Desenvolvimento de métodos para otimização e parametrização de campos de força interatômicos
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Física, Florianópolis, 2016 === Made available in DSpace on 2016-09-20T05:02:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 340392.pdf: 5395539 bytes, checksum: 6b3d0f3f6484c0fddf...
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ndltd-IBICT-oai-repositorio.ufsc.br-123456789-1682042019-01-21T16:35:45Z Desenvolvimento de métodos para otimização e parametrização de campos de força interatômicos Prado, Luciano Rostirolla Universidade Federal de Santa Catarina Rego, Luis Guilherme de Carvalho Física Força (Mecânica) Estrutura molecular Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Física, Florianópolis, 2016 Made available in DSpace on 2016-09-20T05:02:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 340392.pdf: 5395539 bytes, checksum: 6b3d0f3f6484c0fddf22ac745a1c02a4 (MD5) Previous issue date: 2016 Neste trabalho desenvolvemos um método teórico/computacional e-ciente que pode ser usado para otimizar e parametrizar campos de forcas interatômicos, que são empregados na descrição da dinâmica de núcleos. Neste método a análise dos modos normais de vibração e usada como critério para a otimização, alem de critérios usuais como geometrias de equilíbrio e simetrias. Para isso, construímos uma função custo quadrática, que consiste das frequências normais multiplicadas por fatores de peso intrinsecamente ligados aos campos de forca. No ponto de mínimo, a função custo fornece os parâmetros ótimos na aproximação harmônica. O método do Gradiente Conjugado e empregado para a minimização. A qualidade dos resultados e definida pelo desvio quadrático médio da função custo. O método e testado em protótipos de sistemas moleculares, tais como as moléculas de benzeno, amônia, tiofeno e perileno.<br> Abstract: In this work we developed the theory of a computationally ecient method that can be used for optimizing the interatomic force elds that are used in molecular dynamics simulations. In this method, the vibrational normal modes are utilized in the optimization procedure, together with the geometry and simmetry of the molecular systems in their electronic ground state. A quadratic cost function is defined in terms of the weighted normal mode frequencies. The cost function is minimized by the Conjugated Gradient method. The quality of the optimization is valued by the standard deviation of the cost function. The method is applied and tested with prototypical molecular systems, such as the benzene, ammonia, tiophene and perylene molecules. 2016-09-20T05:02:45Z 2016-09-20T05:02:45Z 2016 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis https://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/168204 340392 por info:eu-repo/semantics/openAccess 116 p.| il., grafs., tabs. reponame:Repositório Institucional da UFSC instname:Universidade Federal de Santa Catarina instacron:UFSC |
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Previous issue date: 2016 === Neste trabalho desenvolvemos um método teórico/computacional e-ciente que pode ser usado para otimizar e parametrizar campos de forcas interatômicos, que são empregados na descrição da dinâmica de núcleos. Neste método a análise dos modos normais de vibração e usada como critério para a otimização, alem de critérios usuais como geometrias de equilíbrio e simetrias. Para isso, construímos uma função custo quadrática, que consiste das frequências normais multiplicadas por fatores de peso intrinsecamente ligados aos campos de forca. No ponto de mínimo, a função custo fornece os parâmetros ótimos na aproximação harmônica. O método do Gradiente Conjugado e empregado para a minimização. A qualidade dos resultados e definida pelo desvio quadrático médio da função custo. O método e testado em protótipos de sistemas moleculares, tais como as moléculas de benzeno, amônia, tiofeno e perileno.<br> === Abstract: In this work we developed the theory of a computationally ecient method that can be used for optimizing the interatomic force elds that are used in molecular dynamics simulations. In this method, the vibrational normal modes are utilized in the optimization procedure, together with the geometry and simmetry of the molecular systems in their electronic ground state. A quadratic cost function is defined in terms of the weighted normal mode frequencies. The cost function is minimized by the Conjugated Gradient method. The quality of the optimization is valued by the standard deviation of the cost function. The method is applied and tested with prototypical molecular systems, such as the benzene, ammonia, tiophene and perylene molecules. |
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