Filogeografia em áreas abertas da América do Sul: origem e diversificação de linhagens de Scinax squalirostris (Anura, Hylidae)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-09-01T15:17:42Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Rafael Félix de Magalhâes - 2012.pdf: 3887052 bytes, checksum: afebf6bf3e40c0419c12be6f417f8336 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) === Approved for...
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2016
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Período terciário Período quaternário Campos Pampas e chaco Period tertiary Period quaternary Grassland Pampas and chaco CIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIA Magalhães, Rafael Félix de Filogeografia em áreas abertas da América do Sul: origem e diversificação de linhagens de Scinax squalirostris (Anura, Hylidae) |
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Previous issue date: 2012-04-27 === Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq === (Phylogeography of Scinax squalirostris). In this work we used 175 individuals of
Scinax squalirostris from 26 localities in the Brazilian states of Minas Gerais, São
Paulo, Goiás, Mato Grosso do Sul, Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Parana, and
Distrito Federal, as well as individuals from Paraguay, Uruguay and Argentina. Three
mitochondrial (cytb, 12S and CO1) and one nuclear (RAG-1) gene fragments were
sequenced. The determination of the phylogenetic structured populations and the
relationships among them were made under phylogenetic analyses based on Bayesian
statistical methods. The most parsimonious relationship among haplotypes was made
under the method of median-joining network. The delineation of the hypothetical
operational taxonomic units was made under DNA mini-barcoding procedures,
combined with genetic and phylogenetic evidence. In addition, we performed
population structure tests of, gene flow and changes in population sizes. Finally, times
of divergence among genealogical lineages were estimated by relaxed molecular clock
procedures. Considering the phylogenetic species concept, there are two possible
scenarios for the taxonomic lineages of the cryptic complex named Scinax squalirostris.
In the first scenario, there are two possible species: one with tropical and other with
subtropical/temperate distributions, respectively. The second scenario points to the
existence of at least nine species: one in the Pampas, one in the Chaco and the
remaining seven isolated in 'sky-islands' from the Cerrado and Atlantic Forest domains.
The first cladogenetic event of the lineages dates from the Upper Miocene,
approximately 7.5 million years ago. This may have occurred by the last contraction of
Paranaense Sea. During this period, new suitable areas for S. squalirostris emerged,
leading to the clades belonging to tropical and subtropical/temperate zones
diversification, and it would be consistent with the first taxonomic scenario. The
XI
diversification within these two major clades occurred in the transition between the late
Tertiary and early Quaternary. The current distribution of S. squalirostris in the tropical
zone probably should be linked to climatic and geological changes that occurred in the
transition between the Pliocene and Pleistocene. During the Quaternary glaciations, the
grasslands have undergone expansion (periods during glaciations) and retraction (during
interglacials). When the temperature and moisture increased in the Late Holocene,
occurred retraction of the grasslands in favor to the expansion of forests and tree/shrub
savannas. Thus, the suitable habitats to S. squalirostris were restricted to the grasslands
at altitudes greater than 800m in the tropics. The cycles of grasslands isolation on
islands must have influenced the recent diversification of the local clades of S.
squalirostris. === (Filogeografia de Scinax squalirostris). No presente trabalho, foram utilizados 175
indivíduos de Scinax squalirostris provenientes de 26 localidades dos estados de Minas
Gerais, São Paulo, Goiás, Mato Grosso do Sul, Santa Catarina, Rio Grande do Sul,
Paraná e do Distrito Federal no Brasil, além de indivíduos do Paraguai, Uruguai e
Argentina. Foram sequenciados três fragmentos gênicos mitocondriais (cytb, 12S e
CO1) e um fragmento nuclear (RAG-1). A determinação de populações
filogeneticamente estruturadas e as hipóteses de parentesco entre elas foram conduzidas
com análises filogenéticas baseadas no método de estatística bayesiana. A relação mais
parcimoniosa entre os haplótipos foi obtida com o método de „median-joining network‟.
A delimitação de prováveis unidades taxonômicas operacionais foi feita a partir do
„DNA mini-barcoding‟, aliado às evidências genéticas e filogenéticas. Além disso,
foram realizados testes de estruturação populacional, fluxo gênico e flutuação dos
tamanhos populacionais. Por fim, os tempos de divergência entre as linhagens foram
estimados a partir do método do relógio molecular relaxado. Considerando-se o
conceito filogenético de espécie, existem dois possíveis cenários taxonômicos para as
linhagens crípticas de Scinax squalirostris. No primeiro, existem duas possíveis
espécies: uma de distribuição tropical e outra de distribuição subtropical/temperada. O
segundo cenário aponta para a existência de ao menos nove espécies: uma nos Pampas,
outra no Chaco e as demais isoladas em „sky-islands‟ no Cerrado e na Mata Atlântica. O
primeiro evento cladogenético das linhagens data do Mioceno Superior, há
aproximadamente 7.5 milhões de anos, possivelmente em detrimento da última retração
do Mar Paranaense. Neste período, surgiram novas áreas adequadas à S. squalirostris,
originando o clado tropical e o subtropical/temperado, compatíveis com o primeiro
cenário taxonômico. A diversificação dentro destes dois grandes clados provavelmente
IX
ocorreu no final do Terciário e no início do Quaternário. A atual distribuição de S.
squalirostris na zona tropical deve estar ligada às mudanças climáticas e geológicas
ocorridas a partir da transição entre o Plioceno e o Pleistoceno. Durante as glaciações do
Quaternário, os campos sofreram expansão (durante os períodos glaciais) e retração
(durante os interglaciais). Com o aumento da temperatura e da umidade no Holoceno
Tardio, houve retração dos campos em favor da expansão das florestas e savanas
arbóreas/arbustivas. Com isso, os hábitats ideais à S. squalirostris ficaram restritos aos
campos em altitudes maiores do que 800m nas regiões tropicais. Os ciclos de
isolamento dos campos em ilhas devem ter influenciado na diversificação local e
recente das linhagens de S. squalirostris. |
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Maciel, Natan Medeiros |
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Maciel, Natan Medeiros Magalhães, Rafael Félix de |
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The most parsimonious relationship among haplotypes was made under the method of median-joining network. The delineation of the hypothetical operational taxonomic units was made under DNA mini-barcoding procedures, combined with genetic and phylogenetic evidence. In addition, we performed population structure tests of, gene flow and changes in population sizes. Finally, times of divergence among genealogical lineages were estimated by relaxed molecular clock procedures. Considering the phylogenetic species concept, there are two possible scenarios for the taxonomic lineages of the cryptic complex named Scinax squalirostris. In the first scenario, there are two possible species: one with tropical and other with subtropical/temperate distributions, respectively. The second scenario points to the existence of at least nine species: one in the Pampas, one in the Chaco and the remaining seven isolated in 'sky-islands' from the Cerrado and Atlantic Forest domains. The first cladogenetic event of the lineages dates from the Upper Miocene, approximately 7.5 million years ago. This may have occurred by the last contraction of Paranaense Sea. During this period, new suitable areas for S. squalirostris emerged, leading to the clades belonging to tropical and subtropical/temperate zones diversification, and it would be consistent with the first taxonomic scenario. The XI diversification within these two major clades occurred in the transition between the late Tertiary and early Quaternary. The current distribution of S. squalirostris in the tropical zone probably should be linked to climatic and geological changes that occurred in the transition between the Pliocene and Pleistocene. During the Quaternary glaciations, the grasslands have undergone expansion (periods during glaciations) and retraction (during interglacials). When the temperature and moisture increased in the Late Holocene, occurred retraction of the grasslands in favor to the expansion of forests and tree/shrub savannas. Thus, the suitable habitats to S. squalirostris were restricted to the grasslands at altitudes greater than 800m in the tropics. The cycles of grasslands isolation on islands must have influenced the recent diversification of the local clades of S. squalirostris. (Filogeografia de Scinax squalirostris). No presente trabalho, foram utilizados 175 indivíduos de Scinax squalirostris provenientes de 26 localidades dos estados de Minas Gerais, São Paulo, Goiás, Mato Grosso do Sul, Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Paraná e do Distrito Federal no Brasil, além de indivíduos do Paraguai, Uruguai e Argentina. Foram sequenciados três fragmentos gênicos mitocondriais (cytb, 12S e CO1) e um fragmento nuclear (RAG-1). 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O segundo cenário aponta para a existência de ao menos nove espécies: uma nos Pampas, outra no Chaco e as demais isoladas em „sky-islands‟ no Cerrado e na Mata Atlântica. O primeiro evento cladogenético das linhagens data do Mioceno Superior, há aproximadamente 7.5 milhões de anos, possivelmente em detrimento da última retração do Mar Paranaense. Neste período, surgiram novas áreas adequadas à S. squalirostris, originando o clado tropical e o subtropical/temperado, compatíveis com o primeiro cenário taxonômico. A diversificação dentro destes dois grandes clados provavelmente IX ocorreu no final do Terciário e no início do Quaternário. A atual distribuição de S. squalirostris na zona tropical deve estar ligada às mudanças climáticas e geológicas ocorridas a partir da transição entre o Plioceno e o Pleistoceno. Durante as glaciações do Quaternário, os campos sofreram expansão (durante os períodos glaciais) e retração (durante os interglaciais). Com o aumento da temperatura e da umidade no Holoceno Tardio, houve retração dos campos em favor da expansão das florestas e savanas arbóreas/arbustivas. Com isso, os hábitats ideais à S. squalirostris ficaram restritos aos campos em altitudes maiores do que 800m nas regiões tropicais. Os ciclos de isolamento dos campos em ilhas devem ter influenciado na diversificação local e recente das linhagens de S. squalirostris. 2016-09-01T15:17:59Z 2012-04-27 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis MAGALHÃES, R. F. Filogeografia em áreas abertas da América do Sul: origem e diversificação de linhagens de Scinax squalirostris (Anura, Hylidae). 2012. 98 f. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Evolução) - Universidade Federal de Goiás, Goiânia, 2012. http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/6085 por -5361682850774351271 600 600 600 600 -3872772117827373404 3263499605295365002 -2555911436985713659 http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ info:eu-repo/semantics/openAccess application/pdf Universidade Federal de Goiás Programa de Pós-graduação em Ecologia e Evolução (ICB) UFG Brasil Instituto de Ciências Biológicas - ICB (RG) reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG instname:Universidade Federal de Goiás instacron:UFG |