Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular
Atualmente existe uma crescente preocupação com a preservação de monumentos que fazem parte do patrimônio histórico e cultural de povos e nações, e tem-se observado que dentre os vários fatores que contribuem para a degradação destes monumentos, há a ação de uma microbiota fototrófica ativa e divers...
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2013
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ndltd-IBICT-oai-lume.ufrgs.br-10183-676232018-10-21T17:00:41Z Identificação de cianobactérias em biofilmes de superfícies externas de prédios históricos : análise morfológica e molecular Identification of cyanobacteria in biofilms on external surfaces of historic buildings: morphological and molecular analysis Crispim, Cézar Augusto Freire, Joao Ruy Jardim Bacteria Atualmente existe uma crescente preocupação com a preservação de monumentos que fazem parte do patrimônio histórico e cultural de povos e nações, e tem-se observado que dentre os vários fatores que contribuem para a degradação destes monumentos, há a ação de uma microbiota fototrófica ativa e diversa, formada principalmente por cianobactérias e algas. Foram estudadas em Porto Alegre seis igrejas com importância histórica, utilizando-se técnicas de microbiologia tradicionais e de biologia molecular. Um método rápido e simples para a amplificação por PCR foi desenvolvido, não sendo necessário o cultivo das células. Foram encontrados oito gêneros de cianobactérias filamentosas e quatro gêneros de cianobactérias cocóides. Vários dos grupos identificados são reconhecidos como degradadores de pedras (o grupo Pleurocapsa, Synechocystis, Gloeocapsa, Microcoleus, Scytonema e Mastigocladus). Alguns produtos de PCR foram seqüenciados e submetidos ao algoritmo BLAST, com o intuito de verificar o nível de similaridade com as seqüências depositadas de outras cianobactérias. Foi observado que o nível de similaridade da maioria das amostras foi baixo, provavelmente em função do fato de que a maioria das seqüências depositadas nos bancos de dados é proveniente de espécies aquáticas, as quais são consideravelmente diferentes das cianobactérias presentes em biofilmes em construções. Os dendrogramas construídos utilizando-se o "bootstrapping" mostraram que as amostras filamentosas nos biofilmes estudados geralmente agruparam-se com espécies semelhantes presentes nos bancos de dados. Contudo, de acordo com os resultados deste estudo e da literatura corrente, ainda há muitos problemas em relação à taxonomia de cianobactérias, o que indica a necessidade de mais estudos nesta área. There is today an increasing concern about the preservation of monuments, which are part of the historic and cultural heritage of peoples and nations. Among severa) factors contributing to the degradation of these monuments, the action of an active and diverse microflora, formed principally by cyanobacteria and algae, has been emphasized. Six churches of historic importance were studied in Porto Alegre, using traditional microbiological and molecular methods. A simple and fast PCR amplification methodology was developed, which did not require the culturing of samples. Eight genera of filamentous and four genera of coccoid cyanobacteria were identified in the biofilms. Severa) of the groups detected are known to degrade stone (the Pleurocapsa group, Synechocystis, Gloeocapsa, Microcoleus, Scytonema and Mastígocladus). Soormnee PCR products were sequenced and submitted to the BLAST algorithm, in order to verify the levei of similarity with sequences deposited for other cyanobacteria. The leve) of homology of most samples was low, probably because most of the deposited sequences are from aquatic cyanobacteria species, which are considerably different from those present in biofilms on buildings. The dendrograms, constructed by bootstrapping, showed that the filamentous samples in the biofilms generally grouped with similar species in data banks. However, according to the results of this study and the current literature, there are many problems with the present taxonomy of cyanobacteria, which indicates the need for further studies in this area. 2013-03-14T01:39:12Z 2003 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis http://hdl.handle.net/10183/67623 000391082 por info:eu-repo/semantics/openAccess application/pdf reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul instacron:UFRGS |
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Atualmente existe uma crescente preocupação com a preservação de monumentos que fazem parte do patrimônio histórico e cultural de povos e nações, e tem-se observado que dentre os vários fatores que contribuem para a degradação destes monumentos, há a ação de uma microbiota fototrófica ativa e diversa, formada principalmente por cianobactérias e algas. Foram estudadas em Porto Alegre seis igrejas com importância histórica, utilizando-se técnicas de microbiologia tradicionais e de biologia molecular. Um método rápido e simples para a amplificação por PCR foi desenvolvido, não sendo necessário o cultivo das células. Foram encontrados oito gêneros de cianobactérias filamentosas e quatro gêneros de cianobactérias cocóides. Vários dos grupos identificados são reconhecidos como degradadores de pedras (o grupo Pleurocapsa, Synechocystis, Gloeocapsa, Microcoleus, Scytonema e Mastigocladus). Alguns produtos de PCR foram seqüenciados e submetidos ao algoritmo BLAST, com o intuito de verificar o nível de similaridade com as seqüências depositadas de outras cianobactérias. Foi observado que o nível de similaridade da maioria das amostras foi baixo, provavelmente em função do fato de que a maioria das seqüências depositadas nos bancos de dados é proveniente de espécies aquáticas, as quais são consideravelmente diferentes das cianobactérias presentes em biofilmes em construções. Os dendrogramas construídos utilizando-se o "bootstrapping" mostraram que as amostras filamentosas nos biofilmes estudados geralmente agruparam-se com espécies semelhantes presentes nos bancos de dados. Contudo, de acordo com os resultados deste estudo e da literatura corrente, ainda há muitos problemas em relação à taxonomia de cianobactérias, o que indica a necessidade de mais estudos nesta área. === There is today an increasing concern about the preservation of monuments, which are part of the historic and cultural heritage of peoples and nations. Among severa) factors contributing to the degradation of these monuments, the action of an active and diverse microflora, formed principally by cyanobacteria and algae, has been emphasized. Six churches of historic importance were studied in Porto Alegre, using traditional microbiological and molecular methods. A simple and fast PCR amplification methodology was developed, which did not require the culturing of samples. Eight genera of filamentous and four genera of coccoid cyanobacteria were identified in the biofilms. Severa) of the groups detected are known to degrade stone (the Pleurocapsa group, Synechocystis, Gloeocapsa, Microcoleus, Scytonema and Mastígocladus). Soormnee PCR products were sequenced and submitted to the BLAST algorithm, in order to verify the levei of similarity with sequences deposited for other cyanobacteria. The leve) of homology of most samples was low, probably because most of the deposited sequences are from aquatic cyanobacteria species, which are considerably different from those present in biofilms on buildings. The dendrograms, constructed by bootstrapping, showed that the filamentous samples in the biofilms generally grouped with similar species in data banks. However, according to the results of this study and the current literature, there are many problems with the present taxonomy of cyanobacteria, which indicates the need for further studies in this area. |
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