Definição de visões em um lims orientado a fluxo de trabalho para gerenciamento de dados e processos laboratoriais

• Main Author: Cristiano Santos Botelho
• Other Authors: Sergio Vale Aguiar Campos
• Format: Others
• Language: Portuguese
• Published: Universidade Federal de Minas Gerais 2014
• Online Access: http://hdl.handle.net/1843/ESBF-8XFM6F

=== The use of information technology to automate process of biomedicine and biochemistry research and others result in a very large amount of data. Currently, the major challenge is the efficient and accurate storage and management of data. Thus, it is common to use Laboratory Information Management Systems (LIMS) to accomplish those tasks. Usally the available LIMS have its operations restricted to a specific area. In the other hand, SIGLa LIMS garantees flexibility because it is based on workflows which are modeled in the Together Workflow Editor tool. The system SIGLa was upgrated to another system, Flux, which is workflow based too. These systems can aggregate different views as part of its code. Views are different forms of seeing the set of data stored in order to run complementary tasks to those provided in the experiment execution. The Flux LIMS that is adaptable to different laboratories was adapted with views. These views are Raw Material Control, Scheduling and Input and Output. The Raw Material Control view allows the definition of four kind of workflows: cadastre, prepare and visualization of raw material and cadastre of prescription. With these types of workflows it is possible the management of all raw materials needed for performing an experiment in laboratory. The Scheduling view aims to allow mechanisms of warning and scheduling the activity execution. And the Inputs and Outputs view defines the use of atomic and non-atomic inputs and outputs and their tracking. As model of application of these views, there is the FluxTransgenics LIMS that manages all data and process of the laboratory of production of Genetically Modified Organisms (OMS) at Embrapa Milho e Sorgo (MG-Brazil). Keywords: LIMS, Workflow, Bioinformatics, Transgenics . . === O uso da tecnologia da informação para automatizar os procedimentos em pesquisas na área da biomedicina, bioquímica e outras resulta em uma quantidade de dados muito grande. Atualmente, o grande desafio é o armazenamento e gerenciamento desses dados de maneira eficiente e precisa. Assim, é comum o uso de Sistemas Gerenciadores de Informações de Laboratórios (LIMS) para cumprir essas tarefas. Esses sistemas podem incluir visões diferentes como parte de seu código. Visões são maneiras diferentes de se enxergar o conjunto de dados armazenados com o propósito de efetuar tarefas complementares às previstas na execução dos experimentos. O LIMS Flux, que é adaptável a diferentes laboratórios, foi adaptado com visões. Essas visões são Controle de Insumos, Agendamento e Entradas e Saídas. Como resultado do desenvolvimento dessas visões, tem-se o LIMS FluxTransgenics que gerencia todos os dados e processos do laboratório de produção de transgênicos da EMBRAPA Milho e Sorgo (MG - Brasil).