Nouvelles perspectives pour comprendre la reconnaissance des défauts d'empaquetage lipidique par le senseur de courbure membranaire ALPS (Amphipathic Lipid Packing Sensor)

• Main Author: Gonzalez-Rubio Garrido, Paula
• Language: ENG
• Published: Université Pierre et Marie Curie - Paris VI 2009
• Subjects: [SDV:GEN] Life Sciences/Genetics; Dynamique Moléculaire; Hélices amphipathiques; Senseur de courbure; Défauts d'empaquetage lipidique; ALPS; Courbure membranaire; ArfGAP1; Membrane simulations
• Online Access: http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00813418; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/81/34/18/PDF/These-Paula_GonzalzRubio-Garrido.pdf.pdf

Des motifs structuraux largement impliqués dans les processus de modulation de la courbure membranaire sont les hélices amphipathiques. Parmi eux, un senseur de la courbure exhibant des propriétés particulières a été identifiée récemment : ALPS (ArfGAP1 Amphipathic lipid packing sensor). Il a été montré que son interaction avec la membrane était indépendante des charges Žlectrostatiques En effet, le modèle actuel suggère que les résidus hydrophobes soient les responsables de l'ancrage d'ALPS ˆ la membrane en reconaissant les défauts d'empaquetage lipidique. Par simulations par dynamique moléculaire des différentes membranes lipidiques avec le motif ALPS, nous montrons que ce senseur exhibe une considérable liberté conformationnelle et structurelle qui l'habilitent ˆ explorer les défauts d'empaquetage aux niveaux des têtes polaires ainsi qu'au niveau des chaînes aliphatiques. Nous proposons des nouvelles perspectives au niveau atomique de la reconnaissance des défauts d'empaquetage lipidique par ALPS o la déformabilité et flexibilité structurale ainsi que les propriétés dynamiques et physiques de la membrane jouent un r™le prépondérant.