Les interactions gène-environnement dans les études génétiques des maladies complexes

• Main Author: Kazma, Rémi
• Language: FRE
• Published: Université Paris Sud - Paris XI 2010
• Subjects: [SDV] Life Sciences; interaction gène-environnement; génétique statistique; développement méthodologique; puissance statistique; biais de confusion; agrégation familiale; régression logistique multinomiale; étude d'association pangénomique; témoins de référence; diabète de type 2; Réactions cutanées sévères secondaire à un médicament
• Online Access: http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00502881; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/50/28/81/PDF/2010_THESE_KAZMA_ED420.pdf

Les maladies humaines les plus fréquentes sont complexes avec plusieurs facteurs génétiques et environnementaux qui interagissent. Ce travail propose deux nouvelles méthodes statistiques pour étudier les interactions gène-environnement. La première méthode utilise la récurrence familiale de la maladie pour identifier une interaction entre un facteur environnemental et la composante génétique impliquée dans la maladie. La seconde méthode permet de prendre en compte ces interactions dans les études d'associations pangénomiques lorsque l'information sur le facteur d'exposition n'est pas disponible chez les témoins. Cette situation est devenue fréquente avec l'utilisation de panels de témoins de référence. Ces deux méthodes apportent de nouveaux outils pour étudier simultanément les facteurs génétiques et environnementaux dans les maladies complexes. Elles ont été appliquées sur deux jeux de données concernant le diabète de type 2 et les réactions cutanées sévères aux médicaments.