Características microbiológicas de cepas de Acinetobacter baumannii resistentes ao imipenem isoladas de pacientes internados em Unidade de Terapia Intensiva, e descrição clínico-epidemiológica dos portadores

=== The increasing frequency of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii (CRAB) represents a clinical and epidemiological challenging, with demands better understanding of this pathogen. Areas of special interest are A. baumannii resistance mechanisms and potencial alternatives to antimicrobial...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Francelli Aparecida Cordeiro Neves
Other Authors: Vandack Alencar Nobre Junior
Format: Others
Language:Portuguese
Published: Universidade Federal de Minas Gerais 2012
Online Access:http://hdl.handle.net/1843/BUBD-9UHJDL
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sources NDLTD
description === The increasing frequency of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii (CRAB) represents a clinical and epidemiological challenging, with demands better understanding of this pathogen. Areas of special interest are A. baumannii resistance mechanisms and potencial alternatives to antimicrobial treatment, as well as, the dissemination routes of this bacteria. Over the last 20 years, the improvement of molecular techniques brought a greater comprehension about the phenomenon of resistance acquisition and clonal distribution of A. baumannii. This study aimed to assess the enzymatic mechanisms involved in the carbapenem resistance presented by A. baumannii, and the genetic similarity pattern of CRAB strains, isolated from 56 patients attending a medical and coronary intensive care unit. Additionally, the clinical and epidemiological characteristics of this population were described. This was a cross-sectional study, involving 56 patients colonized or infected by CRAB strains, admitted in one of the intensive care of a university hospital, between December 2009 and December 2010. According to a protocol of the Infectious Diseases Service of our hospital, the strains of CRAB included in this study were conserved in temperature of -20 degree since the time of its original identification. 43 (76.8%) out of the 56 were recovered and underwent further microbiological phenotypic and genotypic studies. As results, the mean age of the 56 patients was 61 years (SD: ±15.1), and 58.9% were male. The main reason for ICU admission was medical condition (71.4%), and infection was the most frequent diagnosis (66.1%). The majority of patients (80.4%) had risk factors for CRAB colonization, predominantly use of invasive devices (87.5%) and previous antibiotics therapy (77.6%). From the 56 isolates, 70% represented were colonization by CRAB. The median APACHE II score at ICU admission was 15 (1-32), and the hospital mortality was 59.0%. Among the 56 CRAB strains studied, 43 (76.8%) were evaluated by quantitative ST (susceptibility test) for imipenem, tigecycline and polymyxin B), expression of metallo--lactamases, expression of oxacilinases and clonal distribution by ERIC-PCR. Resistance to imipenem (MIC 16g/ml) by agar dilution method was confirmed in 25 (58.1%) of the 43 strains evaluated. Ten (23.3%) strains were resistant to tigecycline (MIC> 2g/ml) and three were resistant to polymyxin B (MIC 4g/ml). The 43 strains were blaOXA-51 gene, confirming its identification as Acinetobacter baumannii, 22 (51.2%) carried blaOXA-23 gene, 8 (18.6%) and expressed blaOXA-143 gene. 14 (82.4%) out of the 17 isolates susceptible to imipenem by agar dilution method did not express any of the enzymes studied. None of the strains studied showed the presence of metallo--lactamases. The ERIC-PCR identified 15 distinct clones of Acinetobacter baumannii with predominance of six clusters, based on 90% similarity. Top sum up, we concluded that: (i) the studied patients had moderate clinical severity score, and had a high prevalence of risk factors for colonization or infection by CRAB strains; (ii) CRAB strains studied showed predominantly multidrug resistance pattern, with the prevalence of polymyxin B resistance was high; (iii) as suggested in some others studies, the expression of metallo--lactamases is not a common resistance mechanism of CRAB strains in Brazil, while most strains showed blaOXA-23 gene, and some carried blaOXA-143 gene (iv) the genetic pattern of these endemic strains was polyclonal. === Considerando-se a crescente frequência do isolamento de cepas de Acinetobacter baumannii resistente aos carbapenêmicos (CRAB) e a sua relevância clínico-epidemiológica, torna-se necessário um melhor conhecimento do perfil de susceptibilidade desse patógeno, visando estabelecer alternativas aos esquemas convencionais de tratamento, elucidar mecanismos de resistência e compreender a disseminação dessas cepas no ambiente hospitalar. Na última década, com o avanço das técnicas moleculares, houve maior entendimento do fenômeno de aquisição de resistência e da sua distribuição clonal. Esse estudo teve como objetivo o de avaliar mecanismos enzimáticos envolvidos na resistência aos carbapenêmicos e o padrão de similaridade gênica de cepas CRAB oriundas de pacientes internados em uma Unidade de Terapia Intensiva, descrevendo as características clínico-epidemiológicas dessa população. Para tal, entre dezembro de 2009 a dezembro de 2010, 56 cepas de CRAB (resistência definida mediante método de Kirby-Bauer) provenientes de 56 pacientes foram incluídas no estudo. Descreveram-se as características clínico-epidemiológicas dos mesmos. Quarenta e três (76,8%) dentre as 56 cepas foram estudadas quanto ao perfil de susceptibilidade quantitativo ao imipenem, tigeciclina e polimixina B, submetidas à pesquisa de metalo--lactamases e de oxacilinases, e avaliadas quanto ao padrão de distribuição clonal comum. Como resultados, observou-se que a idade média dos 56 pacientes foi de 61 anos (DP: ±15,1), e que 58,9% deles eram do sexo masculino. As patologias clínicas foram os principais motivos de admissão na UTI (71,4%), sendo infecção o diagnóstico mais frequente (66,1%). A maioria dos pacientes apresentou fatores de risco para colonização por CRAB (80,4%), sendo a utilização de procedimentos invasivos (87,5%) e antibioticoterapia prévia (77,6%) os mais frequentes. Cerca de 70% dos pacientes apresentaram apenas colonização por CRAB. A mediana de APACHE II à admissão na UTI foi 15 (1 32), e a mortalidade hospitalar foi de 59,0%. Das 43 cepas estudadas, 25 (58,1%) foram confirmadas como resistentes ao imipenem (CIM 16 g/mL) pelos testes quantitativos. Dez (23,3%) cepas também apresentaram resistência a tigeciclina (CIM > 2g/mL) e três (7%) foram resistentes à polimixina (CIM 4g/mL). As 43 cepas apresentaram gene blaOXA-51, confirmando a identificação da espécie como Acinetobacter baumannii, 22 (51,2%) carreavam o gene blaOXA-23 e oito (18,6%) expressavam o gene blaOXA-143. Dentre as 17 cepas sensíveis ao imipenem pela diluição em ágar, 14 (82,4%) não expressavam nenhuma das enzimas pesquisadas. Em nenhuma das cepas foi identificada a presença de metalo--lactamases. Através do ERIC-PCR foram identificados 15 clones distintos de Acinetobacter baumannii com predomínio de seis clusters, tendo como base 90% de similaridade. A partir dos dados apresentados, conclui-se que: (i) os pacientes estudados tinham gravidade moderada, e apresentavam elevada prevalência de fatores de risco para colonização /infecção por cepas CRAB; (ii) as cepas CRAB estudadas mostraram-se predominantemente multirresitentes a antibióticos, havendo frequência elevada de resistência à polimixina; (iii) conforme sugerido em outros estudos, a expressão de metalo--lactamases não representa mecanismo comum de resistência de cepas CRAB no Brasil, ao passo que a maioria das cepas apresentou gene blaOXA-23, e algumas delas apresentaram OXA143, uma oxacilinase recentemente descrita; e (iv) o padrão endêmico das cepas é policlonal.
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This study aimed to assess the enzymatic mechanisms involved in the carbapenem resistance presented by A. baumannii, and the genetic similarity pattern of CRAB strains, isolated from 56 patients attending a medical and coronary intensive care unit. Additionally, the clinical and epidemiological characteristics of this population were described. This was a cross-sectional study, involving 56 patients colonized or infected by CRAB strains, admitted in one of the intensive care of a university hospital, between December 2009 and December 2010. According to a protocol of the Infectious Diseases Service of our hospital, the strains of CRAB included in this study were conserved in temperature of -20 degree since the time of its original identification. 43 (76.8%) out of the 56 were recovered and underwent further microbiological phenotypic and genotypic studies. As results, the mean age of the 56 patients was 61 years (SD: ±15.1), and 58.9% were male. The main reason for ICU admission was medical condition (71.4%), and infection was the most frequent diagnosis (66.1%). The majority of patients (80.4%) had risk factors for CRAB colonization, predominantly use of invasive devices (87.5%) and previous antibiotics therapy (77.6%). From the 56 isolates, 70% represented were colonization by CRAB. The median APACHE II score at ICU admission was 15 (1-32), and the hospital mortality was 59.0%. Among the 56 CRAB strains studied, 43 (76.8%) were evaluated by quantitative ST (susceptibility test) for imipenem, tigecycline and polymyxin B), expression of metallo--lactamases, expression of oxacilinases and clonal distribution by ERIC-PCR. Resistance to imipenem (MIC 16g/ml) by agar dilution method was confirmed in 25 (58.1%) of the 43 strains evaluated. Ten (23.3%) strains were resistant to tigecycline (MIC> 2g/ml) and three were resistant to polymyxin B (MIC 4g/ml). The 43 strains were blaOXA-51 gene, confirming its identification as Acinetobacter baumannii, 22 (51.2%) carried blaOXA-23 gene, 8 (18.6%) and expressed blaOXA-143 gene. 14 (82.4%) out of the 17 isolates susceptible to imipenem by agar dilution method did not express any of the enzymes studied. None of the strains studied showed the presence of metallo--lactamases. The ERIC-PCR identified 15 distinct clones of Acinetobacter baumannii with predominance of six clusters, based on 90% similarity. Top sum up, we concluded that: (i) the studied patients had moderate clinical severity score, and had a high prevalence of risk factors for colonization or infection by CRAB strains; (ii) CRAB strains studied showed predominantly multidrug resistance pattern, with the prevalence of polymyxin B resistance was high; (iii) as suggested in some others studies, the expression of metallo--lactamases is not a common resistance mechanism of CRAB strains in Brazil, while most strains showed blaOXA-23 gene, and some carried blaOXA-143 gene (iv) the genetic pattern of these endemic strains was polyclonal. Considerando-se a crescente frequência do isolamento de cepas de Acinetobacter baumannii resistente aos carbapenêmicos (CRAB) e a sua relevância clínico-epidemiológica, torna-se necessário um melhor conhecimento do perfil de susceptibilidade desse patógeno, visando estabelecer alternativas aos esquemas convencionais de tratamento, elucidar mecanismos de resistência e compreender a disseminação dessas cepas no ambiente hospitalar. Na última década, com o avanço das técnicas moleculares, houve maior entendimento do fenômeno de aquisição de resistência e da sua distribuição clonal. Esse estudo teve como objetivo o de avaliar mecanismos enzimáticos envolvidos na resistência aos carbapenêmicos e o padrão de similaridade gênica de cepas CRAB oriundas de pacientes internados em uma Unidade de Terapia Intensiva, descrevendo as características clínico-epidemiológicas dessa população. Para tal, entre dezembro de 2009 a dezembro de 2010, 56 cepas de CRAB (resistência definida mediante método de Kirby-Bauer) provenientes de 56 pacientes foram incluídas no estudo. Descreveram-se as características clínico-epidemiológicas dos mesmos. Quarenta e três (76,8%) dentre as 56 cepas foram estudadas quanto ao perfil de susceptibilidade quantitativo ao imipenem, tigeciclina e polimixina B, submetidas à pesquisa de metalo--lactamases e de oxacilinases, e avaliadas quanto ao padrão de distribuição clonal comum. Como resultados, observou-se que a idade média dos 56 pacientes foi de 61 anos (DP: ±15,1), e que 58,9% deles eram do sexo masculino. As patologias clínicas foram os principais motivos de admissão na UTI (71,4%), sendo infecção o diagnóstico mais frequente (66,1%). A maioria dos pacientes apresentou fatores de risco para colonização por CRAB (80,4%), sendo a utilização de procedimentos invasivos (87,5%) e antibioticoterapia prévia (77,6%) os mais frequentes. Cerca de 70% dos pacientes apresentaram apenas colonização por CRAB. A mediana de APACHE II à admissão na UTI foi 15 (1 32), e a mortalidade hospitalar foi de 59,0%. Das 43 cepas estudadas, 25 (58,1%) foram confirmadas como resistentes ao imipenem (CIM 16 g/mL) pelos testes quantitativos. Dez (23,3%) cepas também apresentaram resistência a tigeciclina (CIM > 2g/mL) e três (7%) foram resistentes à polimixina (CIM 4g/mL). As 43 cepas apresentaram gene blaOXA-51, confirmando a identificação da espécie como Acinetobacter baumannii, 22 (51,2%) carreavam o gene blaOXA-23 e oito (18,6%) expressavam o gene blaOXA-143. Dentre as 17 cepas sensíveis ao imipenem pela diluição em ágar, 14 (82,4%) não expressavam nenhuma das enzimas pesquisadas. Em nenhuma das cepas foi identificada a presença de metalo--lactamases. Através do ERIC-PCR foram identificados 15 clones distintos de Acinetobacter baumannii com predomínio de seis clusters, tendo como base 90% de similaridade. A partir dos dados apresentados, conclui-se que: (i) os pacientes estudados tinham gravidade moderada, e apresentavam elevada prevalência de fatores de risco para colonização /infecção por cepas CRAB; (ii) as cepas CRAB estudadas mostraram-se predominantemente multirresitentes a antibióticos, havendo frequência elevada de resistência à polimixina; (iii) conforme sugerido em outros estudos, a expressão de metalo--lactamases não representa mecanismo comum de resistência de cepas CRAB no Brasil, ao passo que a maioria das cepas apresentou gene blaOXA-23, e algumas delas apresentaram OXA143, uma oxacilinase recentemente descrita; e (iv) o padrão endêmico das cepas é policlonal. 2012-04-09 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis http://hdl.handle.net/1843/BUBD-9UHJDL por info:eu-repo/semantics/openAccess text/html Universidade Federal de Minas Gerais 32001010023P0 - MEDICINA (MEDICINA TROPICAL) UFMG BR reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFMG instname:Universidade Federal de Minas Gerais instacron:UFMG