Diversidade genética e estrutura de população entre isolados de Corynespora cassiicola no Estado do Amazonas

• Main Author: Ferreira, Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e
• Other Authors: Bentes, Jânia Lília da Silva
• Format: Others
• Language: Portuguese
• Published: Universidade Federal do Amazonas 2015
• Subjects: Estrutura de população; Reprodução assexuada; Fungo ascomyceto Corynespora cassiicola; Structure population; Asexual reproduction; CIÊNCIAS AGRÁRIAS: AGRONOMIA
• Online Access: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4679

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No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e Ferreira.pdf: 1305242 bytes, checksum: 1127ee4c263f9ff4d20ed1b5e301cccb (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 === CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior === The fungus Corynespora cassiicola is a plant pathogen that has worldwide distribution and has been reported causing disease on leaves, fruits, branches, nematode eggs, and even human skin. In Brazil, this pathogen has already caused serious damage to soybeans, papaya, acerola, and the northern region of the country, this pathogen has great importance in papaya, cucumber and tomato crops. Develop control strategies for a disease depends, among other factors, an understanding of the genetic variability and structure of the pathogen population, these being the goals of this work. We collected 169 isolates from papaya, tomato and cucumber, coming from the cities of Manaus, Iranduba and Presidente Figueiredo, Amazonas state, Brazil, 9 populations totaling.The genetic diversity was analyzed with 8 ISSR primers, 191 polymorphic locus getting, and the polymorphism rate was 100%. The genetic diversity was high in all populations, where the highest genetic diversity index was found in MA2 population (M= 0.43), and the smallest in population of Presidente Figueiredo: PE3 (H = 0.13) and MA3 (H = 0.15). All genotypes showed similar frequencies in the population (E5 = 1.0). Genotypic diversity (G0) ranged from 0.7 to 2.2, and in general was low in all populations, thus proving the absence of recombination. Random association tests detected high levels of linkage disequilibrium, eliminating the null hypothesis (IA> 0), being significant at 1% probability, the highest rates were found in MA1 populations (IA= 6.08) and MA2 (IA= 5:24). Bayesian analysis detected four genetic groups with mixture of genotypes in groups 2 and 3, suggesting gene flow and structure in a host in group 1 (papaya) and 4 (tomato). The population is structured with great distinction between them. MA3 and TO1 populations had higher (θ = 0.27), and the lowest value was found in TO3; TO2 and PE3, PE2 (θ= 0.05). Analysis of AMOVA, the biggest change is occurring within populations (84.3%), while 15.70% is occurring among populations. === O fungo ascomyceto Corynespora cassiicola é um fitopatógeno de ampla distribuição mundial, e já foi relatado causando doenças em folhas, frutos, ramos, ovos de nematóide, e inclusive na pele humana. No Brasil, C. cassiicola já causou sérios danos à soja, mamão e acerola, e na região norte do país, este patógeno tem grande importância nas culturas do mamão, pepino e tomate. Desenvolver estratégias de controle para uma doença, depende, entre outros fatores, de uma compreensão acerca da variabilidade e da estrutura genética de população do patógeno, sendo esses os objetivos desse trabalho. Foram coletados 169 isolados obtidos de mamão, tomate e pepino, oriundos dos municípios de Manaus, Iranduba e Presidente Figueiredo, do estado do Amazonas, Brasil, totalizando 9 populações. A diversidade genética de C. cassiicola foi analisada com 8 primers ISSR, obtendo 191 locus polimórficos, e o percentual de polimorfismo foi 100%. A diversidade gênica foi alta em todas as populações, onde o maior índice de diversidade gênica foi encontrado na população MA2 (H=0,43), e os menores em populações do município de Presidente Figueiredo: PE3 (H=0,13) e MA3 (H=0,15). Todos os genótipos tiveram frequências idênticas na população (E5= 1,0). Diversidade genotípica (G0) variou de 0.7 a 2.2, e em geral foi baixa em todas as populações, provando assim ausência de recombinação nas populações. Os testes de associação aleatória detectaram altos níveis de desequilíbrio de ligação, dispensando a hipótese nula (IA>0), sendo significativo a 1% de probabilidade, os índices mais altos foram encontrados nas populações MA1 (IA= 6.08) e MA2 (IA=5.24). Pela análise bayesiana detectou-se 4 grupos genéticos com mistura de genótipos nos grupos 2 e 3, sugerindo fluxo gênico e com estruturação por hospedeiro no grupo 1(mamão) e 4(tomate). A população está estruturada, com grande diferenciação entre elas. Populações MA3 e TO1 apresentaram maior valor (θ= 0,27), e o menor valor de foi encontrado em TO3;TO2 e PE3;PE2 (θ=0,05). A análise da AMOVA mostrou que a maior variação esta ocorrendo dentro das populações (84,3%), enquanto que 15.70% esta ocorrendo entre as populações.