Estudo de associação ampla do genoma bovino para lactação ajustada em 305 dias em girolando

• Main Author: Cruz, Alex Silva da
• Other Authors: Cruz, Aparecido Divino da
• Format: Others
• Language: Portuguese
• Published: Universidade Federal de Goiás 2016
• Subjects: GWAS; Raça composta; Heterose; SNP; DGAT1; Industrial crossing; Heterosis; CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
• Online Access: http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/5663

Submitted by Marlene Santos ([e-mail]) on 2016-06-08T20:29:50Z No. of bitstreams: 2 Tese - Alex Silva da Cruz - 2015.pdf: 4189617 bytes, checksum: f21e8815a51e44f144dd811005f32bdd (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) === Approved for entry into archive by Luciana Ferreira ([e-mail]) on 2016-06-09T11:41:47Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Alex Silva da Cruz - 2015.pdf: 4189617 bytes, checksum: f21e8815a51e44f144dd811005f32bdd (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) === Made available in DSpace on 2016-06-09T11:41:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Alex Silva da Cruz - 2015.pdf: 4189617 bytes, checksum: f21e8815a51e44f144dd811005f32bdd (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) Previous issue date: 2015-10-19 === Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG === Genomic selection in a dairy cattle breeding is a new strategy in national livestock. Genome wide association study (GWAS) is known as a strategy that involve the use of molecular markers panels distributed throughout the genome which are selected for the identification of chromosomal regions that are important for the interest traits. The aim of this study was apply the GWAS strategy for 305-day milk yield in Girolando cows. We did the genotype from 404 Girolando and after quality control analysis remained 337 individuals and 45.622 markers. The GWAS analysis resulted in 52 SNPs associated to 305-day milk yield. Of these, 23 SNPs were linked to Known genes and only 3 SNPs were linked to NUB1, SLC24A2 and DGAT1 genes that already were associated with cattle lactation. The other SNPs have no relationships described in the cattle lactation literature. In addition, the milk production QTL analysis resulted in 52 SNPs and 14 genes linked or close to 1Mb of the SNP marker. The ARS-BFGL-NGS-414 SNP on BTA19 at 47.9Mbp is located near to GH1 gene. This gene is commonly accepted as causal gene for Quantitative Character Locus of milk production mainly affecting the yield in liters and solid milk components. Thus, our data suggest that NUB1 and SLC24A2 genes could be considered as candidate genes to understand the milk production in Girolando breed. Like this DGAT1 and GH1 genes are valuable predictive markers to be added to genomic selection of dairy cattle in breeding program. === A seleção genômica, aplicada em bovino em associação à produção de leite é uma inovação estratégica na pecuária nacional, e que poderá se tornar uma ferramenta prática importante para a atividade. Estudos de Associação Ampla do Genoma (GWAs) caracteriza-se como uma estratégia que envolve o uso de painéis de marcadores moleculares distribuídos por todo o genoma, selecionados para a identificação de regiões dos cromossomos associadas com um fenótipo de interesse. O objetivo deste estudo foi aplicar a estratégia de GWAS para a característica de lactação total ajustada em 305 dias de vacas Girolando. Inicialmente, foram genotipados 404 vacas Girolando que após procedimento de controle de qualidade resultou em um total de 337 indivíduos e 45.622 marcador. O GWAS resultou em 52 SNPs associados a lactação ajustada em 305 dias. Destes, 23 SNPs apresentaram-se ligados a genes conhecidos e somente 3 SNPs estão ligados aos genes NUB1, SLC24A2 e DGAT1, descritos relacionados a lactação em bovinos. Os demais SNPs não apresentam relações descrita na literatura a lactação em bovinos. Para o QTL de produção de leite (MY), dos 52 SNPs, foram identificados 14 genes ligados ou próximos a 1Mb de distância do SNP marcador. Em particular, o SNP ARS-BFGL-NGS-414 associado ao QTL de lactação bovina, constituído de aproximadamente 47,9 Mbp localizado no BTA19 está localizado muito próximo do gene GH1 (Hormônio do Crescimento 1), comumente aceito como gene causal para o Lócus de Caráter Quantitativo (QTL) de produção de leite, afetando principalmente o rendimento em litros e componentes sólidos do leite. Dessa forma, nossos dados sugerem que os genes NUB1, e SLC24A2 poderiam ser considerados como genes candidatos para ajudar a explicar a produção de leite em animais da raça Girolando, assim como os genes DGAT1 e GH1, são considerados como valiosos marcadores preditivos a serem adicionados à seleção genômica do gado leiteiro em programas de melhoramento.