Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6196_1.pdf: 2969003 bytes, checksum: 8f50bcbdb2b65d6db740defdd69758a0 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 === Estresses abióticos são os princip...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | |
Language: | Portuguese |
Published: |
Universidade Federal de Pernambuco
2014
|
Subjects: | |
Online Access: | https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/6358 |
id |
ndltd-IBICT-oai-repositorio.ufpe.br-123456789-6358 |
---|---|
record_format |
oai_dc |
spelling |
ndltd-IBICT-oai-repositorio.ufpe.br-123456789-63582019-01-21T19:08:42Z Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz da Mota Soares Cavalcanti, Nina Maria Benko Iseppon, Ana Fatores de transcrição Estresses abióticos Eucalyptus Saccharum officinarum Oryza sativa Bioinformática Made available in DSpace on 2014-06-12T18:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6196_1.pdf: 2969003 bytes, checksum: 8f50bcbdb2b65d6db740defdd69758a0 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 Estresses abióticos são os principais responsáveis por provocar alterações no crescimento e desenvolvimento vegetal. As plantas, em contrapartida, lançam mão de uma variedade de respostas a fim de manter seus processos metabólicos e fisiológicos. Uma das principais respostas das plantas às alterações das condições ambientais é a regulação adicional da expressão. Além desta, são de grande importância a síntese de osmoprotetores, transportadores iônicos, chaperonas, proteínas de choque térmico, aquaporinas, proteínas LEA, entre outras. Este trabalho buscou identificar genes que codificam fatores de transcrição (DREB, ERF, MYB, bHLH, bZIP, HSF, WRKY, NAC, ZincFinger e Homeodomínio) em eucalipto, cana-de-açúcar e arroz através de ferramentas in silico. Os resultados obtidos revelaram a presença de fatores de transcrição em todos os genomas estudados, revelando a importância dos mesmos nas respostas aos estresses abióticos. De uma forma geral, as proteínas pertencentes à uma mesma família mostraram características (ponto isoelétrico e massa molecular) bastante similares, indicando o alto grau de conservação das mesmas. Os dendrogramas gerados refletiram uma relação muito mais adaptativa do que filogenética entre os organismos. Além disso, também a estrutura gênica parece ser conservada em eucalipto e cana, como observado nas análises comparativas entre as ORFs destas culturas e as de seqüências genômicas de Arabidopsis e Oryza sativa. O padrão de expressão encontrado reflete o envolvimento destes fatores tanto no estresse biótico, quanto no estresse abiótico, com grande número de transcritos em tecidos infectados por bactérias, caule, raiz e região de transição raiz-caule. Em suma, os resultados apontam para a conservação dos principais mecanismos de controle da transcrição envolvidos na resistência/tolerância aos estresses, como a seca, salinidade e congelamento, em eucalipto, cana e arroz. No entanto, estudos adicionais, in vivo e in vitro, darão maiores subsídios para o melhor esclarecimento da funcionalidade destas proteínas e das vias em que participam estes genes 2014-06-12T18:04:27Z 2014-06-12T18:04:27Z 2007 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis da Mota Soares Cavalcanti, Nina; Maria Benko Iseppon, Ana. Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz. 2007. Dissertação (Mestrado). Programa de Pós-Graduação em Genética, Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2007. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/6358 por info:eu-repo/semantics/openAccess Universidade Federal de Pernambuco reponame:Repositório Institucional da UFPE instname:Universidade Federal de Pernambuco instacron:UFPE |
collection |
NDLTD |
language |
Portuguese |
sources |
NDLTD |
topic |
Fatores de transcrição Estresses abióticos Eucalyptus Saccharum officinarum Oryza sativa Bioinformática |
spellingShingle |
Fatores de transcrição Estresses abióticos Eucalyptus Saccharum officinarum Oryza sativa Bioinformática da Mota Soares Cavalcanti, Nina Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz |
description |
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2
arquivo6196_1.pdf: 2969003 bytes, checksum: 8f50bcbdb2b65d6db740defdd69758a0 (MD5)
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
Previous issue date: 2007 === Estresses abióticos são os principais responsáveis por provocar alterações no crescimento e desenvolvimento
vegetal. As plantas, em contrapartida, lançam mão de uma variedade de respostas a fim de manter seus processos
metabólicos e fisiológicos. Uma das principais respostas das plantas às alterações das condições ambientais é a
regulação adicional da expressão. Além desta, são de grande importância a síntese de osmoprotetores,
transportadores iônicos, chaperonas, proteínas de choque térmico, aquaporinas, proteínas LEA, entre outras. Este
trabalho buscou identificar genes que codificam fatores de transcrição (DREB, ERF, MYB, bHLH, bZIP, HSF,
WRKY, NAC, ZincFinger e Homeodomínio) em eucalipto, cana-de-açúcar e arroz através de ferramentas in
silico. Os resultados obtidos revelaram a presença de fatores de transcrição em todos os genomas estudados,
revelando a importância dos mesmos nas respostas aos estresses abióticos. De uma forma geral, as proteínas
pertencentes à uma mesma família mostraram características (ponto isoelétrico e massa molecular) bastante
similares, indicando o alto grau de conservação das mesmas. Os dendrogramas gerados refletiram uma relação
muito mais adaptativa do que filogenética entre os organismos. Além disso, também a estrutura gênica parece ser
conservada em eucalipto e cana, como observado nas análises comparativas entre as ORFs destas culturas e as de
seqüências genômicas de Arabidopsis e Oryza sativa. O padrão de expressão encontrado reflete o envolvimento
destes fatores tanto no estresse biótico, quanto no estresse abiótico, com grande número de transcritos em tecidos
infectados por bactérias, caule, raiz e região de transição raiz-caule. Em suma, os resultados apontam para a
conservação dos principais mecanismos de controle da transcrição envolvidos na resistência/tolerância aos
estresses, como a seca, salinidade e congelamento, em eucalipto, cana e arroz. No entanto, estudos adicionais, in
vivo e in vitro, darão maiores subsídios para o melhor esclarecimento da funcionalidade destas proteínas e das
vias em que participam estes genes |
author2 |
Maria Benko Iseppon, Ana |
author_facet |
Maria Benko Iseppon, Ana da Mota Soares Cavalcanti, Nina |
author |
da Mota Soares Cavalcanti, Nina |
author_sort |
da Mota Soares Cavalcanti, Nina |
title |
Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz |
title_short |
Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz |
title_full |
Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz |
title_fullStr |
Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz |
title_full_unstemmed |
Estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz |
title_sort |
estudo in silico de genes que codificam fatores de transcrição responsivos à seca, salinidade e congelamento nos genomas do eucalipto, cana e arroz |
publisher |
Universidade Federal de Pernambuco |
publishDate |
2014 |
url |
https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/6358 |
work_keys_str_mv |
AT damotasoarescavalcantinina estudoinsilicodegenesquecodificamfatoresdetranscricaoresponsivosasecasalinidadeecongelamentonosgenomasdoeucaliptocanaearroz |
_version_ |
1718861241006424064 |