Padrões genético-populacionais do “tracajá” Podocnemis unifilis (Troschel, 1848) (TESTUDINES: PODOCNEMIDIDAE) na Amazônia brasileira

• Main Author: Agostini, Maria Augusta Paes
• Other Authors: Farias, Izeni Pires
• Format: Others
• Language: Portuguese
• Published: Universidade Federal do Amazonas 2017
• Subjects: Genética de populações; Tracajá (Podocnemis unifilis); Tartaruga; CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
• Online Access: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5634

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No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Maria A. P. Agostini.pdf: 6019063 bytes, checksum: 87a17f7164c995addc5b46e34e5d51ec (MD5) Previous issue date: 2016-08-26 === CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior === The yellow-spotted river turtle Podocnemis unifilis is the most widely distributed freshwater river turtle and is found in a diversity of habitats. Associated with natural characteristics of turtles, human action causes a sharp population declines, causing species like P. unifilis to be on the list of animals to be protected by IBAMA. Many aspects of the biology of the species can be determined using molecular genetic analyses. In some rivers of the Amazon basin, rapids and waterfalls limit gene flow of various aquatic and semiaquatic groups, so it is necessary to study the patterns of species especially in places that are targeted for hydroelectric projects. Thus, we analyzed the D-loop region of mitochondrial DNA of 300 adult turtles of different rivers in the Brazilian Amazon basin, determining organizational patterns of genetic variability and evaluating the interference of natural barriers. We measured the number of haplotypes, the number of segregating sites, haplotype diversity, nucleotide diversity, neutrality tests, AMOVA and we constructed a haplotype network. To measure levels of structuring among populations, we inferred the Ф ST fixation index, the number of biological groups in the sample, level of gene flow, Mantel's test, and finally, we estimated natural barriers to gene flow using Barrier program. We found high genetic diversity and restricted gene flow with high levels of structuring between locations. The differences within the Madeira, Tapajós, Trombetas, Xingu and Tocantins-Araguaia rivers are possibly caused by waterfalls and rapids. We define 8 different Management Units: Barreirinha, middle Trombetas River, Tapajós River, upstream of the waterfall of Volta Grande do Xingu River, downstream of the waterfall of Volta Grande do Xingu River, Guaporé River, Tocantins-Araguaia basin and a group of the Amazon floodplain area with other populations. We indicate the use of our data in making decisions to release young in participatory management of project sites of Amazon turtles, in decisions on implementation of construction projects and inspection and seizure of illegal trade in turtles, and underline the importance of studying the species through other molecular markers to assist in the conservation of turtles. === O tracajá (Podocnemis unifilis) é a tartaruga de água doce com maior distribuição, podendo ser encontrada nos mais diversos habitats. Associada a características naturais dos quelônios, a ação humana provoca um declínio acentuado das populações, fazendo com que espécies como P.unifilis esteja na lista de animais a serem protegidos pelo IBAMA. Muitos aspectos da biologia das espécies podem ser determinados usando análises genéticas. Em alguns rios da bacia Amazônica, corredeiras e cachoeiras limitam o fluxo gênico de vários grupos aquáticos e semiaquáticos, portanto, é necessário estudar os padrões genéticos das espécies principalmente em locais que são visados para empreendimentos hidrelétricos. Com isso, analisamos a região D-Loop do DNA mitocondrial de 300 tracajás adultos de diferentes rios da drenagem da Amazônia brasileira, determinando padrões de organização da variabilidade genética e avaliando a interferência de barreiras naturais aos indivíduos. Foram medidos o número de haplótipos, número de sítios segregantes, a diversidade haplotípica, diversidade nucleotídicas, testes de neutralidade, AMOVA e foi construída uma rede de haplótipos. Para medir os níveis de estruturação entre as localidades inferimos o índice de fixação ФST, a quantidade de grupos biológicos na amostra, nível de fluxo genético, teste de Mantel, e por fim, foram estimadas as barreiras naturais ao fluxo gênico usando o programa Barrier. Encontramos altos valores de diversidade genética e um fluxo genético restrito com altos níveis de estruturação entre as localidades. As diferenças dentro dos rios Madeira, Tapajós, Trombetas, Xingu e Tocantins-Araguaia possivelmente são causadas pelas cachoeiras e corredeiras. Sugerimos 8 Unidades de Manejo distintas: Barreirinha, Médio rio Trombetas, rio Tapajós, montante da cachoeira da Volta Grande do Xingu, jusante da cachoeira da Volta Grande do Xingu, rio Guaporé, bacia Tocantins-Araguaia e um grupo da região da várzea amazônica com as demais localidades. Indicamos a utilização de nossos dados na tomada de decisão de locais de soltura de filhotes em projetos de manejo participativo de quelônios amazônicos, nas decisões sobre implantação de empreendimentos e na fiscalização e apreensão do comércio ilegal de tracajás, além de ressaltar a importância do estudo da espécie através de outros marcadores moleculares, a fim de auxiliar na conservação dos tracajás