Detecção e caracterização molecular de Picobirnavirus em hospedeiro ovino

• Main Author: Kunz, Andressa Fernanda
• Other Authors: Universidade Federal do Paraná. Setor Palotina. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal
• Format: Others
• Language: Portuguese
• Published: 2017
• Subjects: Ciência Animal
• Online Access: http://hdl.handle.net/1884/50353

Orientadora : Profª. Drª. Elisabete Takiuchi === Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Palotina, Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal. Defesa: Palotina, 28/07/2017 === Inclui referências : f. 55-62 === Resumo: O Picobirnavirus (PBV) constitui um grupo de vírus emergentes pertencente à família Picobirnaviridae. São vírus com capsídeo icosaédrico, genoma formado por dois segmentos de RNA fita dupla, que podem infectar uma ampla gama de hospedeiros. Embora o vírus tenha sido detectado em animais com diarreia, alguns estudos têm sugerido que o PBV não possua uma relação etiológica com a diarreia, mas com diversas condições de imunossupressão que favorecem a replicação e excreção viral. Esse estudo relata a ocorrência de PBV em hospedeiros ovinos a partir de amostras fecais provenientes de um rebanho com aptidão para corte e a caracterização molecular dos isolados. Foram analisadas 100 amostras de fezes representativas de diferentes idades e categorias animais do rebanho. O PBV foi detectado em 5% (5/100) e 62% (62/100) das amostras pelas técnicas eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA) e RT-PCR, respectivamente. Todas as amostras PBV positivas na EGPA apresentaram o perfil "large profile". Os produtos amplificados baseados na sequência parcial do gene RdRp foram caracterizados como genogrupo I do PBV (PBV-GI) após o sequenciamento genômico. A análise filogenética dos seis isolados de PBV ovino detectados neste estudo demonstrou alta heterogeneidade, apresentando maior identidade com PBV isolado de espécies heterólogas, (suínos e dromedário) ou detectado em efluentes de águas residuais urbanas em estações de tratamento. Este é o segundo relato de detecção do PBV em ovinos no mundo e o primeiro a demonstrar a alta prevalência do vírus em um rebanho ovino de exploração econômica, incluindo a caracterização molecular dos isolados. Palavras-chave: Picobirnavírus, ovino, EGPA, RT-PCR. === Abstract: Picobirnavirus (PBV) constitutes a group of emerging viruses belonging to the Family Picobirnaviridae. They are viruses with an icosahedral capsid and a genome formed by two double stranded RNA segments, which can infect a wide range of hosts. Although the virus has already been detected in animals with diarrhea, some studies have suggested that PBV does not have an etiologic relationship with diarrhea, but with several immunosuppressive conditions that favor viral replication and excretion. This study reports the occurrence of PBV in sheep hosts from fecal samples from a herd with meat production and the molecular characterization of the isolates. A hundred representative stool samples of different ages and animal categories of the herd were analyzed. PBV was detected in 5% (5/100) and 62% (62/100) of the samples by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and RT-PCR, respectively. All PBV positive samples in PAGE presented the "large" profile. Amplified products based on the partial sequence of the RdRp gene were characterized as PBV genogroup I (PBV-GI) after genomic sequencing. The phylogenetic analysis of the six isolates of ovine PBV detected in this study demonstrated high heterogeneity, presenting a higher identity with PBV isolated from heterologous species (swine and dromedary) or detected in urban wastewater in treatment plants. This is the second report of detection of PBV in sheep in the world and the first to demonstrate the high prevalence of the virus in a sheep herd of economic exploitation, including the molecular characterization of the isolates. Keywords: Picobirnavirus, sheep, PAGE, RT-PCR.