Remodelage de la chromatine et transcription : Étude d'un mutant du complexe RSC chez la levure Saccharomyces cerevisiae

• Main Author: Bordas-Le Floch, Véronique
• Language: FRE
• Published: INAPG (AgroParisTech) 2002
• Subjects: [SDV:OT] Life Sciences/Other; ARN polymérases; chromatine; transcription; transcriptome; puces à ADN; remodelage de la chromatine; RSC; Saccharomyces cerevisiae
• Online Access: http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00005672; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/04/66/17/PDF/tel-00005672.pdf; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/04/66/17/ANNEX/figures1.zip; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/04/66/17/ANNEX/figures25.zip; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/04/66/17/ANNEX/figures31-41-44.zip; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/04/66/17/ANNEX/tableaux.zip; http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/04/66/17/ANNEX/tel-00005672.rtf.zip

L'ADN est condensé dans le noyau sous forme de chromatine. La structure chromatinienne de l'ADN est un obstacle pour la transcription car elle limite l'accessibilité de l'ADN. Des complexes spécialisés sont capables de remodeler cette structure. Chez Saccharomyces cerevisiae, les complexes RSC (Remodels the Structure of Chromatin) et SWI/SNF sont apparentés comme en témoignent les homologies existant entre plusieurs de leurs sous-unités. Toutefois, seul le complexe RSC, plus abondant que SWI/SNF, est essentiel à la viabilité cellulaire. Ceci suggère qu'il pourrait avoir de multiples rôles dont un dans la transcription. <br />La transcription est réalisée chez les eucaryotes par trois ARN polymérases (pol) différentes chacune spécifique d'une classe de gènes. Nous avons montré que le complexe RSC interagit avec les ARN polymérases I et III. Notre attention s'est portée sur l'interaction entre la sous-unité Rsc4 et la protéine ABC27, commune aux trois ARN polymérases. La protéine Rsc4 interagit en double-hybride avec ABC27 par son domaine C-terminal. Nous avons étudié un mutant de la sous-unité Rsc4 ayant perdu la capacité d'interagir avec ABC27. Les profils d'expression génomiques, établis par puces à ADN, ont permis de caractériser des effets de cette mutation sur la transcription par l'ARN polymérase II. Curieusement, la majorité des gènes induits sont répartis par le chromosome XII. Cet effet n'est pas polaire. La présence de l'ADN ribosomique sur ce chromosome nous a conduits à proposer qu'il pourrait être une cause de ce comportement particulier. Nous avons mis en évidence des modifications dans la voie de maturation de l'ARN 35S, transcrit par la pol I, mais nous n'avons pas pu caractériser des défauts de transcription par les ARN polymérases I et III.