Applications de la spectrométrie de masse type MALDI-TOF à la bactériologie et à la distinction de variants génétiques

• Main Author: Moussaoui, Louardi
• Language: fra
• Published: Université de Strasbourg 2012
• Subjects: [SDV:SA] Life Sciences/Agricultural sciences; [SDV:SA] Sciences du Vivant/Sciences agricoles; [SDV:MHEP] Life Sciences/Human health and pathology; [SDV:MHEP] Sciences du Vivant/Médecine humaine et pathologie; Spectrométrie de masse; MALDI-TOF; Bactériologie; Hémocultures; Typage bactérien; Identification bactérienne; Epidémiologie; MALDIBiotyperTM; Microorganismes
• Online Access: http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00872251; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/87/22/51/PDF/Moussaoui_Louardi_2012_ED414.pdf

L'objectif de mon travail fut de valider et d'optimiser la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF pour l'identification et la classification d'un ensemble de bactéries pathogènes ou opportunistes chez l'homme, en enrichissant une base de données et en testant la robustesse de la méthode, afin d'obtenir une méthode rapide fixe et fiable d'acquisition de résultats. Les différents résultats obtenus ont permis la validation de la technique comme outil d'identification bactérienne fiable en routine. Elle permet désormais de caractériser les mélanges de deux bactéries voir même la différentiation d'espèces très proches comme les Shigella spp et E. coli. Nous avons montré que la technique sera encore améliorée par un outil supplémentaire de comparaison des souches pour une veille épidémiologique "en temps réel", sans investissement supplémentaire, en permettant plusieurs types d'économie. Elle apporte un gain réel dans la prise en charge du patient et le choix éclairé des antibiotiques testés pour l'antibiogramme. La technique peut aussi constituer un outil alternatif de sérotypage.