Expressão e regulação do gene VEGFA por microRNAs em cirrose hepática e carcinoma hepatocelular.
Submitted by Fabíola Silva (fabiola.silva@famerp.br) on 2017-08-03T12:25:59Z No. of bitstreams: 1 andrerodrigueirocpdeoliveira_tese.pdf: 1590220 bytes, checksum: c85526dbe8e00ebf97a87b9215d49485 (MD5) === Made available in DSpace on 2017-08-03T12:25:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 andrerodrigueiroc...
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Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto
2017
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Neoplasias Hepáticas Cirrose Hepática Hepatopatias Expressão Gênica MicroRNAs Liver Neoplasms Liver Cirrhosis Liver Diseases Gene Expression MicroRNAs CIENCIAS DA SAUDE Oliveira, André Rodrigueiro Clavisio Pereira Expressão e regulação do gene VEGFA por microRNAs em cirrose hepática e carcinoma hepatocelular. |
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Submitted by Fabíola Silva (fabiola.silva@famerp.br) on 2017-08-03T12:25:59Z
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Previous issue date: 2015-11-27 === Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES === Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq === Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP === Introduction: Hepatocellular carcinoma (HCC) is a primary liver tumor and the
sixth most common type of cancer. Liver cirrhosis (LC) and viral hepatitis are their
main risk factors. Injured tissues and development process tissues need new
blood vessels, i. e., angiogenic process, that initiates by means of vascular
endothelial growth factors secretion, that is translated by VEGFA gene and
regulated by non-coding RNA, miRNA, that consists of a single strand of
approximately 22 nucleotides and has the function of binding to mRNA strand, to
inhibit protein translation. Objectives: To quantify VEGFA gene expression and
17 miRNAs predicted as its regulator in HCC and liver cirrhosis; to assess VEGFA
gene expression in relation to miRNAs expression and quantify VEGFA protein
expression in HCC and liver cirrhosis tissues. Patients and methods: Sixteen
samples of HCC tissue, 23 samples of liver cirrhosis tissue and 12 samples of
normal liver tissue were collected. Total RNA and proteins were isolated by
mirVana PARIS kit. VEGFA gene mRNA quantification and 17 miRNAs predicted
as regulators expression was performed by real time quantitative PCR.
Customized plates, TaqMan miRNA custom plate, were used for miRNAs.
Statistical analysis was performed by one sample t test, Wilcoxon tests and
Mann-Whitney test. Results: VEGFA gene expression was found downregulated
in HCC and there is negative correlation between gene expression and
tumor extension. MicroRNA hsa-miR-637 has showed significance and was
down-regulated on samples (mean 0.2003, p=0.0004) in LC, whereas miRNAs
hsa-miR-15b (median 0.04015; p=0.0005), hsa-miR-125b (median 0.01876;
p=0.0005), hsa-miR-423 (median 0.02650; p=0.0005), hsa-miR-424 (median
0.00462; p=0.0156), hsa-miR-494 (median 0.00877; p=0.0010), hsa-miR-497 (median 0.04487; p=0.0005), hsa-miR-612 (median 0.00679; p=0.0039) and hsamiR-637
(median 0.00166; p=0.0039) are down-regulated in HCC. Conclusions:
VEGFA gene expression is down-regulated in HCC. MicroRNA hsa-miR-637 is
down-regulated in LC. MicroRNAs hsa-miR-15b, hsa-miR-125b, hsa-miR-423,
hsa-miR-424, hsa-miR-494, hsa-miR-497, hsa-miR-612 e hsa-miR-637 are
down-regulated in HCC. VEGFA protein expression is low in HCC, corroborating
to gene expression found in HCC. === Introdução: O Carcinoma hepatocelular (CHC) é o tipo de tumor primário do
fígado e o quinto tipo de câncer mais comum. A cirrose hepática (CH) e as
hepatites virais são seus principais fatores de risco. Tecidos lesionados e em
processo de crescimento necessitam de novos vasos sanguíneos, ou seja,
processo angiogênico, que é iniciado por meio da secreção de fatores de
crescimento endoteliais vasculares. Este é produzido a partir do gene VEGFA e
regulado por RNA não codificante, o microRNA, que é constituído por uma fita
simples de aproximadamente 22 nucleotídeos e tem a função de ligação ao
mRNA, para inibição da tradução de proteínas. Objetivos: Quantificar a
expressão do gene VEGFA e 17 miRNAs preditos como seus reguladores em
CHC e cirrose hepática; avaliar a expressão do gene VEGFA em relação à
expressão dos miRNAs e quantificar a expressão das proteínas VEGFA em CHC
e cirrose hepática. Casuística e métodos: Foram coletadas 16 amostras de
tecido de CHC, 23 amostras de tecido cirrose hepática e 12 amostras de tecido
hepático normal para controle. A extração de RNA e proteínas totais foi realizada
por meio do kit mirVana PARIS. A quantificação do mRNA do gene VEGFA e
dos 17 miRNAs selecionados preditos como reguladores do gene foi realizada
por meio da técnica de PCR quantitativa em tempo real. Para os miRNAs foram
utilizadas placas customizadas TaqMan miRNA custom plates. A análise
estatística foi realizada por teste t de uma amostra, teste de Wilcoxon e teste de
Mann-Whitney. Resultados: O gene VEGFA foi encontrado em expressão
diminuída em CHC e há correlação negativa entre a expressão e a extensão do
tumor. O miRNA hsa-miR-637 mostrou significância e sua expressão foi
encontrada diminuída nas amostras (média=0,2003, p=0,0004) em CH, enquanto que os miRNAs hsa-miR-15b (mediana 0,04015; p=0,0005), hsa-miR-
125b (mediana 0,01876; p=0,0005), hsa-miR-423 (mediana 0,02650; p=0,0005),
hsa-miR-424 (mediana 0,00462; p=0,0156), hsa-miR-494 (mediana 0,00877;
p=0,0010), hsa-miR-497 (mediana 0,04487; p=0,0005), hsa-miR-612 (mediana
0,00679; p=0,0039) e hsa-miR-637 (mediana 0,00166; p=0,0039) estão em
expressão diminuída em CHC. Conclusão: A expressão do gene VEGFA
encontra-se diminuída em CHC. O microRNA hsa-miR-637 encontra-se em
expressão diminuída em CH. Os miRNAs hsa-miR-15b, hsa-miR-125b, hsa-miR-
423, hsa-miR-424, hsa-miR-494, hsa-miR-497, hsa-miR-612 e hsa-miR-637
encontram-se em expressão diminuída em CHC. A expressão das proteínas
VEGFA está diminuída em carcinoma hepatocelular, corroborando com o
encontrado para a expressão gênica em CHC. |
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ndltd-IBICT-oai-localhost-tede-3742019-03-21T03:39:27Z Expressão e regulação do gene VEGFA por microRNAs em cirrose hepática e carcinoma hepatocelular. Oliveira, André Rodrigueiro Clavisio Pereira Silva, Renato Ferreira da Goloni-Bertollo, Eny Maria Pavarino, Érika Cristina Duca, William José D´ Albuquerque, Luiz Augusto Pascios Carneiro Melo, Marcelo Maia Caixeta de Neoplasias Hepáticas Cirrose Hepática Hepatopatias Expressão Gênica MicroRNAs Liver Neoplasms Liver Cirrhosis Liver Diseases Gene Expression MicroRNAs CIENCIAS DA SAUDE Submitted by Fabíola Silva (fabiola.silva@famerp.br) on 2017-08-03T12:25:59Z No. of bitstreams: 1 andrerodrigueirocpdeoliveira_tese.pdf: 1590220 bytes, checksum: c85526dbe8e00ebf97a87b9215d49485 (MD5) Made available in DSpace on 2017-08-03T12:25:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 andrerodrigueirocpdeoliveira_tese.pdf: 1590220 bytes, checksum: c85526dbe8e00ebf97a87b9215d49485 (MD5) Previous issue date: 2015-11-27 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP Introduction: Hepatocellular carcinoma (HCC) is a primary liver tumor and the sixth most common type of cancer. Liver cirrhosis (LC) and viral hepatitis are their main risk factors. Injured tissues and development process tissues need new blood vessels, i. e., angiogenic process, that initiates by means of vascular endothelial growth factors secretion, that is translated by VEGFA gene and regulated by non-coding RNA, miRNA, that consists of a single strand of approximately 22 nucleotides and has the function of binding to mRNA strand, to inhibit protein translation. Objectives: To quantify VEGFA gene expression and 17 miRNAs predicted as its regulator in HCC and liver cirrhosis; to assess VEGFA gene expression in relation to miRNAs expression and quantify VEGFA protein expression in HCC and liver cirrhosis tissues. Patients and methods: Sixteen samples of HCC tissue, 23 samples of liver cirrhosis tissue and 12 samples of normal liver tissue were collected. Total RNA and proteins were isolated by mirVana PARIS kit. VEGFA gene mRNA quantification and 17 miRNAs predicted as regulators expression was performed by real time quantitative PCR. Customized plates, TaqMan miRNA custom plate, were used for miRNAs. Statistical analysis was performed by one sample t test, Wilcoxon tests and Mann-Whitney test. Results: VEGFA gene expression was found downregulated in HCC and there is negative correlation between gene expression and tumor extension. MicroRNA hsa-miR-637 has showed significance and was down-regulated on samples (mean 0.2003, p=0.0004) in LC, whereas miRNAs hsa-miR-15b (median 0.04015; p=0.0005), hsa-miR-125b (median 0.01876; p=0.0005), hsa-miR-423 (median 0.02650; p=0.0005), hsa-miR-424 (median 0.00462; p=0.0156), hsa-miR-494 (median 0.00877; p=0.0010), hsa-miR-497 (median 0.04487; p=0.0005), hsa-miR-612 (median 0.00679; p=0.0039) and hsamiR-637 (median 0.00166; p=0.0039) are down-regulated in HCC. Conclusions: VEGFA gene expression is down-regulated in HCC. MicroRNA hsa-miR-637 is down-regulated in LC. MicroRNAs hsa-miR-15b, hsa-miR-125b, hsa-miR-423, hsa-miR-424, hsa-miR-494, hsa-miR-497, hsa-miR-612 e hsa-miR-637 are down-regulated in HCC. VEGFA protein expression is low in HCC, corroborating to gene expression found in HCC. Introdução: O Carcinoma hepatocelular (CHC) é o tipo de tumor primário do fígado e o quinto tipo de câncer mais comum. A cirrose hepática (CH) e as hepatites virais são seus principais fatores de risco. Tecidos lesionados e em processo de crescimento necessitam de novos vasos sanguíneos, ou seja, processo angiogênico, que é iniciado por meio da secreção de fatores de crescimento endoteliais vasculares. Este é produzido a partir do gene VEGFA e regulado por RNA não codificante, o microRNA, que é constituído por uma fita simples de aproximadamente 22 nucleotídeos e tem a função de ligação ao mRNA, para inibição da tradução de proteínas. Objetivos: Quantificar a expressão do gene VEGFA e 17 miRNAs preditos como seus reguladores em CHC e cirrose hepática; avaliar a expressão do gene VEGFA em relação à expressão dos miRNAs e quantificar a expressão das proteínas VEGFA em CHC e cirrose hepática. Casuística e métodos: Foram coletadas 16 amostras de tecido de CHC, 23 amostras de tecido cirrose hepática e 12 amostras de tecido hepático normal para controle. A extração de RNA e proteínas totais foi realizada por meio do kit mirVana PARIS. A quantificação do mRNA do gene VEGFA e dos 17 miRNAs selecionados preditos como reguladores do gene foi realizada por meio da técnica de PCR quantitativa em tempo real. Para os miRNAs foram utilizadas placas customizadas TaqMan miRNA custom plates. A análise estatística foi realizada por teste t de uma amostra, teste de Wilcoxon e teste de Mann-Whitney. Resultados: O gene VEGFA foi encontrado em expressão diminuída em CHC e há correlação negativa entre a expressão e a extensão do tumor. O miRNA hsa-miR-637 mostrou significância e sua expressão foi encontrada diminuída nas amostras (média=0,2003, p=0,0004) em CH, enquanto que os miRNAs hsa-miR-15b (mediana 0,04015; p=0,0005), hsa-miR- 125b (mediana 0,01876; p=0,0005), hsa-miR-423 (mediana 0,02650; p=0,0005), hsa-miR-424 (mediana 0,00462; p=0,0156), hsa-miR-494 (mediana 0,00877; p=0,0010), hsa-miR-497 (mediana 0,04487; p=0,0005), hsa-miR-612 (mediana 0,00679; p=0,0039) e hsa-miR-637 (mediana 0,00166; p=0,0039) estão em expressão diminuída em CHC. Conclusão: A expressão do gene VEGFA encontra-se diminuída em CHC. O microRNA hsa-miR-637 encontra-se em expressão diminuída em CH. Os miRNAs hsa-miR-15b, hsa-miR-125b, hsa-miR- 423, hsa-miR-424, hsa-miR-494, hsa-miR-497, hsa-miR-612 e hsa-miR-637 encontram-se em expressão diminuída em CHC. A expressão das proteínas VEGFA está diminuída em carcinoma hepatocelular, corroborando com o encontrado para a expressão gênica em CHC. 2017-08-03T12:25:59Z 2015-11-27 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Oliveira, André Rodrigueiro Clavisio Pereira. Expressão e regulação do gene VEGFA por microRNAs em cirrose hepática e carcinoma hepatocelular. 2015. 84 p. Tese (Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde) - Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto. http://hdl.handle.net/tede/374 1265 por -6954410853678806574 500 500 600 600 600 600 306626487509624506 8765449414823306929 2075167498588264571 -2555911436985713659 -6491868300948288337 info:eu-repo/semantics/openAccess application/pdf Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde FAMERP Brasil Faculdade 1::Departamento 1 reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP instname:Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto instacron:FAMERP |