Localisation d'énergie dans les protéines

• Main Author: Juanico, Brice
• Language: FRE
• Published: Ecole normale supérieure de lyon - ENS LYON 2007
• Subjects: [PHYS] Physics; potentiel FPU; breather chaotique; modes normaux; protéine; citrate synthase; sites catalytiques; résidu rigide
• Online Access: http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00266351; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/26/63/51/PDF/these.pdf

Afin de mettre en évidence le phénomène de localisation d'énergie dans les protéines, un modèle utilisant les concepts de la Physique non-linéaire a été développé. Il permet, via l'utilisation d'un potentiel de type FPU et d'une dissipation placée sur la surface, de faire apparaître des breathers chaotiques dans certaines enzymes. Ces breathers ont une durée de vie importante par rapport aux échelles de temps caractéristiques du système. Ils sont localisés sur un seul résidu, toujours situé dans une région rigide de la protéine. Cela nous a conduit à l'hypothèse d'un lien possible entre la fonction catalytique, les propriétés locales de structure des enzymes et les localisations d'énergie. Plus précisément, l'activation d'un breather chaotique lors d'une réaction enzymatique au niveau des sites catalytiques pourrait permettre à la protéine de stocker de l'énergie pendant de longues durées.