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RAFAELA BEZERRA DA SILVA - DISSERTAÇÃO PPGCNBio 2015..pdf: 1983101 bytes, checksum: b3bac7399ef1511132df3b9a76b369e7 (MD5) === Made available in DSpace on 2018-07-26T13:36:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1
RAFAELA BEZERRA DA SILVA - DISSERTAÇÃO PPGCNBio 2015..pdf: 1983101 bytes, checksum: b3bac7399ef1511132df3b9a76b369e7 (MD5)
Previous issue date: 2015-07-23 === CNPq === O desenho racional de fármacos tem sido largamente utilizado para o desenvolvimento de medicamentos mais eficazes no tratamento de diversas doenças, inclusive o câncer. Este termo é utilizado para o conjunto de doenças ocasionadas pelo crescimento desordenado de células, que invadem tecidos e órgãos do próprio organismo, podendo se espalhar por todo o corpo, processo denominado metástase. Entre as diversas pesquisas direcionadas à formação de novas drogas para o tratamento de tumores está a terapia alvo molecular que se baseia na utilização de fármacos que inativam uma determinada proteína de uma célula cancerígena. A Biologia Molecular identificou várias proteínas relacionadas com o câncer, dentre estas estão a midkina (MK) e a glutationa S-transferase da classe Pi (GSTP1), associadas à capacidade de multiplicação e à resistência dos tumores, respectivamente. O desenvolvimento de um inibidor que apresente especificidade tanto para a MK quanto para a GSTP1 possibilitará um tratamento sem prejuízos às células normais e uma melhor qualidade de vida aos pacientes cancerosos. O presente trabalho objetivou projetar uma molécula capaz de inibir as atividades biológicas da MK e da GST na referida patologia. Utilizando como recursos o site de busca Protein Data Banc (PDB) para a obtenção das estruturas tridimensionais estudadas, o Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) para alinhamento e análise das sequências protéicas, o software Hex 8.0 para a realização dos testes de docking molecular e o WinCoot 0.7.1 para a identificação das interações intermoleculares hidrofóbicas e de hidrogênio analisadas nos complexos gerados. Para o desenvolvimento da molécula foram utilizados como modelo os inibidores 6-(7-Nitro-2,1,3-Benzoxadiazol-4-Ylthio) Hexanol (NBDHEX) e o 5-propiltio-1H-benzimidazol-2-il) carbamato (albendazol). O inibidor desenvolvido (RBT15) foi projetado através de estruturas previamente depositadas no PDB e recortadas para atenderem as características topológicas dos receptores. Os testes analisados evidenciaram que o ligante RBT15 é energeticamente mais favorável e demonstrou interação com um maior número de resíduos de interesse que os outros dois inibidores analisados. Os dados sugerem que a estrutura desenvolvida pode vir a ser um potencial inibidor das proteínas MK e GSTP1. Sendo, por esse motivo, uma promissora molécula para o desenvolvimento de fármacos mais eficientes e menos invasivos para o tratamento de câncer. === The rational design of drugs has been widely used for drug development more effective in the treatment of various diseases, including cancer. This term used and hair diseases caused set cluttered cell growth, tissues and organs to invade que own body and can spread throughout the body, process called metastasis. Between how several research aimed at new training drugs for tumor treatment is molecular target therapy, which is based on the use of drugs that inactivate a particular cancer cell protein. Molecular biology has identified several proteins related to cancer, among these are Midkina (MK) and Glutathione S-Transferase Pi class (GSTP1), associated with the multiplication capacity and resistance of tumors, respectively. The development of a specific inhibitor that present both for GSTP1 and MK as to enable a free damage to normal cells treatment and better quality of life for cancer patients. This study aimed to design a molecule capable of inhibiting the biological activity of MK and GST in that condition. Using resources like search website Protein Data Bank (PDB) for obtaining the studied three-dimensional structures, the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) for alignment and analysis of protein sequences, the Hex 8.0 software for the realization of molecular docking test and WinCoot 0.7.1 to identify the hydrophobic intermolecular interactions and hydrogen generated in the analyzed complexes. For the development of the molecule were used as the template inhibitors 6-(7-nitro-2, 1, 3-benzoxadiazol-4-Ylthio) Hexanol (NBDHEX) and 5-propylthio-1H-benzimidazol-2-yl) carbamate (Albendazol). The developed inhibitor (RBT15) was designed using previously deposited in PDB structures and trimmed to meet the topological characteristics of the receivers. The tests showed that the analyzed RBT15 binder is energetically more favorable and demonstrated interaction with a larger number of residues of interest than the other two analyzed inhibitors. The data suggest that the developed structure might be a potential inhibitor of GSTP1 and MK proteins. Since, therefore, a promising molecule for the development of more efficient and less invasive drugs for the treatment of cancer.
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