Propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de DNA

Conforme diversos artigos, as sequênncias de DNA apresentam longa dependência, isto é, mesmo para tempos bastante distantes entre si, a correlação entre as variáveis aleatórias é não desprezível. Neste trabalho, verificamos se esta longa dependência pode ser explicada pelos processos auto-regressivo...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Linhares, Raquel Romes
Other Authors: Lopes, Silvia Regina Costa
Format: Others
Language:Portuguese
Published: 2012
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10183/60535
id ndltd-IBICT-oai-lume56.ufrgs.br-10183-60535
record_format oai_dc
spelling ndltd-IBICT-oai-lume56.ufrgs.br-10183-605352018-09-30T04:13:25Z Propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de DNA Linhares, Raquel Romes Lopes, Silvia Regina Costa Matematica : Processos estocasticos Modelos de longa dependencia : Processo arfima Biologia molecular Dna : Sequencia Conforme diversos artigos, as sequênncias de DNA apresentam longa dependência, isto é, mesmo para tempos bastante distantes entre si, a correlação entre as variáveis aleatórias é não desprezível. Neste trabalho, verificamos se esta longa dependência pode ser explicada pelos processos auto-regressivos médias móveis fracionariamente integráveis (ARFIMA(p; d; q)), através da análise de diversas sequências de DNA em todos os domínios da vida. Para estimar o parâmetro de diferenciação d utilizamos os seguintes métodos de estimação: semiparamétrico baseado na equação de regressão linear utilizando a função periodograma, em versão clássica e robusta; o da máxima verossimilhança (ver Fox e Taqqu, 1986), utilizando a aproximação sugerida por Whittle (1953) e o método semiparamétrico R/S(n), proposto por Hurst (1951). O objetivo principal deste trabalho é analisar o método da análise de flutuações destendenciadas ("Detrended Fluctuation Analysis" - DFA), pro- posto por Peng et al. (1994). Este método é estabelecido como uma importante ferramenta para detectar longa dependência em séries temporais não estacionárias. Descrevemos o método DFA e analisamos sua consistência e distribuição assintótica como um estimador para o parâmetro fracionário d. In the literature it is stated that the DNA sequences present the long- range dependence property. In this work, we analyze this long dependence property in view of the autoregressive moving average fractionally integrated ARFIMA (p; d; q) processes through the analysis of several DNA sequences in all life domain. For estimating the fractional parameter d we consider the following estimation methods: the semiparametric regression method based on the periodogram function, in both classical and robust version; the maximum likelihood method (see Fox and Taqqu, 1986), by considering the approximation suggested by Whittle (1953) and the semiparametric R/S(n) method, proposed by Hurst (1951). The main goal of this work is to consider the detrended °uctuation analysis (DFA), proposed by Peng et al. (1994). This is a well known method for analyzing the long-range dependence in non-stationary time series. In this work we describe the DFA method and we prove its consistency and its asymptotic distribution as an estimator for the fractional parameter d. 2012-11-01T01:39:00Z 2007 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis http://hdl.handle.net/10183/60535 000622974 por info:eu-repo/semantics/openAccess application/pdf reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul instacron:UFRGS
collection NDLTD
language Portuguese
format Others
sources NDLTD
topic Matematica : Processos estocasticos
Modelos de longa dependencia : Processo arfima
Biologia molecular
Dna : Sequencia
spellingShingle Matematica : Processos estocasticos
Modelos de longa dependencia : Processo arfima
Biologia molecular
Dna : Sequencia
Linhares, Raquel Romes
Propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de DNA
description Conforme diversos artigos, as sequênncias de DNA apresentam longa dependência, isto é, mesmo para tempos bastante distantes entre si, a correlação entre as variáveis aleatórias é não desprezível. Neste trabalho, verificamos se esta longa dependência pode ser explicada pelos processos auto-regressivos médias móveis fracionariamente integráveis (ARFIMA(p; d; q)), através da análise de diversas sequências de DNA em todos os domínios da vida. Para estimar o parâmetro de diferenciação d utilizamos os seguintes métodos de estimação: semiparamétrico baseado na equação de regressão linear utilizando a função periodograma, em versão clássica e robusta; o da máxima verossimilhança (ver Fox e Taqqu, 1986), utilizando a aproximação sugerida por Whittle (1953) e o método semiparamétrico R/S(n), proposto por Hurst (1951). O objetivo principal deste trabalho é analisar o método da análise de flutuações destendenciadas ("Detrended Fluctuation Analysis" - DFA), pro- posto por Peng et al. (1994). Este método é estabelecido como uma importante ferramenta para detectar longa dependência em séries temporais não estacionárias. Descrevemos o método DFA e analisamos sua consistência e distribuição assintótica como um estimador para o parâmetro fracionário d. === In the literature it is stated that the DNA sequences present the long- range dependence property. In this work, we analyze this long dependence property in view of the autoregressive moving average fractionally integrated ARFIMA (p; d; q) processes through the analysis of several DNA sequences in all life domain. For estimating the fractional parameter d we consider the following estimation methods: the semiparametric regression method based on the periodogram function, in both classical and robust version; the maximum likelihood method (see Fox and Taqqu, 1986), by considering the approximation suggested by Whittle (1953) and the semiparametric R/S(n) method, proposed by Hurst (1951). The main goal of this work is to consider the detrended °uctuation analysis (DFA), proposed by Peng et al. (1994). This is a well known method for analyzing the long-range dependence in non-stationary time series. In this work we describe the DFA method and we prove its consistency and its asymptotic distribution as an estimator for the fractional parameter d.
author2 Lopes, Silvia Regina Costa
author_facet Lopes, Silvia Regina Costa
Linhares, Raquel Romes
author Linhares, Raquel Romes
author_sort Linhares, Raquel Romes
title Propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de DNA
title_short Propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de DNA
title_full Propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de DNA
title_fullStr Propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de DNA
title_full_unstemmed Propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de DNA
title_sort propriedades estatísticas do método da análise de flutuações destendenciadas em seqüências de dna
publishDate 2012
url http://hdl.handle.net/10183/60535
work_keys_str_mv AT linharesraquelromes propriedadesestatisticasdometododaanalisedeflutuacoesdestendenciadasemsequenciasdedna
_version_ 1718750869784100864