Contribuição à análise e classificação citogenética baseada no processamento digital de imagens e no enfoque lógico-combinatório

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica === Made available in DSpace on 2012-10-20T17:50:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 202092.pdf: 3182704 bytes, checksum: 4b7b7b04c090e8aeee3a18e534c04976 (MD5) === Este trabal...

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Bibliographic Details
Main Author: Pantaleão, Carlos Henrique Zanelato
Other Authors: Universidade Federal de Santa Catarina
Format: Others
Language:Portuguese
Published: Florianópolis, SC 2012
Subjects:
Online Access:http://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/85353
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spelling ndltd-IBICT-oai-repositorio.ufsc.br-123456789-853532019-01-21T16:03:22Z Contribuição à análise e classificação citogenética baseada no processamento digital de imagens e no enfoque lógico-combinatório Pantaleão, Carlos Henrique Zanelato Universidade Federal de Santa Catarina Marques, Jefferson Luiz Brum Azevedo, Fernando Mendes de Engenharia eletrica Sistemas de informação Citogenetica humana Processamento de imagens - Tecnicas digitais Cromossomos Analise Leucemia aguda Diagnostico Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica Made available in DSpace on 2012-10-20T17:50:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 202092.pdf: 3182704 bytes, checksum: 4b7b7b04c090e8aeee3a18e534c04976 (MD5) Este trabalho apresenta a elaboração de um Sistema Computadorizado para Análise e Classificação Citogenética, que constitui uma nova metodologia para reduzir o viés da análise citogenética clínica. Tal sistema foi implementado visando dois objetivos específicos: o reconhecimento automático dos cromossomos através de uma única cena e a análise da leucemia pró-mielocítica aguda. Para alcançar o primeiro objetivo, aplicou-se técnicas de processamento digital de imagens, visando extrair as características de área, fator de forma, distância Euclidiana e correlação linear de Pearson, com mais precisão. Através destas características, foi possível a identificação automática dos cromossomos homólogos, atingindo 63,04% de índice de acerto quando utilizadas imagens de 276 cromossomos, as quais foram obtidas de diferentes laboratórios. Para atingir o segundo propósito, foi desenvolvido um novo método de prolongamento das extremidades do eixo médio extraído dos cromossomos, baseando-se na técnica de extrapolação pelos mínimos quadrados. Desta forma, foi possível detectar a translocação t(15,17) que caracteriza a leucemia e, para apresentar o grau de analogia com a doença, utilizou-se o enfoque lógico-combinatório. Os resultados demonstraram um bom desempenho do sistema, obtendo índices entre 63,73 a 99,70% de semelhança com o rearranjo cromossômico, quando utilizadas imagens de células leucêmicas e valores abaixo de 17,30% com o uso de imagens de células normais. Logo, através deste estudo, foi possível comprovar que é possível o reconhecimento automático dos cromossomos através de uma única cena e obter uma ferramenta que permite detectar com maior precisão o rearranjo característico da leucemia pró-mielocítica aguda, oferecendo ao citogeneticista condições para a detecção do rearranjo cromossômico com maior eficiência e confiabilidade. 2012-10-20T17:50:05Z 2012-10-20T17:50:05Z 2003 2003 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/doctoralThesis http://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/85353 202092 por info:eu-repo/semantics/openAccess xiii, 149 f.| il., grafs., tabs. Florianópolis, SC reponame:Repositório Institucional da UFSC instname:Universidade Federal de Santa Catarina instacron:UFSC
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Pantaleão, Carlos Henrique Zanelato
Contribuição à análise e classificação citogenética baseada no processamento digital de imagens e no enfoque lógico-combinatório
description Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica === Made available in DSpace on 2012-10-20T17:50:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 202092.pdf: 3182704 bytes, checksum: 4b7b7b04c090e8aeee3a18e534c04976 (MD5) === Este trabalho apresenta a elaboração de um Sistema Computadorizado para Análise e Classificação Citogenética, que constitui uma nova metodologia para reduzir o viés da análise citogenética clínica. Tal sistema foi implementado visando dois objetivos específicos: o reconhecimento automático dos cromossomos através de uma única cena e a análise da leucemia pró-mielocítica aguda. Para alcançar o primeiro objetivo, aplicou-se técnicas de processamento digital de imagens, visando extrair as características de área, fator de forma, distância Euclidiana e correlação linear de Pearson, com mais precisão. Através destas características, foi possível a identificação automática dos cromossomos homólogos, atingindo 63,04% de índice de acerto quando utilizadas imagens de 276 cromossomos, as quais foram obtidas de diferentes laboratórios. Para atingir o segundo propósito, foi desenvolvido um novo método de prolongamento das extremidades do eixo médio extraído dos cromossomos, baseando-se na técnica de extrapolação pelos mínimos quadrados. Desta forma, foi possível detectar a translocação t(15,17) que caracteriza a leucemia e, para apresentar o grau de analogia com a doença, utilizou-se o enfoque lógico-combinatório. Os resultados demonstraram um bom desempenho do sistema, obtendo índices entre 63,73 a 99,70% de semelhança com o rearranjo cromossômico, quando utilizadas imagens de células leucêmicas e valores abaixo de 17,30% com o uso de imagens de células normais. Logo, através deste estudo, foi possível comprovar que é possível o reconhecimento automático dos cromossomos através de uma única cena e obter uma ferramenta que permite detectar com maior precisão o rearranjo característico da leucemia pró-mielocítica aguda, oferecendo ao citogeneticista condições para a detecção do rearranjo cromossômico com maior eficiência e confiabilidade.
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Pantaleão, Carlos Henrique Zanelato
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