MD5) Previous issue date: 2016-07-01 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Parodontidae is organized in three genera according to their morphological characteristics: Parodon, Saccodon and Apareiodon. The diploid number is conserved in this group with 2n=54 chromosomes, with species without heteromorphic sex chromosomes systems and other with sex chromosomes system, with female heterogamety, ZZ/ZW or ZZ/ZW1W2. Studies of chromosome localization using repetitive DNAs chromosomes of species show possible origin, differentiation and evolution of sex chromosomes in Parodontidae. However, further studies using repeats DNAs are fundamental for a better comprehension of its pathway genomic structural or functional. In this study were described the chromosome location of the (GATA)n and (TTAGGG)n sequences in eight species of Parodontidae, with aim to evaluate the probable mechanisms of chromosomal diversification, especially those related to molecular differentiation of W chromosome. Also were mapped 16 microsatellites sequences in five species of the family to check the accumulation of the repetitive DNAs in the chromosomes and verify its performance in the karyotype and sex chromosomes differentiation. Yet, partial sequences of the histone H1, H3 and H4 were determined and had chromosomal localization in six species of Parodontidae. The data show two H1 sequences in Parodontidae genomes, herein called H1 partial and H1+ ERV, in addition to partial sequences for the genes H3 and H4. The chromosomal localization of histone genes show H1, H3 and H4 in main cluster and the presence of the orphans genes for H1 + ERV. Hence, this study provide some advances in the understanding of the repetitive DNA mechanism in the karyotypic differentiation and evolution in the family Parodontidae. Parodontidae é organizada em três gêneros agrupados de acordo com suas características morfológicas: Parodon, Saccodon e Apareiodon. O número diploide é conservado nesse grupo com 2n=54 cromossomos, com espécies sem sistemas de cromossomos sexuais heteromórficos e outras com sistemas de cromossomos sexuais do tipo ZZ/ZW ou ZZ/ZW1W2. Estudos com mapeamento de DNAs repetitivos por hibridação in situ fluorescente nos cromossomos de algumas espécies demonstraram possível origem, diferenciação e evolução dos sistemas de cromossomos sexuais desta família. No entanto, estudos mais aprofundados são fundamentais para um maior esclarecimento do papel genômico das sequências repetitivas. Neste estudo foram descritas a localização das sequências (GATA)n e (TTAGGG)n em oito espécies de Parodontidae, com o objetivo de avaliar os prováveis mecanismos de diversificação cromossômica, especialmente aqueles relacionados à diferenciação molecular do cromossomo W. Também foram mapeadas 16 sequências de microssatélites em cinco espécies da família, com objetivo de verificar o acúmulo de DNA repetitivo nos cromossomos e sua atuação na diferenciação cariotípica dos cromossomos sexuais heteromórficos. Por fim, sequências parciais das histonas H1, H3 e H4 e também dos DNAr 5S e 18S foram determinadas e tiveram sua localização cromossômica em seis espécies desta família. Com os resultados, foi possível determinar duas sequências de H1 para Parodontidae, H1 parcial e H1+ERV, além das sequências parciais para os genes H3 e H4. Todas essas análises propiciam uma melhor compreensão dos processos de diferenciação e evolução cariotípica na família Parodontidae. 2017-04-19T18:05:13Z 2017-04-19T18:05:13Z 2016-07-01 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/doctoralThesis https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/8636 por info:eu-repo/semantics/openAccess Universidade Federal de São Carlos Câmpus São Carlos Programa de Pós-graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular UFSCar reponame:Repositório Institucional da UFSCAR instname:Universidade Federal de São Carlos instacron:UFSCAR |