Diversidade e estrutura genética populacional em luehea divaricata mart. & zucc. na região da fronteira oeste do Rio Grande do Sul, baseada em marcadores microssatélites

Submitted by Francine Silva (francine.silva@unipampa.edu.br) on 2019-03-28T18:51:45Z No. of bitstreams: 1 Diversidade e estrutura genética populacional em luehea divaricata mart. & zucc. na região da fronteira oeste do Rio Grande do Sul, baseada em marcadores microssatélites.pdf: 1894891 bytes,...

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Bibliographic Details
Main Author: Jordana Caroline Nagel
Other Authors: Stefenon, Valdir Marcos
Language:Portuguese
Published: Universidade Federal do Pampa 2019
Subjects:
Online Access:http://dspace.unipampa.edu.br:8080/jspui/handle/riu/3881
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topic CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Açoita-cavalo
Genética de populações
Marcadores moleculares
Bioma Pampa
Ecologia molecular
Population genetics
Molecular markers
Pampa Biome
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Jordana Caroline Nagel
Diversidade e estrutura genética populacional em luehea divaricata mart. & zucc. na região da fronteira oeste do Rio Grande do Sul, baseada em marcadores microssatélites
description Submitted by Francine Silva (francine.silva@unipampa.edu.br) on 2019-03-28T18:51:45Z No. of bitstreams: 1 Diversidade e estrutura genética populacional em luehea divaricata mart. & zucc. na região da fronteira oeste do Rio Grande do Sul, baseada em marcadores microssatélites.pdf: 1894891 bytes, checksum: 4bdf370c0584966a24bc7d1c50440ac3 (MD5) === Made available in DSpace on 2019-03-28T18:51:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Diversidade e estrutura genética populacional em luehea divaricata mart. & zucc. na região da fronteira oeste do Rio Grande do Sul, baseada em marcadores microssatélites.pdf: 1894891 bytes, checksum: 4bdf370c0584966a24bc7d1c50440ac3 (MD5) Previous issue date: 2013-02-26 === Pertencente à família Malvaceae, o Açoita-cavalo (Luehea divaricata) é uma espécie florestal que ocorre naturalmente desde o Rio Grande do Sul até o sul da Bahia, sendo muito utilizada na confecção de móveis e, também, como fitoterápico. Por ser uma espécie pioneira de rápido crescimento, característica das florestas aluviais, apresenta, em condições de regeneração natural, uma grande quantidade de indivíduos, mostrando ser uma espécie recomendável para a regeneração natural de áreas degradadas. O Açoita-cavalo é uma das espécies nativas mais importantes do ponto de vista fitossociológico, ocorrendo em praticamente todas as bacias hidrográficas do Rio Grande do Sul, na floresta ombrófila mista, na floresta estacional decidual, na floresta estacional semidecidual, na savana, na savana estépica e nas áreas de tensão ecológicas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade e estrutura genética de cinco populações naturais de L. divaricata na região da Fronteira Oeste do Rio Grande do Sul, no bioma Pampa. Amostras foliares foram coletadas de indivíduos adultos encontrados nas áreas (n=128). O DNA foi extraído com o kit Invisorb Spin Plant Mini Kit (Invitek) e cinco loci microssatélites foram amplificados via PCR. Os alelos foram resolvidos em gel de poliacrilamida (a 10%) e os dados, analisados com auxílio do programa GenAlEx 6.4, FSTAT 2.9.3 e ARLEQUIN 3.1. Os resultados indicaram altos níveis de diversidade genética dentro das populações. A heterozigosidade esperada (He) e o índice de Shannon (I) foram de 0.627 e 1.223, respectivamente. A análise AMOVA mostrou que a maior parte da diversidade genética ocorre dentro das populações (76.12%). O índice de fixação nas populações estudadas demonstrou haver excesso de homozigotos em relação ao equilíbrio de Hardy-Weinberg. Os valores da distância genética de Nei indicaram alta divergência genética entre as populações, em função da baixa eficiência do fluxo gênico entre as populações. Os valores obtidos indicaram que o fluxo gênico está próximo do suficiente para prevenir a diferenciação populacional devido à deriva genética nas populações estudadas, e esse fluxo, deve ocorrer, principalmente, via pólen (por entomofilia), dado que a dispersão das sementes (por anemocoria) teoricamente alcançaria maiores distâncias. Essa baixa dispersão de sementes se deve, provavelmente, à fragmentação e consequente isolamento entre as populações estudadas. Estes resultados sugerem quea dispersão de propágulos reprodutivosem duas, das cinco populações, de certa forma é eficiente, poisapresentaram baixo grau de endogamia. Assim, programas de conservação dos recursos genéticos desta espécie tendem a ser efetivos se o fluxo de polinizadores for mantido,e,pela criação de corredores ecológicos para a conservação da conectividade entre os fragmentos. Além disso, os dados obtidos mostram que as populações estudadasdevem ser priorizadas em programas de conservação genéticada espécie,devido à alta diversidade genética observada,e,ao nível de fragmentação das áreas de remanescentes florestais na região do Pampa. === Belonging to the family Malvaceae, the Açoita-cavalo (Luehea divaricata) is a forest species that occurs naturally from the Rio Grande do Sul State to Bahia State, largely employed in the furniture manufacturing and as medicinal plant. It is a fast-growing pioneer species, characteristic of riparian forests, it presents in natural regeneration conditions, a large quantity of individuals, being indicated for the natural recovery of degraded areas. The açoita-cavalo is one of the most important native species for the phytosociology, occurring virtually in all hydrographical components of the Rio Grande do Sul, in the mixed ombrophylous forest, seasonal deciduous forest, seasonal semidecidual forest, savanna, stepic-savanna and in areas of ecological tension. This study aimed to characterize the genetic diversity and structure of five natural populations of L. divaricata in the region of “Fronteira Oeste” in the Rio Grande do Sul State, within the Pampa biome. Leave samples were collected from adult individuals found in the areas (n=128). DNA was isolated using the Invisorb Plant Mini Kit (Invitek) and five microsatellite loci were amplified through PCR. The alleles were resolved in polyacrylamide gels (10%) and the data analyzed with the software GenAlEx 6.4, FSTAT 2.9.3 e ARLEQUIN 3.1. The results revealed high levels of genetic diversity within the populations. The expected heterozigosity (He) and the Shannon index (I) equaled 0.627 and 1.223, respectively. The AMOVA analysis revealed that the larger amount of the genetic diversity occurs within the populations (76.12%). The fixation index in the studied populations presented an excess of homozygotes in respect of the Hardy-Weinberg equilibrium The values of the Nei’s genetic distance point to high genetic divergence among the populations, consequence of the low efficiency of the gene flow among populations. The results indicate that gene flow is close enough to prevent population differentiation due to genetic drift in the populations studied, and this flow should occur mainly through pollen (by entomophily), since the seed dispersion (by anemocory), theoretically reaches longer distances. This low level of seed dispersion likely is due to the fragmentation and consequent isolation of the studied populations. These results suggest that the dispersal of reproductive propagules in two of the five populations in some ways is efficient because it presented low inbreeding. Thus, programs of genetic resources conservation of this species may be more efficient by maintaining the flow of pollinators, and the creation of ecological corridors for the conservation of connectivity between fragments. In addition, the obtained data reveals that the studied populations should be prioritized in programs of species genetic conservation, due to the relatively high level genetic diversity observed and the level of fragmentation of the areas of forest remnants in the Pampa region.
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Jordana Caroline Nagel
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No. of bitstreams: 1 Diversidade e estrutura genética populacional em luehea divaricata mart. & zucc. na região da fronteira oeste do Rio Grande do Sul, baseada em marcadores microssatélites.pdf: 1894891 bytes, checksum: 4bdf370c0584966a24bc7d1c50440ac3 (MD5) Previous issue date: 2013-02-26 Pertencente à família Malvaceae, o Açoita-cavalo (Luehea divaricata) é uma espécie florestal que ocorre naturalmente desde o Rio Grande do Sul até o sul da Bahia, sendo muito utilizada na confecção de móveis e, também, como fitoterápico. Por ser uma espécie pioneira de rápido crescimento, característica das florestas aluviais, apresenta, em condições de regeneração natural, uma grande quantidade de indivíduos, mostrando ser uma espécie recomendável para a regeneração natural de áreas degradadas. O Açoita-cavalo é uma das espécies nativas mais importantes do ponto de vista fitossociológico, ocorrendo em praticamente todas as bacias hidrográficas do Rio Grande do Sul, na floresta ombrófila mista, na floresta estacional decidual, na floresta estacional semidecidual, na savana, na savana estépica e nas áreas de tensão ecológicas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade e estrutura genética de cinco populações naturais de L. divaricata na região da Fronteira Oeste do Rio Grande do Sul, no bioma Pampa. Amostras foliares foram coletadas de indivíduos adultos encontrados nas áreas (n=128). O DNA foi extraído com o kit Invisorb Spin Plant Mini Kit (Invitek) e cinco loci microssatélites foram amplificados via PCR. Os alelos foram resolvidos em gel de poliacrilamida (a 10%) e os dados, analisados com auxílio do programa GenAlEx 6.4, FSTAT 2.9.3 e ARLEQUIN 3.1. Os resultados indicaram altos níveis de diversidade genética dentro das populações. A heterozigosidade esperada (He) e o índice de Shannon (I) foram de 0.627 e 1.223, respectivamente. A análise AMOVA mostrou que a maior parte da diversidade genética ocorre dentro das populações (76.12%). O índice de fixação nas populações estudadas demonstrou haver excesso de homozigotos em relação ao equilíbrio de Hardy-Weinberg. Os valores da distância genética de Nei indicaram alta divergência genética entre as populações, em função da baixa eficiência do fluxo gênico entre as populações. Os valores obtidos indicaram que o fluxo gênico está próximo do suficiente para prevenir a diferenciação populacional devido à deriva genética nas populações estudadas, e esse fluxo, deve ocorrer, principalmente, via pólen (por entomofilia), dado que a dispersão das sementes (por anemocoria) teoricamente alcançaria maiores distâncias. Essa baixa dispersão de sementes se deve, provavelmente, à fragmentação e consequente isolamento entre as populações estudadas. Estes resultados sugerem quea dispersão de propágulos reprodutivosem duas, das cinco populações, de certa forma é eficiente, poisapresentaram baixo grau de endogamia. Assim, programas de conservação dos recursos genéticos desta espécie tendem a ser efetivos se o fluxo de polinizadores for mantido,e,pela criação de corredores ecológicos para a conservação da conectividade entre os fragmentos. Além disso, os dados obtidos mostram que as populações estudadasdevem ser priorizadas em programas de conservação genéticada espécie,devido à alta diversidade genética observada,e,ao nível de fragmentação das áreas de remanescentes florestais na região do Pampa. Belonging to the family Malvaceae, the Açoita-cavalo (Luehea divaricata) is a forest species that occurs naturally from the Rio Grande do Sul State to Bahia State, largely employed in the furniture manufacturing and as medicinal plant. It is a fast-growing pioneer species, characteristic of riparian forests, it presents in natural regeneration conditions, a large quantity of individuals, being indicated for the natural recovery of degraded areas. The açoita-cavalo is one of the most important native species for the phytosociology, occurring virtually in all hydrographical components of the Rio Grande do Sul, in the mixed ombrophylous forest, seasonal deciduous forest, seasonal semidecidual forest, savanna, stepic-savanna and in areas of ecological tension. This study aimed to characterize the genetic diversity and structure of five natural populations of L. divaricata in the region of “Fronteira Oeste” in the Rio Grande do Sul State, within the Pampa biome. Leave samples were collected from adult individuals found in the areas (n=128). DNA was isolated using the Invisorb Plant Mini Kit (Invitek) and five microsatellite loci were amplified through PCR. The alleles were resolved in polyacrylamide gels (10%) and the data analyzed with the software GenAlEx 6.4, FSTAT 2.9.3 e ARLEQUIN 3.1. The results revealed high levels of genetic diversity within the populations. The expected heterozigosity (He) and the Shannon index (I) equaled 0.627 and 1.223, respectively. The AMOVA analysis revealed that the larger amount of the genetic diversity occurs within the populations (76.12%). The fixation index in the studied populations presented an excess of homozygotes in respect of the Hardy-Weinberg equilibrium The values of the Nei’s genetic distance point to high genetic divergence among the populations, consequence of the low efficiency of the gene flow among populations. The results indicate that gene flow is close enough to prevent population differentiation due to genetic drift in the populations studied, and this flow should occur mainly through pollen (by entomophily), since the seed dispersion (by anemocory), theoretically reaches longer distances. This low level of seed dispersion likely is due to the fragmentation and consequent isolation of the studied populations. These results suggest that the dispersal of reproductive propagules in two of the five populations in some ways is efficient because it presented low inbreeding. Thus, programs of genetic resources conservation of this species may be more efficient by maintaining the flow of pollinators, and the creation of ecological corridors for the conservation of connectivity between fragments. In addition, the obtained data reveals that the studied populations should be prioritized in programs of species genetic conservation, due to the relatively high level genetic diversity observed and the level of fragmentation of the areas of forest remnants in the Pampa region. 2019-03-28T18:51:45Z 2013-03-18 2019-03-28T18:51:45Z 2013-02-26 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/masterThesis NAGEL, Jordana Caroline. Diversidade e estrutura genética populacional em luehea divaricata mart. & zucc. na região da fronteira oeste do Rio Grande do Sul, baseada em marcadores microssatélites. 2013. 62 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Ciências Biológicas.). Universidade Federal do Pampa, Campus São Gabriel. São Gabriel, 2013. http://dspace.unipampa.edu.br:8080/jspui/handle/riu/3881 por info:eu-repo/semantics/openAccess Universidade Federal do Pampa Mestrado Acadêmico em Ciências Biológicas UNIPAMPA Brasil Campus São Gabriel reponame:Repositório Institucional da UNIPAMPA instname:Universidade Federal do Pampa instacron:UNIPAMPA