Caracterização genética e do solo em populações nativas de Vochysia bifalcata warm. no Espírito Santo
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:37:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8344_Dissertação Final Larissa Vianna.pdf: 1816030 bytes, checksum: db630057efda6e596abefc0d380531fa (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 === CAPES === Vochysia bifalcata é conhecida popularmente como Guaricica, é...
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Universidade Federal do Espírito Santo
2016
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Floresta ombrófila densa montana Solos - Fertilidade Genética vegetal Diversidade genética Marcadores moleculares Genética Vegetal 63 |
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Floresta ombrófila densa montana Solos - Fertilidade Genética vegetal Diversidade genética Marcadores moleculares Genética Vegetal 63 Vianna, Larissa Souza Caracterização genética e do solo em populações nativas de Vochysia bifalcata warm. no Espírito Santo |
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Made available in DSpace on 2016-08-29T15:37:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1
tese_8344_Dissertação Final Larissa Vianna.pdf: 1816030 bytes, checksum: db630057efda6e596abefc0d380531fa (MD5)
Previous issue date: 2015-02-26 === CAPES === Vochysia bifalcata é conhecida popularmente como Guaricica, é uma espécie arbórea
neotropical cuja sobrevivência encontra-se ameaçada devido aos processos de degradação de
seus ambientes naturais e exploração antrópica, considerado o estado de ameaça em que se
encontram, faz-se necessário obter informações mais detalhadas sobre a diversidade genética
de populações naturais desta espécie, o que é possível a partir de estudos com marcadores
microssatélites. Neste contexto, o objetvo do presente estudo foi avaliar a diversidade
genética da espécie Vochysia bifalcata em duas populações nativas estabelecidas no Parque
Nacional do Caparaó, ES, bem como, caracterizar a fertilidade do solo. Para tanto, foram
coletadas amostras foliares de 28 individuos adultos em ambas populações, os testes de
transferifilidades foram realizados utilizando 8 primers microssatélites desenvolvidos para
Qualea grandiflora e 10 desenvolvidos para Vochysia ferrugínea no genoma dos indivíduos
de Vochysia bifalcata. Os marcadores que geraram amplificações satisfatórias foram
utilizados para os estudos de diversidade e estrutura genética em todos os 28 indivíduos
amostrados. Para a caracterização dos atributos químicos do solo, foram selecionados
aleatoriamente seis pontos de amostragem de solos em cada população, nas camadas de 0 – 5;
5 – 10 e 10 – 20 cm. Os resultados de amplificação heteróloga de Vochysia ferruginea para V.
bifalcata foram satisfatórios, sendo utilizados para as análises estatísticas e de Qualea
grandiflora para V. bifalcata foram satisfatórios, entretanto se mostraram monomórficos. Para
os iniciadores de V. ferruginea os resultados mostraram a ocorrência média de 4,85
alelos/loco. Dois dos sete locos analisados evidenciaram a presença de alelos nulos, com
frequência significativa. Os valores de riqueza alélica foram similares entre as duas
populações. O valor médio de heterozigosidade observada para a população I foi 0,434 e para
população II foi 0,355, ambos distintos do esperado para o equilíbrio de Hardy-Weinberg. O
índice de fixação médio para a população I foi de 0,390 e para a população II de 0,328,
indicando presença de endogamia nas populações. O valor médio do Conteúdo de Informação
Polimórfica (PIC) foi de 0,608 para a população I e 0,566 para a população II, sendo
considerados altamente informativos. O par de genótipos (9 e 11) e (5 e 9) foram identificados
como os menos dissimilares na população I e população II, respectivamente. O valor de GST
(0,079), indicou uma diferenciação genética moderada entre as populações. Para AMOVA,
10
92,86% da variação foram dentro de populações e 7,13% entre populações. Com a análise
bayesiana foi possível definir a divisão dos genótipos em dois grupos. O fluxo gênico médio
obtido foi de 2,88 sendo considerado alto o suficiente para contrapor os efeitos da deriva
genética. Os parâmetros genéticos obtidos geraram informações sobre a variabilidade genética
existente, comprovando a importância do Parque Nacional do Caparaó para fins
conservacionistas. As amostras de solos analisadas evidenciaram que a fertilidade de ambas
populações apresenta-se baixas e com uma acidez elevada === Vochysia bifalcata is popularly known as Guaricica, is a tree neotropical species
whose survival is threatened due to degradation processes of the natural environment and man
operation, considered the threat of state they are in, it is necessary to obtain more detailed
information the genetic diversity of natural populations of this species, which is possible from
studies with microsatellite markers. In this context, the present study was to evaluate objetvo
the genetic diversity of Vochysia bifalcata species and characterize soil fertility in two native
populations established in Caparaó National Park, ES. Therefore, leaf samples from 28 adult
individuals were collected from two native populations of V. bifalta. For transferability test
were tested 8 microsatellite primers developed for Qualea grandiflora and 10 designed to
Vochysia ferruginea in the genome of individuals to V. bifalcata. Total genomic DNA was
isolated using the Doyle & Doyle protocol (1990) modified. The amplified fragments were
separated by electrophoresis on gel polyacrylamide 10% with 1X TBE buffer. Electrophoresis
was performed at constant voltage of 100 W for 5 hours. The markers that generate
satisfactory amplifications were then used for the studies and genetic diversity of structure in
all 28 individuals sampled. We randomly selected six soil sampling points in each population
at depths 0-5; 5-10 e 10-20 cm and chemical analyzes were performed using the methodology
proposed by EMBRAPA (1997). The heterologous amplification results for V. ferruginea to
V. bifalcata were satisfactory, and then used for statistical analysis and Q. grandiflora for V.
bifalcata were satisfactory, however proved to be monomorphic. For starters, V. ferruginea
the results showed the average occurrence of 4.85 alleles/locus. In both two populations of
seven loci analyzed suggested the presence of null alleles, with significant frequency. The
allelic richness were similar between the two populations. The average observed
heterozygosity for the population I was 0.434 and population II was 0.355, both distinct from
the expected to the Hardy-Weinberg equilibrium. The average fixation index for the
population I was 0.390 and the population II was 0.328, indicating the presence of inbreeding
within populations. The average value of Polymorphic Information Content (PIC) was 0.608
for the population I and 0.566 for the population II and are considered highly informative. The
pair of genotypes (9 and 11) and (5 and 9) were identified as the least dissimilar opulations
the population I and II, respectively. The amount of GST (0.079) indicated a moderate genetic
differentiation among populations. To AMOVA, 92.86% of the variation was within
12
populations and among populations 7.13%. After analyzing the program, STRUCTURE was
possible to define the division into two groups of genotypes. The obtained average gene flow
was 2.88 being considered high enough to counteract the effects of genetic drift. These data
generate important information about the genetic variability, proving the importance of
Caparaó National Park for the species conservation. Soil samples analyzed demonstrated that
the fertility of both populations are present and a low acidity, the homogeneity of the soil
fertility can be explained by the soil and climatic characteristics similar between the two study
populations. |
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Miranda, Fábio Demolinari de |
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Miranda, Fábio Demolinari de Vianna, Larissa Souza |
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ndltd-IBICT-oai-dspace2.ufes.br-10-51192019-01-21T18:28:13Z Caracterização genética e do solo em populações nativas de Vochysia bifalcata warm. no Espírito Santo Vianna, Larissa Souza Miranda, Fábio Demolinari de Kunz, Sustanis Horn Caldeira, Marcos Vinicius Winckler Floresta ombrófila densa montana Solos - Fertilidade Genética vegetal Diversidade genética Marcadores moleculares Genética Vegetal 63 Made available in DSpace on 2016-08-29T15:37:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8344_Dissertação Final Larissa Vianna.pdf: 1816030 bytes, checksum: db630057efda6e596abefc0d380531fa (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 CAPES Vochysia bifalcata é conhecida popularmente como Guaricica, é uma espécie arbórea neotropical cuja sobrevivência encontra-se ameaçada devido aos processos de degradação de seus ambientes naturais e exploração antrópica, considerado o estado de ameaça em que se encontram, faz-se necessário obter informações mais detalhadas sobre a diversidade genética de populações naturais desta espécie, o que é possível a partir de estudos com marcadores microssatélites. Neste contexto, o objetvo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética da espécie Vochysia bifalcata em duas populações nativas estabelecidas no Parque Nacional do Caparaó, ES, bem como, caracterizar a fertilidade do solo. Para tanto, foram coletadas amostras foliares de 28 individuos adultos em ambas populações, os testes de transferifilidades foram realizados utilizando 8 primers microssatélites desenvolvidos para Qualea grandiflora e 10 desenvolvidos para Vochysia ferrugínea no genoma dos indivíduos de Vochysia bifalcata. Os marcadores que geraram amplificações satisfatórias foram utilizados para os estudos de diversidade e estrutura genética em todos os 28 indivíduos amostrados. Para a caracterização dos atributos químicos do solo, foram selecionados aleatoriamente seis pontos de amostragem de solos em cada população, nas camadas de 0 – 5; 5 – 10 e 10 – 20 cm. Os resultados de amplificação heteróloga de Vochysia ferruginea para V. bifalcata foram satisfatórios, sendo utilizados para as análises estatísticas e de Qualea grandiflora para V. bifalcata foram satisfatórios, entretanto se mostraram monomórficos. Para os iniciadores de V. ferruginea os resultados mostraram a ocorrência média de 4,85 alelos/loco. Dois dos sete locos analisados evidenciaram a presença de alelos nulos, com frequência significativa. Os valores de riqueza alélica foram similares entre as duas populações. O valor médio de heterozigosidade observada para a população I foi 0,434 e para população II foi 0,355, ambos distintos do esperado para o equilíbrio de Hardy-Weinberg. O índice de fixação médio para a população I foi de 0,390 e para a população II de 0,328, indicando presença de endogamia nas populações. O valor médio do Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) foi de 0,608 para a população I e 0,566 para a população II, sendo considerados altamente informativos. O par de genótipos (9 e 11) e (5 e 9) foram identificados como os menos dissimilares na população I e população II, respectivamente. O valor de GST (0,079), indicou uma diferenciação genética moderada entre as populações. Para AMOVA, 10 92,86% da variação foram dentro de populações e 7,13% entre populações. Com a análise bayesiana foi possível definir a divisão dos genótipos em dois grupos. O fluxo gênico médio obtido foi de 2,88 sendo considerado alto o suficiente para contrapor os efeitos da deriva genética. Os parâmetros genéticos obtidos geraram informações sobre a variabilidade genética existente, comprovando a importância do Parque Nacional do Caparaó para fins conservacionistas. As amostras de solos analisadas evidenciaram que a fertilidade de ambas populações apresenta-se baixas e com uma acidez elevada Vochysia bifalcata is popularly known as Guaricica, is a tree neotropical species whose survival is threatened due to degradation processes of the natural environment and man operation, considered the threat of state they are in, it is necessary to obtain more detailed information the genetic diversity of natural populations of this species, which is possible from studies with microsatellite markers. In this context, the present study was to evaluate objetvo the genetic diversity of Vochysia bifalcata species and characterize soil fertility in two native populations established in Caparaó National Park, ES. Therefore, leaf samples from 28 adult individuals were collected from two native populations of V. bifalta. For transferability test were tested 8 microsatellite primers developed for Qualea grandiflora and 10 designed to Vochysia ferruginea in the genome of individuals to V. bifalcata. Total genomic DNA was isolated using the Doyle & Doyle protocol (1990) modified. The amplified fragments were separated by electrophoresis on gel polyacrylamide 10% with 1X TBE buffer. Electrophoresis was performed at constant voltage of 100 W for 5 hours. The markers that generate satisfactory amplifications were then used for the studies and genetic diversity of structure in all 28 individuals sampled. We randomly selected six soil sampling points in each population at depths 0-5; 5-10 e 10-20 cm and chemical analyzes were performed using the methodology proposed by EMBRAPA (1997). The heterologous amplification results for V. ferruginea to V. bifalcata were satisfactory, and then used for statistical analysis and Q. grandiflora for V. bifalcata were satisfactory, however proved to be monomorphic. For starters, V. ferruginea the results showed the average occurrence of 4.85 alleles/locus. In both two populations of seven loci analyzed suggested the presence of null alleles, with significant frequency. The allelic richness were similar between the two populations. The average observed heterozygosity for the population I was 0.434 and population II was 0.355, both distinct from the expected to the Hardy-Weinberg equilibrium. The average fixation index for the population I was 0.390 and the population II was 0.328, indicating the presence of inbreeding within populations. The average value of Polymorphic Information Content (PIC) was 0.608 for the population I and 0.566 for the population II and are considered highly informative. The pair of genotypes (9 and 11) and (5 and 9) were identified as the least dissimilar opulations the population I and II, respectively. The amount of GST (0.079) indicated a moderate genetic differentiation among populations. To AMOVA, 92.86% of the variation was within 12 populations and among populations 7.13%. After analyzing the program, STRUCTURE was possible to define the division into two groups of genotypes. The obtained average gene flow was 2.88 being considered high enough to counteract the effects of genetic drift. These data generate important information about the genetic variability, proving the importance of Caparaó National Park for the species conservation. Soil samples analyzed demonstrated that the fertility of both populations are present and a low acidity, the homogeneity of the soil fertility can be explained by the soil and climatic characteristics similar between the two study populations. 2016-08-29T15:37:34Z 2016-07-11 2016-08-29T15:37:34Z 2015-02-26 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis http://repositorio.ufes.br/handle/10/5119 info:eu-repo/semantics/openAccess text Universidade Federal do Espírito Santo Mestrado em Genética e Melhoramento Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento UFES BR reponame:Repositório Institucional da UFES instname:Universidade Federal do Espírito Santo instacron:UFES |